RNA–Protein interactions for RNA: YMR306W

FKS3, Transcript of Protein involved in spore wall assembly, yeast

Gene FKS3, Length 5,358 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FKS3	YMR306W	LYS2	P07702	1392 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	SRC1	Q03707	834 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	GLC3	P32775	704 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	DPH6	Q12429	685 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	RIM15	P43565	1770 aa		3.16	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	CST6	P40535	587 aa		3.16	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	RRI2	Q12348	645 aa		3.16	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	MRP7	P12687	371 aa		3.16	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	PSH1	Q12161	406 aa		3.16	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		3.16	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		3.16	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	YRF1-6	P53819	1859 aa		3.16	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	JJJ2	P46997	583 aa		3.15	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	KIN4	Q01919	800 aa		3.15	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	YOL057W	Q08225	711 aa		3.15	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	FET4	P40988	552 aa		3.15	□□□□□ -1.9
FKS3	YMR306W	COQ4	O13525	335 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	TRK1	P12685	1235 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	NUP133	P36161	1157 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	YLR271W	Q06152	274 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	PRD1	P25375	712 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	PEA2	P40091	420 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	DPL1	Q05567	589 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	NCB2	Q92317	146 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	TPD3	P31383	635 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	IOC4	Q04213	475 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	YDL144C	Q07589	356 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	EMP47	P43555	445 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	SRF1	Q12516	437 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	JIP4	Q03361	876 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	GSM1	P42950	618 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	CBP1	P07252	654 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	AFG2	P32794	780 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	SIS2	P36024	562 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	YIL089W	P40500	205 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	YAF9	P53930	226 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	RAD2	P07276	1031 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	CDC45	Q08032	650 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	UBP16	Q02863	499 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	YPP1	P46951	817 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	MDL2	P33311	773 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	CST9	Q06032	482 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.11	□□□□□ -1.91	not detected
FKS3	YMR306W	SDH2	P21801	266 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	MCD4	P36051	919 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	LYS14	P40971	790 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	PIP2	P52960	996 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	ITC1	P53125	1264 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	THI3	Q07471	609 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	GIN4	Q12263	1142 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	PIF1	P07271	859 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	MGM1	P32266	881 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	ZDS2	P54786	942 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	MTC5	Q03897	1148 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	CSR2	Q12734	1121 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	NIT1	P40447	199 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	NCS6	P53088	359 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	YGR117C	P53270	476 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	RBA50	Q04418	439 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	YKR018C	P36114	725 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	ICP55	P40051	511 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	SRT1	Q03175	343 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	AVT3	P36062	692 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	VPS4	P52917	437 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	VAB2	P40003	282 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	SPR3	P41901	512 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	APL6	P46682	809 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	ATG1	P53104	897 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	PUS6	P53294	404 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	SGD1	Q06132	899 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FKS3	YMR306W	KRE2	P27809	442 aa		3.1	□□□□□ -1.91

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