Protein–RNA interactions for Protein: O70576

Stag3, Cohesin subunit SA-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag3O70576 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54,19■■■■■ 6,27
Stag3O70576 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50,17■■■■■ 5,62
Stag3O70576 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,45■■■■■ 5,51
Stag3O70576 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47,23■■■■■ 5,15
Stag3O70576 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47■■■■■ 5,11
Stag3O70576 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46,19■■■■■ 4,98
Stag3O70576 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,96■■■■■ 4,95
Stag3O70576 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,88■■■■■ 4,94
Stag3O70576 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,75■■■■■ 4,91
Stag3O70576 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45,5■■■■■ 4,87
Stag3O70576 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,24■■■■■ 4,83
Stag3O70576 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,22■■■■■ 4,83
Stag3O70576 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,99■■■■■ 4,79
Stag3O70576 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,5■■■■■ 4,71
Stag3O70576 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,11■■■■■ 4,65
Stag3O70576 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43,9■■■■■ 4,62
Stag3O70576 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,66■■■■■ 4,58
Stag3O70576 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,63■■■■■ 4,58
Stag3O70576 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43,58■■■■■ 4,57
Stag3O70576 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,51■■■■■ 4,56
Stag3O70576 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43,48■■■■■ 4,55
Stag3O70576 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,4■■■■■ 4,54
Stag3O70576 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,29■■■■■ 4,52
Stag3O70576 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,22■■■■■ 4,51
Stag3O70576 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4,47
Stag3O70576 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,96■■■■■ 4,47
Stag3O70576 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Stag3O70576 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,9■■■■■ 4,46
Stag3O70576 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,9■■■■■ 4,46
Stag3O70576 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42,83■■■■■ 4,45
Stag3O70576 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Stag3O70576 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42,77■■■■■ 4,44
Stag3O70576 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,64■■■■■ 4,42
Stag3O70576 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42,58■■■■■ 4,41
Stag3O70576 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
Stag3O70576 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42,2■■■■■ 4,35
Stag3O70576 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,18■■■■■ 4,34
Stag3O70576 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41,92■■■■■ 4,3
Stag3O70576 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41,76■■■■■ 4,28
Stag3O70576 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,74■■■■■ 4,27
Stag3O70576 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,68■■■■■ 4,26
Stag3O70576 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,67■■■■■ 4,26
Stag3O70576 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,43■■■■■ 4,22
Stag3O70576 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,42■■■■■ 4,22
Stag3O70576 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41,39■■■■■ 4,22
Stag3O70576 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
Stag3O70576 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,3■■■■■ 4,2
Stag3O70576 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Stag3O70576 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41,2■■■■■ 4,19
Stag3O70576 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,11■■■■■ 4,17
Stag3O70576 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41,05■■■■■ 4,16
Stag3O70576 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40,97■■■■■ 4,15
Stag3O70576 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Stag3O70576 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Stag3O70576 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40,74■■■■■ 4,11
Stag3O70576 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40,74■■■■■ 4,11
Stag3O70576 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
Stag3O70576 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,69■■■■■ 4,1
Stag3O70576 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Stag3O70576 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,59■■■■■ 4,09
Stag3O70576 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,46■■■■■ 4,07
Stag3O70576 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,38■■■■■ 4,05
Stag3O70576 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,36■■■■■ 4,05
Stag3O70576 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Stag3O70576 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,31■■■■■ 4,04
Stag3O70576 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,26■■■■■ 4,04
Stag3O70576 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40,26■■■■■ 4,04
Stag3O70576 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40,25■■■■■ 4,03
Stag3O70576 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40,22■■■■■ 4,03
Stag3O70576 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40,18■■■■■ 4,02
Stag3O70576 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Stag3O70576 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40,16■■■■■ 4,02
Stag3O70576 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,06■■■■■ 4
Stag3O70576 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,06■■■■■ 4
Stag3O70576 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,01■■■■■ 4
Stag3O70576 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3,99
Stag3O70576 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Stag3O70576 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,97■■■■□ 3,99
Stag3O70576 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
Stag3O70576 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Stag3O70576 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
Stag3O70576 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39,85■■■■□ 3,97
Stag3O70576 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39,83■■■■□ 3,97
Stag3O70576 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,83■■■■□ 3,97
Stag3O70576 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
Stag3O70576 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Stag3O70576 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,96
Stag3O70576 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
Stag3O70576 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39,7■■■■□ 3,95
Stag3O70576 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,69■■■■□ 3,94
Stag3O70576 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39,67■■■■□ 3,94
Stag3O70576 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,67■■■■□ 3,94
Stag3O70576 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,64■■■■□ 3,94
Stag3O70576 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Stag3O70576 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Stag3O70576 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39,44■■■■□ 3,9
Stag3O70576 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39,43■■■■□ 3,9
Stag3O70576 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC39,41■■■■□ 3,9
Stag3O70576 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,41■■■■□ 3,9
Stag3O70576 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39,38■■■■□ 3,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,6 ms