Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC52.77■■■■■ 6.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
Ppargc1bQ8VHJ7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.49■■■■■ 5.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45.64■■■■■ 4.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Ppargc1bQ8VHJ7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Ppargc1bQ8VHJ7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.73■■■■■ 4.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Ppargc1bQ8VHJ7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms