Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54,5■■■■■ 6,31
Plekhg1F6S200 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50,49■■■■■ 5,67
Plekhg1F6S200 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,65■■■■■ 5,54
Plekhg1F6S200 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47,52■■■■■ 5,2
Plekhg1F6S200 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47,4■■■■■ 5,18
Plekhg1F6S200 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46,54■■■■■ 5,04
Plekhg1F6S200 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,06■■■■■ 4,96
Plekhg1F6S200 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,03■■■■■ 4,96
Plekhg1F6S200 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45,66■■■■■ 4,9
Plekhg1F6S200 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,61■■■■■ 4,89
Plekhg1F6S200 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,49■■■■■ 4,87
Plekhg1F6S200 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,29■■■■■ 4,84
Plekhg1F6S200 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,97■■■■■ 4,79
Plekhg1F6S200 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,29■■■■■ 4,68
Plekhg1F6S200 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,18■■■■■ 4,66
Plekhg1F6S200 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44,1■■■■■ 4,65
Plekhg1F6S200 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43,82■■■■■ 4,6
Plekhg1F6S200 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,8■■■■■ 4,6
Plekhg1F6S200 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,65■■■■■ 4,58
Plekhg1F6S200 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,57■■■■■ 4,57
Plekhg1F6S200 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,53■■■■■ 4,56
Plekhg1F6S200 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,44■■■■■ 4,54
Plekhg1F6S200 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43,44■■■■■ 4,54
Plekhg1F6S200 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,26■■■■■ 4,52
Plekhg1F6S200 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,24■■■■■ 4,51
Plekhg1F6S200 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,22■■■■■ 4,51
Plekhg1F6S200 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43,05■■■■■ 4,48
Plekhg1F6S200 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43,03■■■■■ 4,48
Plekhg1F6S200 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,03■■■■■ 4,48
Plekhg1F6S200 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
Plekhg1F6S200 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,88■■■■■ 4,46
Plekhg1F6S200 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
Plekhg1F6S200 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42,74■■■■■ 4,43
Plekhg1F6S200 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,57■■■■■ 4,41
Plekhg1F6S200 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42,34■■■■■ 4,37
Plekhg1F6S200 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,23■■■■■ 4,35
Plekhg1F6S200 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,08■■■■■ 4,33
Plekhg1F6S200 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,95■■■■■ 4,31
Plekhg1F6S200 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,93■■■■■ 4,3
Plekhg1F6S200 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41,81■■■■■ 4,28
Plekhg1F6S200 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,81■■■■■ 4,28
Plekhg1F6S200 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,81■■■■■ 4,28
Plekhg1F6S200 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,78■■■■■ 4,28
Plekhg1F6S200 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41,76■■■■■ 4,27
Plekhg1F6S200 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41,61■■■■■ 4,25
Plekhg1F6S200 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
Plekhg1F6S200 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41,35■■■■■ 4,21
Plekhg1F6S200 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41,25■■■■■ 4,19
Plekhg1F6S200 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,17■■■■■ 4,18
Plekhg1F6S200 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41,03■■■■■ 4,16
Plekhg1F6S200 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
Plekhg1F6S200 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,96■■■■■ 4,15
Plekhg1F6S200 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Plekhg1F6S200 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,13
Plekhg1F6S200 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,82■■■■■ 4,12
Plekhg1F6S200 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40,8■■■■■ 4,12
Plekhg1F6S200 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,78■■■■■ 4,12
Plekhg1F6S200 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Plekhg1F6S200 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40,64■■■■■ 4,1
Plekhg1F6S200 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Plekhg1F6S200 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Plekhg1F6S200 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,55■■■■■ 4,08
Plekhg1F6S200 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40,52■■■■■ 4,08
Plekhg1F6S200 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Plekhg1F6S200 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40,45■■■■■ 4,07
Plekhg1F6S200 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Plekhg1F6S200 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40,38■■■■■ 4,05
Plekhg1F6S200 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40,34■■■■■ 4,05
Plekhg1F6S200 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,33■■■■■ 4,05
Plekhg1F6S200 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Plekhg1F6S200 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,27■■■■■ 4,04
Plekhg1F6S200 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,19■■■■■ 4,02
Plekhg1F6S200 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Plekhg1F6S200 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
Plekhg1F6S200 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
Plekhg1F6S200 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Plekhg1F6S200 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40,08■■■■■ 4,01
Plekhg1F6S200 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40,08■■■■■ 4,01
Plekhg1F6S200 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,08■■■■■ 4,01
Plekhg1F6S200 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Plekhg1F6S200 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,95■■■■□ 3,99
Plekhg1F6S200 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,92■■■■□ 3,98
Plekhg1F6S200 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39,86■■■■□ 3,97
Plekhg1F6S200 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,86■■■■□ 3,97
Plekhg1F6S200 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,97
Plekhg1F6S200 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,97
Plekhg1F6S200 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,81■■■■□ 3,96
Plekhg1F6S200 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
Plekhg1F6S200 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
Plekhg1F6S200 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
Plekhg1F6S200 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,67■■■■□ 3,94
Plekhg1F6S200 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Plekhg1F6S200 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,58■■■■□ 3,93
Plekhg1F6S200 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39,56■■■■□ 3,92
Plekhg1F6S200 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39,53■■■■□ 3,92
Plekhg1F6S200 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
Plekhg1F6S200 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39,49■■■■□ 3,91
Plekhg1F6S200 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Plekhg1F6S200 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Plekhg1F6S200 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,45■■■■□ 3,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms