Protein–RNA interactions for Protein: Q12133

SPC3, Signal peptidase complex subunit SPC3, yeastyeast

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC3Q12133 NSR1YGR159C 1245 nt18.55■□□□□ 0.56
SPC3Q12133 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.43■□□□□ 0.54
SPC3Q12133 NOP1YDL014W 984 nt17.81■□□□□ 0.44
SPC3Q12133 MDJ1YFL016C 1536 nt16.71■□□□□ 0.27
SPC3Q12133 YKL036CYKL036C 393 nt16.2■□□□□ 0.18
SPC3Q12133 SRX1YKL086W 384 nt15.58■□□□□ 0.08
SPC3Q12133 Q0297Q0297 156 nt15.53■□□□□ 0.08
SPC3Q12133 YJL027CYJL027C 417 nt15.39■□□□□ 0.05
SPC3Q12133 YCR051WYCR051W 669 nt14.74□□□□□ -0.05
SPC3Q12133 DBP2YNL112W 1641 nt14.72□□□□□ -0.05
SPC3Q12133 SCS3YGL126W 1143 nt14.63□□□□□ -0.07
SPC3Q12133 YBR190WYBR190W 312 nt14.32□□□□□ -0.12
SPC3Q12133 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.25□□□□□ -0.13
SPC3Q12133 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.25□□□□□ -0.13
SPC3Q12133 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.25□□□□□ -0.13
SPC3Q12133 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.25□□□□□ -0.13
SPC3Q12133 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.25□□□□□ -0.13
SPC3Q12133 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.25□□□□□ -0.13
SPC3Q12133 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.25□□□□□ -0.13
SPC3Q12133 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.25□□□□□ -0.13
SPC3Q12133 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.25□□□□□ -0.13
SPC3Q12133 CCC1YLR220W 969 nt14.07□□□□□ -0.16
SPC3Q12133 YOL085CYOL085C 342 nt14.06□□□□□ -0.16
SPC3Q12133 RTC3YHR087W 336 nt13.96□□□□□ -0.17
SPC3Q12133 RPP1BYDL130W 321 nt13.93□□□□□ -0.18
SPC3Q12133 PKP1YIL042C 1185 nt13.86□□□□□ -0.19
SPC3Q12133 RVS167YDR388W 1449 nt13.72□□□□□ -0.21
SPC3Q12133 SCJ1YMR214W 1134 nt13.65□□□□□ -0.22
SPC3Q12133 SSA3YBL075C 1950 nt13.59□□□□□ -0.23
SPC3Q12133 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.39□□□□□ -0.27
SPC3Q12133 PET122YER153C 765 nt13.34□□□□□ -0.27
SPC3Q12133 PUT4YOR348C 1884 nt13.22□□□□□ -0.29
SPC3Q12133 SHR5YOL110W 714 nt13.21□□□□□ -0.29
SPC3Q12133 SCR1SCR1 522 nt13.1□□□□□ -0.31
SPC3Q12133 ATS1YAL020C 1002 nt13.01□□□□□ -0.33
SPC3Q12133 URN1YPR152C 1398 nt12.99□□□□□ -0.33
SPC3Q12133 YDJ1YNL064C 1230 nt12.95□□□□□ -0.34
SPC3Q12133 RRN5YLR141W 1092 nt12.92□□□□□ -0.34
SPC3Q12133 DEP1YAL013W 1218 nt12.91□□□□□ -0.34
SPC3Q12133 ARE1YCR048W 1833 nt12.9□□□□□ -0.34
SPC3Q12133 OPI9YLR338W 858 nt12.87□□□□□ -0.35
SPC3Q12133 SAH1YER043C 1350 nt12.85□□□□□ -0.35
SPC3Q12133 POA1YBR022W 534 nt12.76□□□□□ -0.37
SPC3Q12133 RPN10YHR200W 807 nt12.72□□□□□ -0.37
SPC3Q12133 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.71□□□□□ -0.37
SPC3Q12133 GAR1YHR089C 618 nt12.69□□□□□ -0.38
SPC3Q12133 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.68□□□□□ -0.38
SPC3Q12133 YNL208WYNL208W 600 nt12.68□□□□□ -0.38
SPC3Q12133 RSB1YOR049C 1065 nt12.57□□□□□ -0.4
SPC3Q12133 BSC6YOL137W 1494 nt12.54□□□□□ -0.4
SPC3Q12133 PUN1YLR414C 792 nt12.48□□□□□ -0.41
SPC3Q12133 BUD23YCR047C 828 nt12.38□□□□□ -0.43
SPC3Q12133 YJR018WYJR018W 363 nt12.38□□□□□ -0.43
SPC3Q12133 PTC2YER089C 1395 nt12.37□□□□□ -0.43
SPC3Q12133 TIR1YER011W 765 nt12.29□□□□□ -0.44
SPC3Q12133 NAB2YGL122C 1578 nt12.25□□□□□ -0.45
SPC3Q12133 SSA1YAL005C 1929 nt12.21□□□□□ -0.46
SPC3Q12133 SPT5YML010W 3192 nt12.2□□□□□ -0.46
SPC3Q12133 YJR120WYJR120W 351 nt12.18□□□□□ -0.46
SPC3Q12133 PST2YDR032C 597 nt12.1□□□□□ -0.47
SPC3Q12133 FIS1YIL065C 468 nt12.07□□□□□ -0.48
SPC3Q12133 DAL1YIR027C 1383 nt12.05□□□□□ -0.48
SPC3Q12133 RPP2BYDR382W 333 nt12.04□□□□□ -0.48
SPC3Q12133 SRB2YHR041C 633 nt11.98□□□□□ -0.49
SPC3Q12133 FPR4YLR449W 1179 nt11.98□□□□□ -0.49
SPC3Q12133 INM2YDR287W 879 nt11.96□□□□□ -0.49
SPC3Q12133 PHO4YFR034C 939 nt11.94□□□□□ -0.5
SPC3Q12133 SSA4YER103W 1929 nt11.84□□□□□ -0.51
SPC3Q12133 YBL100CYBL100C 315 nt11.81□□□□□ -0.52
SPC3Q12133 MEP2YNL142W 1500 nt11.81□□□□□ -0.52
SPC3Q12133 YPS1YLR120C 1710 nt11.8□□□□□ -0.52
SPC3Q12133 BDH2YAL061W 1254 nt11.78□□□□□ -0.52
SPC3Q12133 WWM1YFL010C 636 nt11.71□□□□□ -0.53
SPC3Q12133 YDR095CYDR095C 411 nt11.68□□□□□ -0.54
SPC3Q12133 FUN26YAL022C 1554 nt11.67□□□□□ -0.54
SPC3Q12133 SHU1YHL006C 453 nt11.67□□□□□ -0.54
SPC3Q12133 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.66□□□□□ -0.54
SPC3Q12133 DCW1YKL046C 1350 nt11.62□□□□□ -0.55
SPC3Q12133 TRM9YML014W 840 nt11.59□□□□□ -0.55
SPC3Q12133 LSM3YLR438C-A 270 nt11.58□□□□□ -0.56
SPC3Q12133 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.57□□□□□ -0.56
SPC3Q12133 YGR021WYGR021W 873 nt11.55□□□□□ -0.56
SPC3Q12133 ALF1YNL148C 765 nt11.53□□□□□ -0.56
SPC3Q12133 CCT6YDR188W 1641 nt11.51□□□□□ -0.57
SPC3Q12133 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.51□□□□□ -0.57
SPC3Q12133 HOM6YJR139C 1080 nt11.51□□□□□ -0.57
SPC3Q12133 PTP1YDL230W 1008 nt11.47□□□□□ -0.57
SPC3Q12133 YKL097CYKL097C 411 nt11.46□□□□□ -0.57
SPC3Q12133 RPP2AYOL039W 321 nt11.46□□□□□ -0.57
SPC3Q12133 EMI2YDR516C 1503 nt11.45□□□□□ -0.58
SPC3Q12133 PAC11YDR488C 1602 nt11.42□□□□□ -0.58
SPC3Q12133 MNP1YGL068W 585 nt11.42□□□□□ -0.58
SPC3Q12133 BDF1YLR399C 2061 nt11.42□□□□□ -0.58
SPC3Q12133 CAC2YML102W 1407 nt11.41□□□□□ -0.58
SPC3Q12133 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.4□□□□□ -0.58
SPC3Q12133 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.4□□□□□ -0.58
SPC3Q12133 SIS1YNL007C 1059 nt11.4□□□□□ -0.58
SPC3Q12133 YMR090WYMR090W 684 nt11.37□□□□□ -0.59
SPC3Q12133 YDL221WYDL221W 552 nt11.36□□□□□ -0.59
SPC3Q12133 YBR220CYBR220C 1683 nt11.34□□□□□ -0.59
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