RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm10563F6WIE4 79 aa28.27■■■□□ 2.12
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ttll13A4Q9F6 804 aa28.25■■■□□ 2.11
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mug2P28666 1451 aa28.24■■■□□ 2.11
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa28.23■■■□□ 2.11
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Abca14E9Q8F8 1683 aa28.22■■■□□ 2.11
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp40Q8BWR4 1235 aa28.21■■■□□ 2.11
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 IqubQ8CDK3 788 aa28.21■■■□□ 2.11
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa28.2■■■□□ 2.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 C5P06684 1680 aa28.19■■■□□ 2.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 KdrP35918 1367 aa28.17■■■□□ 2.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stag3O70576 1240 aa28.17■■■□□ 2.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Als2Q920R0 1651 aa28.16■■■□□ 2.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nphp4P59240 1425 aa28.15■■■□□ 2.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa28.15■■■□□ 2.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mink1Q9JM52 1308 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wnk3Q80XP9 1757 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DccP70211 1447 aa28.08■■■□□ 2.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Qtrt2B8ZXI1 415 aa28.08■■■□□ 2.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kif24Q6NWW5 1356 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcna6Q61923 529 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GnpatP98192 678 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nyap1Q6PFX7 833 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Idi1P58044 227 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Farp2Q91VS8 1065 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stard8Q8K031 1019 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp142G5E869 1843 aa28.01■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem2Q5FWI3 1383 aa28.01■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sox12Q04890 314 aa28.01■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Abcc10Q8R4P9 1501 aa28■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Srcin1Q9QWI6 1250 aa28■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Camta1A2A891 1682 aa28■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NktrP30415 1453 aa27.99■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zbtb4Q5F293 982 aa27.99■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rundc1Q0VDN7 615 aa27.98■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GapdhsQ64467 440 aa27.95■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf526Q8BI66 675 aa27.95■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kif1aP33173 1695 aa27.95■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cdk19Q8BWD8 501 aa27.94■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CenpjQ569L8 1344 aa27.93■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Card11Q8CIS0 1159 aa27.93■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sirt1Q923E4 737 aa27.91■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa27.91■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NgefQ8CHT1 710 aa27.9■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa27.9■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cypt2Q6P924 180 aa27.89■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf316Q6PGE4 1016 aa27.89■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa27.89■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TonslQ6NZL6 1363 aa27.89■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sema6bO54951 886 aa27.89■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pola1P33609 1465 aa27.88■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rock2P70336 1388 aa27.88■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ap3b2Q9JME5 1082 aa27.88■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cntnap1O54991 1385 aa27.87■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slit2Q9R1B9 1521 aa27.86■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zranb1Q7M760 708 aa27.86■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mon2Q80TL7 1715 aa27.84■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NefmP08553 848 aa27.83■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adgrl1Q80TR1 1466 aa27.83■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fbln2P37889 1221 aa27.83■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wdr17E9Q271 1322 aa27.82■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa27.82■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gsto1O09131 240 aa27.81■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp7bQ64446 1462 aa27.8■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PtprvP70289 1705 aa27.8■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ggt6Q6PDE7 497 aa27.78■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa27.78■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Siglec1Q62230 1695 aa27.78■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lrp6O88572 1613 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PtpruB1AUH1 1446 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nrxn1Q9CS84 1514 aa27.76■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smim5Q8BT42 78 aa27.76■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam135bQ9DAI6 1403 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 InsrP15208 1372 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MypopQ8R4U1 393 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc35g1Q8BY79 368 aa27.74■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp10bB1AWN4 1474 aa27.74■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 FanciQ8K368 1330 aa27.72■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Idi2Q8BFZ6 227 aa27.7■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Map3k19E9Q3S4 1311 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Abca15E9PWH4 1668 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fyb1O35601 819 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cadps2Q8BYR5 1297 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acsbg1Q99PU5 721 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CatipB9EKE5 520 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tex14Q7M6U3 1450 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dixdc1Q80Y83 711 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sbno1Q689Z5 1390 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cnga1P29974 684 aa27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 451.9 ms