RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000154553.1

Sft2d1-210, Transcript of Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sft2d1, Length 1,049 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa51,42■■■■■ 5,82
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NischQ80TM9 1593 aa50,56■■■■■ 5,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Abcc8B2RUS7 1588 aa49,06■■■■■ 5,44
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Abcc9P70170 1546 aa48,88■■■■■ 5,42
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 ScribQ80U72 1612 aa47,57■■■■■ 5,21
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NacadQ5SWP3 1504 aa46■■■■■ 4,95
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kdm5dQ62240 1548 aa45,88■■■■■ 4,94
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sycp2Q9CUU3 1500 aa45,14■■■■■ 4,82
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dcaf1Q80TR8 1506 aa44,98■■■■■ 4,79
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 BicraF8VPZ9 1578 aa44,6■■■■■ 4,73
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa44,15■■■■■ 4,66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa44,01■■■■■ 4,64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP43,43■■■■■ 4,54
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Baz1aO88379 1555 aa43,37■■■■■ 4,53
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Crybg2B7ZCC2 1516 aa43,3■■■■■ 4,52
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP43,24■■■■■ 4,51
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc180J3QNE4 1664 aa43,21■■■■■ 4,51
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rhox8Q6VSS7 320 aa43,21■■■■■ 4,51
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP42,94■■■■■ 4,46
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP42,82■■■■■ 4,45
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa42,52■■■■■ 4,4
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ercc6F8VPZ5 1481 aa42,46■■■■■ 4,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Smarca2Q6DIC0 1577 aa42,39■■■■■ 4,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP42,36■■■■■ 4,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa42,21■■■■■ 4,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa42,18■■■■■ 4,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fam135aQ6NS59 1506 aa42,16■■■■■ 4,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Wdr62Q3U3T8 1523 aa41,94■■■■■ 4,3
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Frmpd1A2AKB4 1549 aa41,91■■■■■ 4,3
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP41,78■■■■■ 4,28
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Baz1bQ9Z277 1479 aa41,63■■■■■ 4,25
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ubl4bQ9CQ84 188 aa41,43■■■■■ 4,22
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Unc13aQ4KUS2 1712 aa41,24■■■■■ 4,19
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mrc2Q64449 1479 aa41,17■■■■■ 4,18
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 CftrP26361 1476 aa41,11■■■■■ 4,17
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa41,01■■■■■ 4,16
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Synj1Q8CHC4 1574 aa40,95■■■■■ 4,15
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rtl1Q7M732 1744 aa40,83■■■■■ 4,13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP40,83■■■■■ 4,13
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa40,58■■■■■ 4,09
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dnajc5P60904 198 aa40,37■■■■■ 4,05
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cux2P70298 1426 aa40,33■■■■■ 4,05
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP40,31■■■■■ 4,04
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Trim41Q5NCC3 630 aa40,31■■■■■ 4,04
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa40,29■■■■■ 4,04
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40,26■■■■■ 4,04
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kif15Q6P9L6 1387 aa40,24■■■■■ 4,03
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kif21aQ9QXL2 1672 aa40,08■■■■■ 4,01
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lamc3Q9R0B6 1581 aa39,99■■■■□ 3,99
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP39,85■■■■□ 3,97
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP39,7■■■■□ 3,95
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cep164Q5DU05 1446 aa39,67■■■■□ 3,94
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Shroom2A2ALU4 1481 aa39,52■■■■□ 3,92
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP39,49■■■■□ 3,91
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP39,46■■■■□ 3,91
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Plb1Q3TTY0 1478 aa39,42■■■■□ 3,9
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 TnnQ80Z71 1560 aa39,4■■■■□ 3,9
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc18Q640L5 1455 aa39,37■■■■□ 3,89
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Il27Q8K3I6 234 aa39,35■■■■□ 3,89
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP39,31■■■■□ 3,88
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Top2bQ64511 1612 aa39,25■■■■□ 3,87
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Golga3P55937 1487 aa39,24■■■■□ 3,87
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Camsap1A2AHC3 1581 aa39,21■■■■□ 3,87
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Crocc2F6XLV1 1638 aa39,2■■■■□ 3,87
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Col17a1Q07563 1470 aa39,09■■■■□ 3,85
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cngb1E1AZ71 1325 aa39,07■■■■□ 3,84
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP39,04■■■■□ 3,84
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP39,04■■■■□ 3,84
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ift140E9PY46 1464 aa39,01■■■■□ 3,84
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rusc2Q80U22 1514 aa38,95■■■■□ 3,83
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fmn1Q05860 1466 aa38,89■■■■□ 3,82
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Duox2A2AQ99 1517 aa38,84■■■■□ 3,81
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP38,73■■■■□ 3,79
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Disp1Q3TDN0 1521 aa38,71■■■■□ 3,79
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Grin2bQ01097 1482 aa38,66■■■■□ 3,78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP38,54■■■■□ 3,76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP38,54■■■■□ 3,76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Samd9lQ69Z37 1561 aa38,51■■■■□ 3,76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa38,48■■■■□ 3,75
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Efcab5A0JP43 1406 aa38,45■■■■□ 3,75
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Setd1bQ8CFT2 1985 aa38,44■■■■□ 3,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP38,43■■■■□ 3,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rad54l2Q99NG0 1466 aa38,29■■■■□ 3,72
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Grin2aP35436 1464 aa38,21■■■■□ 3,71
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Magi3Q9EQJ9 1476 aa38,2■■■■□ 3,71
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP38,19■■■■□ 3,7
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fgd6Q69ZL1 1399 aa38,16■■■■□ 3,7
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa38,11■■■■□ 3,69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NrkQ9R0G8 1455 aa38,11■■■■□ 3,69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Adgrl3Q80TS3 1537 aa38,11■■■■□ 3,69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 PtprkP35822 1457 aa38,06■■■■□ 3,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP38,04■■■■□ 3,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa38■■■■□ 3,67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cep170Q6A065 1588 aa38■■■■□ 3,67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm156Q58A37 223 aa37,96■■■■□ 3,67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa37,95■■■■□ 3,67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pla2r1Q62028 1487 aa37,92■■■■□ 3,66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa37,91■■■■□ 3,66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Shroom4Q1W617 1475 aa37,9■■■■□ 3,66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gpatch8A2A6A1 1505 aa37,9■■■■□ 3,66
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