Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55,26■■■■■ 6,44
Slc5a4bQ91ZP4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51,6■■■■■ 5,85
Slc5a4bQ91ZP4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,8■■■■■ 5,72
Slc5a4bQ91ZP4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48,47■■■■■ 5,35
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47,24■■■■■ 5,15
Slc5a4bQ91ZP4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46,9■■■■■ 5,1
Slc5a4bQ91ZP4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,74■■■■■ 5,07
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,32■■■■■ 5,01
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,23■■■■■ 4,99
Slc5a4bQ91ZP4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46,03■■■■■ 4,96
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,97■■■■■ 4,95
Slc5a4bQ91ZP4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45,56■■■■■ 4,88
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45,2■■■■■ 4,83
Slc5a4bQ91ZP4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,16■■■■■ 4,82
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,16■■■■■ 4,82
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44,93■■■■■ 4,78
Slc5a4bQ91ZP4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,23■■■■■ 4,67
Slc5a4bQ91ZP4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,17■■■■■ 4,66
Slc5a4bQ91ZP4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44,13■■■■■ 4,66
Slc5a4bQ91ZP4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43,95■■■■■ 4,63
Slc5a4bQ91ZP4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,93■■■■■ 4,62
Slc5a4bQ91ZP4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,9■■■■■ 4,62
Slc5a4bQ91ZP4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43,06■■■■■ 4,48
Slc5a4bQ91ZP4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43,03■■■■■ 4,48
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,89■■■■■ 4,46
Slc5a4bQ91ZP4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42,71■■■■■ 4,43
Slc5a4bQ91ZP4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42,43■■■■■ 4,38
Slc5a4bQ91ZP4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42,33■■■■■ 4,37
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,21■■■■■ 4,35
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42,18■■■■■ 4,34
Slc5a4bQ91ZP4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42,15■■■■■ 4,34
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42,1■■■■■ 4,33
Slc5a4bQ91ZP4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42,06■■■■■ 4,32
Slc5a4bQ91ZP4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41,83■■■■■ 4,29
Slc5a4bQ91ZP4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,78■■■■■ 4,28
Slc5a4bQ91ZP4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
Slc5a4bQ91ZP4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41,72■■■■■ 4,27
Slc5a4bQ91ZP4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,71■■■■■ 4,27
Slc5a4bQ91ZP4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,7■■■■■ 4,27
Slc5a4bQ91ZP4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,69■■■■■ 4,26
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41,67■■■■■ 4,26
Slc5a4bQ91ZP4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
Slc5a4bQ91ZP4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Slc5a4bQ91ZP4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41,22■■■■■ 4,19
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41,2■■■■■ 4,19
Slc5a4bQ91ZP4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41,18■■■■■ 4,18
Slc5a4bQ91ZP4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,18■■■■■ 4,18
Slc5a4bQ91ZP4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,17■■■■■ 4,18
Slc5a4bQ91ZP4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
Slc5a4bQ91ZP4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
Slc5a4bQ91ZP4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40,82■■■■■ 4,13
Slc5a4bQ91ZP4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Slc5a4bQ91ZP4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,67■■■■■ 4,1
Slc5a4bQ91ZP4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40,64■■■■■ 4,1
Slc5a4bQ91ZP4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40,57■■■■■ 4,09
Slc5a4bQ91ZP4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40,55■■■■■ 4,08
Slc5a4bQ91ZP4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Slc5a4bQ91ZP4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,46■■■■■ 4,07
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Slc5a4bQ91ZP4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Slc5a4bQ91ZP4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Slc5a4bQ91ZP4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
Slc5a4bQ91ZP4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Slc5a4bQ91ZP4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40,2■■■■■ 4,03
Slc5a4bQ91ZP4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,96■■■■□ 3,99
Slc5a4bQ91ZP4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,88■■■■□ 3,98
Slc5a4bQ91ZP4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
Slc5a4bQ91ZP4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39,68■■■■□ 3,94
Slc5a4bQ91ZP4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,59■■■■□ 3,93
Slc5a4bQ91ZP4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39,59■■■■□ 3,93
Slc5a4bQ91ZP4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,58■■■■□ 3,93
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39,54■■■■□ 3,92
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39,54■■■■□ 3,92
Slc5a4bQ91ZP4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,47■■■■□ 3,91
Slc5a4bQ91ZP4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39,43■■■■□ 3,9
Slc5a4bQ91ZP4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Slc5a4bQ91ZP4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Slc5a4bQ91ZP4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,41■■■■□ 3,9
Slc5a4bQ91ZP4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Slc5a4bQ91ZP4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Slc5a4bQ91ZP4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Slc5a4bQ91ZP4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Slc5a4bQ91ZP4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Slc5a4bQ91ZP4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Slc5a4bQ91ZP4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39,27■■■■□ 3,88
Slc5a4bQ91ZP4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,27■■■■□ 3,88
Slc5a4bQ91ZP4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39,19■■■■□ 3,86
Slc5a4bQ91ZP4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,85
Slc5a4bQ91ZP4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Slc5a4bQ91ZP4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,07■■■■□ 3,85
Slc5a4bQ91ZP4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Slc5a4bQ91ZP4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6,6 ms