Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 NSR1YGR159C 1245 nt18.77■□□□□ 0.6
SYF2P53277 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.71■□□□□ 0.59
SYF2P53277 NOP1YDL014W 984 nt18.04■□□□□ 0.48
SYF2P53277 MDJ1YFL016C 1536 nt16.94■□□□□ 0.3
SYF2P53277 YKL036CYKL036C 393 nt16.5■□□□□ 0.23
SYF2P53277 SRX1YKL086W 384 nt15.83■□□□□ 0.12
SYF2P53277 Q0297Q0297 156 nt15.82■□□□□ 0.12
SYF2P53277 YJL027CYJL027C 417 nt15.52■□□□□ 0.08
SYF2P53277 SCS3YGL126W 1143 nt14.98□□□□□ -0.01
SYF2P53277 DBP2YNL112W 1641 nt14.98□□□□□ -0.01
SYF2P53277 YCR051WYCR051W 669 nt14.95□□□□□ -0.02
SYF2P53277 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.49□□□□□ -0.09
SYF2P53277 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.49□□□□□ -0.09
SYF2P53277 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.49□□□□□ -0.09
SYF2P53277 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.49□□□□□ -0.09
SYF2P53277 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.49□□□□□ -0.09
SYF2P53277 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.49□□□□□ -0.09
SYF2P53277 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.49□□□□□ -0.09
SYF2P53277 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.49□□□□□ -0.09
SYF2P53277 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.49□□□□□ -0.09
SYF2P53277 YBR190WYBR190W 312 nt14.45□□□□□ -0.1
SYF2P53277 YOL085CYOL085C 342 nt14.34□□□□□ -0.11
SYF2P53277 CCC1YLR220W 969 nt14.25□□□□□ -0.13
SYF2P53277 RPP1BYDL130W 321 nt14.17□□□□□ -0.14
SYF2P53277 PKP1YIL042C 1185 nt14.14□□□□□ -0.15
SYF2P53277 RTC3YHR087W 336 nt14.04□□□□□ -0.16
SYF2P53277 SCJ1YMR214W 1134 nt13.91□□□□□ -0.18
SYF2P53277 RVS167YDR388W 1449 nt13.84□□□□□ -0.19
SYF2P53277 PET122YER153C 765 nt13.61□□□□□ -0.23
SYF2P53277 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.6□□□□□ -0.23
SYF2P53277 PUT4YOR348C 1884 nt13.38□□□□□ -0.27
SYF2P53277 SHR5YOL110W 714 nt13.38□□□□□ -0.27
SYF2P53277 SSA3YBL075C 1950 nt13.36□□□□□ -0.27
SYF2P53277 ATS1YAL020C 1002 nt13.31□□□□□ -0.28
SYF2P53277 SCR1SCR1 522 nt13.28□□□□□ -0.28
SYF2P53277 RRN5YLR141W 1092 nt13.15□□□□□ -0.3
SYF2P53277 YDJ1YNL064C 1230 nt13.15□□□□□ -0.3
SYF2P53277 URN1YPR152C 1398 nt13.14□□□□□ -0.31
SYF2P53277 ARE1YCR048W 1833 nt13.08□□□□□ -0.32
SYF2P53277 DEP1YAL013W 1218 nt13.07□□□□□ -0.32
SYF2P53277 OPI9YLR338W 858 nt13.01□□□□□ -0.33
SYF2P53277 SAH1YER043C 1350 nt12.99□□□□□ -0.33
SYF2P53277 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.92□□□□□ -0.34
SYF2P53277 GAR1YHR089C 618 nt12.87□□□□□ -0.35
SYF2P53277 POA1YBR022W 534 nt12.86□□□□□ -0.35
SYF2P53277 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.84□□□□□ -0.35
SYF2P53277 YNL208WYNL208W 600 nt12.82□□□□□ -0.36
SYF2P53277 RPN10YHR200W 807 nt12.81□□□□□ -0.36
SYF2P53277 RSB1YOR049C 1065 nt12.77□□□□□ -0.37
SYF2P53277 BSC6YOL137W 1494 nt12.65□□□□□ -0.38
SYF2P53277 PUN1YLR414C 792 nt12.58□□□□□ -0.4
SYF2P53277 YJR018WYJR018W 363 nt12.5□□□□□ -0.41
SYF2P53277 PTC2YER089C 1395 nt12.49□□□□□ -0.41
SYF2P53277 TIR1YER011W 765 nt12.47□□□□□ -0.41
SYF2P53277 BUD23YCR047C 828 nt12.46□□□□□ -0.41
SYF2P53277 SSA1YAL005C 1929 nt12.43□□□□□ -0.42
SYF2P53277 YJR120WYJR120W 351 nt12.43□□□□□ -0.42
SYF2P53277 SPT5YML010W 3192 nt12.4□□□□□ -0.42
SYF2P53277 PST2YDR032C 597 nt12.39□□□□□ -0.43
SYF2P53277 NAB2YGL122C 1578 nt12.35□□□□□ -0.43
SYF2P53277 SRB2YHR041C 633 nt12.28□□□□□ -0.44
SYF2P53277 FIS1YIL065C 468 nt12.26□□□□□ -0.45
SYF2P53277 DAL1YIR027C 1383 nt12.17□□□□□ -0.46
SYF2P53277 RPP2BYDR382W 333 nt12.12□□□□□ -0.47
SYF2P53277 PHO4YFR034C 939 nt12.08□□□□□ -0.48
SYF2P53277 FPR4YLR449W 1179 nt12.05□□□□□ -0.48
SYF2P53277 INM2YDR287W 879 nt12.04□□□□□ -0.48
SYF2P53277 SHU1YHL006C 453 nt11.95□□□□□ -0.5
SYF2P53277 YBL100CYBL100C 315 nt11.94□□□□□ -0.5
SYF2P53277 YPS1YLR120C 1710 nt11.94□□□□□ -0.5
SYF2P53277 BDH2YAL061W 1254 nt11.93□□□□□ -0.5
SYF2P53277 SSA4YER103W 1929 nt11.92□□□□□ -0.5
SYF2P53277 WWM1YFL010C 636 nt11.91□□□□□ -0.5
SYF2P53277 MEP2YNL142W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
SYF2P53277 YDR095CYDR095C 411 nt11.82□□□□□ -0.52
SYF2P53277 FUN26YAL022C 1554 nt11.81□□□□□ -0.52
SYF2P53277 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.8□□□□□ -0.52
SYF2P53277 DCW1YKL046C 1350 nt11.76□□□□□ -0.53
SYF2P53277 HOM6YJR139C 1080 nt11.74□□□□□ -0.53
SYF2P53277 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.73□□□□□ -0.53
SYF2P53277 YGR021WYGR021W 873 nt11.72□□□□□ -0.53
SYF2P53277 YKL097CYKL097C 411 nt11.72□□□□□ -0.53
SYF2P53277 LSM3YLR438C-A 270 nt11.71□□□□□ -0.53
SYF2P53277 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.69□□□□□ -0.54
SYF2P53277 MNP1YGL068W 585 nt11.68□□□□□ -0.54
SYF2P53277 TRM9YML014W 840 nt11.67□□□□□ -0.54
SYF2P53277 CCT6YDR188W 1641 nt11.67□□□□□ -0.54
SYF2P53277 PTP1YDL230W 1008 nt11.64□□□□□ -0.55
SYF2P53277 ALF1YNL148C 765 nt11.59□□□□□ -0.55
SYF2P53277 RKM5YLR137W 1104 nt11.56□□□□□ -0.56
SYF2P53277 CAC2YML102W 1407 nt11.56□□□□□ -0.56
SYF2P53277 RPP2AYOL039W 321 nt11.55□□□□□ -0.56
SYF2P53277 EMI2YDR516C 1503 nt11.55□□□□□ -0.56
SYF2P53277 BDF1YLR399C 2061 nt11.55□□□□□ -0.56
SYF2P53277 SIS1YNL007C 1059 nt11.54□□□□□ -0.56
SYF2P53277 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.48□□□□□ -0.57
SYF2P53277 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.48□□□□□ -0.57
SYF2P53277 YDL221WYDL221W 552 nt11.47□□□□□ -0.57
SYF2P53277 YBR220CYBR220C 1683 nt11.45□□□□□ -0.58
SYF2P53277 YOR139CYOR139C 393 nt11.4□□□□□ -0.58
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