Protein–RNA interactions for Protein: O35601

Fyb1, FYN-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyb1O35601 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53.66■■■■■ 6.18
Fyb1O35601 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
Fyb1O35601 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Fyb1O35601 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46.69■■■■■ 5.06
Fyb1O35601 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
Fyb1O35601 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
Fyb1O35601 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Fyb1O35601 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Fyb1O35601 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Fyb1O35601 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
Fyb1O35601 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Fyb1O35601 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
Fyb1O35601 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
Fyb1O35601 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Fyb1O35601 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Fyb1O35601 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Fyb1O35601 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
Fyb1O35601 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Fyb1O35601 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43■■■■■ 4.47
Fyb1O35601 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Fyb1O35601 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Fyb1O35601 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Fyb1O35601 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Fyb1O35601 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
Fyb1O35601 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Fyb1O35601 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Fyb1O35601 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Fyb1O35601 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
Fyb1O35601 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Fyb1O35601 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Fyb1O35601 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Fyb1O35601 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Fyb1O35601 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Fyb1O35601 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Fyb1O35601 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Fyb1O35601 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Fyb1O35601 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Fyb1O35601 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Fyb1O35601 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Fyb1O35601 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
Fyb1O35601 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Fyb1O35601 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Fyb1O35601 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Fyb1O35601 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Fyb1O35601 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Fyb1O35601 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Fyb1O35601 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
Fyb1O35601 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Fyb1O35601 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Fyb1O35601 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Fyb1O35601 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Fyb1O35601 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Fyb1O35601 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Fyb1O35601 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
Fyb1O35601 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Fyb1O35601 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Fyb1O35601 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Fyb1O35601 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
Fyb1O35601 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Fyb1O35601 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
Fyb1O35601 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Fyb1O35601 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Fyb1O35601 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Fyb1O35601 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Fyb1O35601 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Fyb1O35601 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Fyb1O35601 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Fyb1O35601 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Fyb1O35601 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Fyb1O35601 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Fyb1O35601 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Fyb1O35601 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Fyb1O35601 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Fyb1O35601 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Fyb1O35601 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Fyb1O35601 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Fyb1O35601 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Fyb1O35601 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Fyb1O35601 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Fyb1O35601 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Fyb1O35601 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Fyb1O35601 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Fyb1O35601 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Fyb1O35601 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Fyb1O35601 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Fyb1O35601 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Fyb1O35601 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Fyb1O35601 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Fyb1O35601 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Fyb1O35601 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Fyb1O35601 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Fyb1O35601 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Fyb1O35601 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Fyb1O35601 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Fyb1O35601 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Fyb1O35601 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Fyb1O35601 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Fyb1O35601 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Fyb1O35601 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Fyb1O35601 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms