Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.85■■■■■ 6.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC52.55■■■■■ 6
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.91■■■■■ 5.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.88■■■■■ 5.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.35■■■■■ 5.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC51.02■■■■■ 5.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC47.87■■■■■ 5.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
Rpgrip1Q9EPQ2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC46.57■■■■■ 5.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.44■■■■■ 5.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
Rpgrip1Q9EPQ2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Rpgrip1Q9EPQ2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Rpgrip1Q9EPQ2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC44■■■■■ 4.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Rpgrip1Q9EPQ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.7■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms