RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000154553.1

Sft2d1-210, Transcript of Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sft2d1, Length 1,049 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa51.42■■■■■ 5.82
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NischQ80TM9 1593 aa50.56■■■■■ 5.68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Abcc8B2RUS7 1588 aa49.06■■■■■ 5.44
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Abcc9P70170 1546 aa48.88■■■■■ 5.42
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 ScribQ80U72 1612 aa47.57■■■■■ 5.21
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NacadQ5SWP3 1504 aa46■■■■■ 4.95
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kdm5dQ62240 1548 aa45.88■■■■■ 4.94
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sycp2Q9CUU3 1500 aa45.14■■■■■ 4.82
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dcaf1Q80TR8 1506 aa44.98■■■■■ 4.79
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 BicraF8VPZ9 1578 aa44.6■■■■■ 4.73
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa44.15■■■■■ 4.66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa44.01■■■■■ 4.64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Baz1aO88379 1555 aa43.37■■■■■ 4.53
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Crybg2B7ZCC2 1516 aa43.3■■■■■ 4.52
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc180J3QNE4 1664 aa43.21■■■■■ 4.51
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rhox8Q6VSS7 320 aa43.21■■■■■ 4.51
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa42.52■■■■■ 4.4
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ercc6F8VPZ5 1481 aa42.46■■■■■ 4.39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Smarca2Q6DIC0 1577 aa42.39■■■■■ 4.38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa42.21■■■■■ 4.35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa42.18■■■■■ 4.34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fam135aQ6NS59 1506 aa42.16■■■■■ 4.34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Wdr62Q3U3T8 1523 aa41.94■■■■■ 4.3
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Frmpd1A2AKB4 1549 aa41.91■■■■■ 4.3
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Baz1bQ9Z277 1479 aa41.63■■■■■ 4.25
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ubl4bQ9CQ84 188 aa41.43■■■■■ 4.22
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Unc13aQ4KUS2 1712 aa41.24■■■■■ 4.19
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mrc2Q64449 1479 aa41.17■■■■■ 4.18
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 CftrP26361 1476 aa41.11■■■■■ 4.17
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa41.01■■■■■ 4.16
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Synj1Q8CHC4 1574 aa40.95■■■■■ 4.15
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rtl1Q7M732 1744 aa40.83■■■■■ 4.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa40.58■■■■■ 4.09
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dnajc5P60904 198 aa40.37■■■■■ 4.05
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cux2P70298 1426 aa40.33■■■■■ 4.05
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Trim41Q5NCC3 630 aa40.31■■■■■ 4.04
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa40.29■■■■■ 4.04
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kif15Q6P9L6 1387 aa40.24■■■■■ 4.03
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kif21aQ9QXL2 1672 aa40.08■■■■■ 4.01
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lamc3Q9R0B6 1581 aa39.99■■■■□ 3.99
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cep164Q5DU05 1446 aa39.67■■■■□ 3.94
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Shroom2A2ALU4 1481 aa39.52■■■■□ 3.92
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Plb1Q3TTY0 1478 aa39.42■■■■□ 3.9
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 TnnQ80Z71 1560 aa39.4■■■■□ 3.9
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc18Q640L5 1455 aa39.37■■■■□ 3.89
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Il27Q8K3I6 234 aa39.35■■■■□ 3.89
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Top2bQ64511 1612 aa39.25■■■■□ 3.87
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Golga3P55937 1487 aa39.24■■■■□ 3.87
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Camsap1A2AHC3 1581 aa39.21■■■■□ 3.87
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Crocc2F6XLV1 1638 aa39.2■■■■□ 3.87
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Col17a1Q07563 1470 aa39.09■■■■□ 3.85
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cngb1E1AZ71 1325 aa39.07■■■■□ 3.84
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ift140E9PY46 1464 aa39.01■■■■□ 3.84
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rusc2Q80U22 1514 aa38.95■■■■□ 3.83
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fmn1Q05860 1466 aa38.89■■■■□ 3.82
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Duox2A2AQ99 1517 aa38.84■■■■□ 3.81
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Disp1Q3TDN0 1521 aa38.71■■■■□ 3.79
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Grin2bQ01097 1482 aa38.66■■■■□ 3.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Samd9lQ69Z37 1561 aa38.51■■■■□ 3.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa38.48■■■■□ 3.75
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Efcab5A0JP43 1406 aa38.45■■■■□ 3.75
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Setd1bQ8CFT2 1985 aa38.44■■■■□ 3.74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rad54l2Q99NG0 1466 aa38.29■■■■□ 3.72
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Grin2aP35436 1464 aa38.21■■■■□ 3.71
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Magi3Q9EQJ9 1476 aa38.2■■■■□ 3.71
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fgd6Q69ZL1 1399 aa38.16■■■■□ 3.7
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa38.11■■■■□ 3.69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NrkQ9R0G8 1455 aa38.11■■■■□ 3.69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Adgrl3Q80TS3 1537 aa38.11■■■■□ 3.69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 PtprkP35822 1457 aa38.06■■■■□ 3.68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa38■■■■□ 3.67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cep170Q6A065 1588 aa38■■■■□ 3.67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm156Q58A37 223 aa37.96■■■■□ 3.67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa37.95■■■■□ 3.67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pla2r1Q62028 1487 aa37.92■■■■□ 3.66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa37.91■■■■□ 3.66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Shroom4Q1W617 1475 aa37.9■■■■□ 3.66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gpatch8A2A6A1 1505 aa37.9■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 102.7 ms