Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54,94■■■■■ 6,39
Sema6bO54951 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51,36■■■■■ 5,81
Sema6bO54951 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,42■■■■■ 5,66
Sema6bO54951 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48,23■■■■■ 5,31
Sema6bO54951 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,85■■■■■ 5,09
Sema6bO54951 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,46■■■■■ 5,03
Sema6bO54951 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46,41■■■■■ 5,02
Sema6bO54951 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,26■■■■■ 5
Sema6bO54951 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,87■■■■■ 4,93
Sema6bO54951 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,68■■■■■ 4,9
Sema6bO54951 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,67■■■■■ 4,9
Sema6bO54951 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45,38■■■■■ 4,86
Sema6bO54951 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,01■■■■■ 4,8
Sema6bO54951 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44,97■■■■■ 4,79
Sema6bO54951 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,97■■■■■ 4,79
Sema6bO54951 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44,8■■■■■ 4,76
Sema6bO54951 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,96■■■■■ 4,63
Sema6bO54951 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,87■■■■■ 4,61
Sema6bO54951 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43,78■■■■■ 4,6
Sema6bO54951 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43,77■■■■■ 4,6
Sema6bO54951 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,64■■■■■ 4,58
Sema6bO54951 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,49■■■■■ 4,55
Sema6bO54951 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42,76■■■■■ 4,44
Sema6bO54951 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
Sema6bO54951 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,6■■■■■ 4,41
Sema6bO54951 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42,41■■■■■ 4,38
Sema6bO54951 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42,12■■■■■ 4,33
Sema6bO54951 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42,09■■■■■ 4,33
Sema6bO54951 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41,88■■■■■ 4,29
Sema6bO54951 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,86■■■■■ 4,29
Sema6bO54951 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41,84■■■■■ 4,29
Sema6bO54951 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41,82■■■■■ 4,29
Sema6bO54951 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,8■■■■■ 4,28
Sema6bO54951 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,69■■■■■ 4,27
Sema6bO54951 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41,51■■■■■ 4,24
Sema6bO54951 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Sema6bO54951 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41,46■■■■■ 4,23
Sema6bO54951 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,4■■■■■ 4,22
Sema6bO54951 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,28■■■■■ 4,2
Sema6bO54951 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,28■■■■■ 4,2
Sema6bO54951 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Sema6bO54951 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,21■■■■■ 4,19
Sema6bO54951 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Sema6bO54951 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,98■■■■■ 4,15
Sema6bO54951 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,89■■■■■ 4,14
Sema6bO54951 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40,86■■■■■ 4,13
Sema6bO54951 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,85■■■■■ 4,13
Sema6bO54951 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Sema6bO54951 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40,74■■■■■ 4,11
Sema6bO54951 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40,71■■■■■ 4,11
Sema6bO54951 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Sema6bO54951 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Sema6bO54951 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Sema6bO54951 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40,45■■■■■ 4,07
Sema6bO54951 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,39■■■■■ 4,06
Sema6bO54951 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40,33■■■■■ 4,05
Sema6bO54951 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40,32■■■■■ 4,05
Sema6bO54951 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,27■■■■■ 4,04
Sema6bO54951 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Sema6bO54951 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,09■■■■■ 4,01
Sema6bO54951 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,05■■■■■ 4
Sema6bO54951 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40,04■■■■■ 4
Sema6bO54951 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
Sema6bO54951 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
Sema6bO54951 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,97■■■■□ 3,99
Sema6bO54951 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Sema6bO54951 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,83■■■■□ 3,97
Sema6bO54951 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,75■■■■□ 3,95
Sema6bO54951 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,62■■■■□ 3,93
Sema6bO54951 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
Sema6bO54951 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39,5■■■■□ 3,91
Sema6bO54951 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,48■■■■□ 3,91
Sema6bO54951 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Sema6bO54951 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39,41■■■■□ 3,9
Sema6bO54951 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39,37■■■■□ 3,89
Sema6bO54951 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39,36■■■■□ 3,89
Sema6bO54951 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
Sema6bO54951 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Sema6bO54951 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,26■■■■□ 3,88
Sema6bO54951 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,23■■■■□ 3,87
Sema6bO54951 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Sema6bO54951 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39,18■■■■□ 3,86
Sema6bO54951 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,85
Sema6bO54951 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
Sema6bO54951 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
Sema6bO54951 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Sema6bO54951 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Sema6bO54951 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Sema6bO54951 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Sema6bO54951 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38,99■■■■□ 3,83
Sema6bO54951 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
Sema6bO54951 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,96■■■■□ 3,83
Sema6bO54951 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,91■■■■□ 3,82
Sema6bO54951 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
Sema6bO54951 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38,84■■■■□ 3,81
Sema6bO54951 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38,79■■■■□ 3,8
Sema6bO54951 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38,76■■■■□ 3,8
Sema6bO54951 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Sema6bO54951 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Sema6bO54951 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,72■■■■□ 3,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,6 ms