Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55,05■■■■■ 6,4
Slit2Q9R1B9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51,62■■■■■ 5,85
Slit2Q9R1B9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,49■■■■■ 5,67
Slit2Q9R1B9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48,47■■■■■ 5,35
Slit2Q9R1B9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,89■■■■■ 5,1
Slit2Q9R1B9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,6■■■■■ 5,05
Slit2Q9R1B9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,58■■■■■ 5,05
Slit2Q9R1B9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46,55■■■■■ 5,04
Slit2Q9R1B9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,88■■■■■ 4,94
Slit2Q9R1B9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,77■■■■■ 4,92
Slit2Q9R1B9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,75■■■■■ 4,91
Slit2Q9R1B9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45,57■■■■■ 4,89
Slit2Q9R1B9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,31■■■■■ 4,84
Slit2Q9R1B9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,26■■■■■ 4,84
Slit2Q9R1B9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45,21■■■■■ 4,83
Slit2Q9R1B9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44,96■■■■■ 4,79
Slit2Q9R1B9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,09■■■■■ 4,65
Slit2Q9R1B9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43,97■■■■■ 4,63
Slit2Q9R1B9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43,85■■■■■ 4,61
Slit2Q9R1B9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,81■■■■■ 4,6
Slit2Q9R1B9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,79■■■■■ 4,6
Slit2Q9R1B9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,74■■■■■ 4,59
Slit2Q9R1B9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,36■■■■■ 4,53
Slit2Q9R1B9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43,03■■■■■ 4,48
Slit2Q9R1B9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43,02■■■■■ 4,48
Slit2Q9R1B9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,92■■■■■ 4,46
Slit2Q9R1B9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,84■■■■■ 4,45
Slit2Q9R1B9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42,57■■■■■ 4,41
Slit2Q9R1B9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42,47■■■■■ 4,39
Slit2Q9R1B9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,33■■■■■ 4,37
Slit2Q9R1B9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42,25■■■■■ 4,35
Slit2Q9R1B9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42,2■■■■■ 4,35
Slit2Q9R1B9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42,13■■■■■ 4,33
Slit2Q9R1B9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42,07■■■■■ 4,33
Slit2Q9R1B9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,91■■■■■ 4,3
Slit2Q9R1B9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,88■■■■■ 4,3
Slit2Q9R1B9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41,78■■■■■ 4,28
Slit2Q9R1B9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,74■■■■■ 4,27
Slit2Q9R1B9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41,66■■■■■ 4,26
Slit2Q9R1B9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41,46■■■■■ 4,23
Slit2Q9R1B9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
Slit2Q9R1B9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,21
Slit2Q9R1B9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,37■■■■■ 4,21
Slit2Q9R1B9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
Slit2Q9R1B9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,24■■■■■ 4,19
Slit2Q9R1B9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,13■■■■■ 4,17
Slit2Q9R1B9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Slit2Q9R1B9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC41,08■■■■■ 4,17
Slit2Q9R1B9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,94■■■■■ 4,14
Slit2Q9R1B9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,93■■■■■ 4,14
Slit2Q9R1B9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Slit2Q9R1B9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40,8■■■■■ 4,12
Slit2Q9R1B9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Slit2Q9R1B9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
Slit2Q9R1B9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
Slit2Q9R1B9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,53■■■■■ 4,08
Slit2Q9R1B9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Slit2Q9R1B9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40,52■■■■■ 4,08
Slit2Q9R1B9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40,49■■■■■ 4,07
Slit2Q9R1B9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,35■■■■■ 4,05
Slit2Q9R1B9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,27■■■■■ 4,04
Slit2Q9R1B9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40,25■■■■■ 4,03
Slit2Q9R1B9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Slit2Q9R1B9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40,14■■■■■ 4,02
Slit2Q9R1B9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,06■■■■■ 4
Slit2Q9R1B9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,05■■■■■ 4
Slit2Q9R1B9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
Slit2Q9R1B9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Slit2Q9R1B9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,95■■■■□ 3,99
Slit2Q9R1B9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Slit2Q9R1B9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
Slit2Q9R1B9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39,86■■■■□ 3,97
Slit2Q9R1B9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,97
Slit2Q9R1B9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39,77■■■■□ 3,96
Slit2Q9R1B9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39,75■■■■□ 3,95
Slit2Q9R1B9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
Slit2Q9R1B9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39,65■■■■□ 3,94
Slit2Q9R1B9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Slit2Q9R1B9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Slit2Q9R1B9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,56■■■■□ 3,92
Slit2Q9R1B9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
Slit2Q9R1B9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
Slit2Q9R1B9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Slit2Q9R1B9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,34■■■■□ 3,89
Slit2Q9R1B9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Slit2Q9R1B9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Slit2Q9R1B9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,25■■■■□ 3,87
Slit2Q9R1B9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Slit2Q9R1B9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39,19■■■■□ 3,86
Slit2Q9R1B9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Slit2Q9R1B9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
Slit2Q9R1B9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,12■■■■□ 3,85
Slit2Q9R1B9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39,1■■■■□ 3,85
Slit2Q9R1B9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
Slit2Q9R1B9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
Slit2Q9R1B9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39,05■■■■□ 3,84
Slit2Q9R1B9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,05■■■■□ 3,84
Slit2Q9R1B9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Slit2Q9R1B9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Slit2Q9R1B9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms