RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W YPL272CQ08984 517 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SPC3Q12133 184 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W COX17Q12287 69 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YOR343CQ12484 108 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa3.7□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RPC40P07703 335 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W PRB1P09232 635 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SAM35P14693 329 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data3.69□□□□□ -1.82not detected
SPC105YGL093W CNA1P23287 553 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RPL5P26321 297 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YME2P32843 850 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MDL1P33310 695 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YFL066CP43538 392 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SSY5P47002 699 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YNR062CP53748 327 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W OST6Q03723 332 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YLR346CQ06139 101 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YDL218WQ07629 317 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W THP3Q12049 470 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YLR126CQ12288 251 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W TAL1P15019 335 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YCR100CP25606 316 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W CAM1P29547 415 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YKR015CP36111 568 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MRPL39P36533 70 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MDM31P38880 579 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W BUD17P53727 317 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W NUP116Q02630 1113 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W FDC1Q03034 503 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W COX20Q04935 205 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W NEJ1Q06148 342 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SWM1Q12379 170 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RRI1Q12468 440 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W TOR1P35169 2470 aa3.69□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SCEIP03882 235 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MRPS28P21771 286 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W ARC19P33204 171 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data3.68□□□□□ -1.82not detected
SPC105YGL093W YEL057CP39983 233 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SAM37P50110 327 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W PCP1P53259 346 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YMR087WQ04299 284 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SWA2Q06677 668 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MSW1P04803 379 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W COX9P07255 59 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RPS26AP39938 119 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RPS26BP39939 119 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W KRE29P40026 464 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SCY1P53009 804 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SNF12P53628 566 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MIX14Q04341 121 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W GAL83Q04739 417 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W BAG7Q12128 409 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YAL064W-BO13512 126 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MET2P08465 486 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W URE2P23202 354 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W ERG9P29704 444 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W PEP12P32854 288 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W APE4P38821 490 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SLZ1P40167 298 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RFC4P40339 323 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W VNX1P42839 908 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W CCC1P47818 322 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YGR126WP53274 230 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YDR514CQ04408 483 aa3.68□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W CDC9P04819 755 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W FUN19P28003 413 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W PRE2P30656 287 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MCM10P32354 571 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W VPS17P32913 551 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W ECM4P36156 370 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W AHP1P38013 176 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MSY1P48527 492 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YGL260WP53056 76 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SLI1P53304 468 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MTM1P53320 366 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W GIS1Q03833 894 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W IPK1Q06667 281 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W PBS2P08018 668 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YKL077WP36081 392 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YHR035WP38769 630 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SHO1P40073 367 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W BNA6P43619 295 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YFR054CP43622 192 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W SFH5P47008 294 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W PGA1P53896 198 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.67□□□□□ -1.82not detected
SPC105YGL093W BNA7Q04066 261 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W YDL114WQ07530 308 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W MIM1Q08176 113 aa3.67□□□□□ -1.82
SPC105YGL093W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
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