Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 NSR1YGR159C 1245 nt18.41■□□□□ 0.54
NEJ1Q06148 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.03■□□□□ 0.48
NEJ1Q06148 NOP1YDL014W 984 nt17.33■□□□□ 0.36
NEJ1Q06148 MDJ1YFL016C 1536 nt16.85■□□□□ 0.29
NEJ1Q06148 YJL027CYJL027C 417 nt15.53■□□□□ 0.08
NEJ1Q06148 YKL036CYKL036C 393 nt15.44■□□□□ 0.06
NEJ1Q06148 SRX1YKL086W 384 nt15.11■□□□□ 0.01
NEJ1Q06148 Q0297Q0297 156 nt14.96□□□□□ -0.01
NEJ1Q06148 DBP2YNL112W 1641 nt14.65□□□□□ -0.06
NEJ1Q06148 YBR190WYBR190W 312 nt14.55□□□□□ -0.08
NEJ1Q06148 YCR051WYCR051W 669 nt14.29□□□□□ -0.12
NEJ1Q06148 RTC3YHR087W 336 nt14.18□□□□□ -0.14
NEJ1Q06148 SSA3YBL075C 1950 nt14.06□□□□□ -0.16
NEJ1Q06148 TRN1tP(UGG)A 72 nt14□□□□□ -0.17
NEJ1Q06148 SUF9tP(UGG)F 72 nt14□□□□□ -0.17
NEJ1Q06148 SUF8tP(UGG)H 72 nt14□□□□□ -0.17
NEJ1Q06148 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14□□□□□ -0.17
NEJ1Q06148 SUF7tP(UGG)M 72 nt14□□□□□ -0.17
NEJ1Q06148 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14□□□□□ -0.17
NEJ1Q06148 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14□□□□□ -0.17
NEJ1Q06148 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14□□□□□ -0.17
NEJ1Q06148 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14□□□□□ -0.17
NEJ1Q06148 CCC1YLR220W 969 nt13.82□□□□□ -0.2
NEJ1Q06148 SCS3YGL126W 1143 nt13.74□□□□□ -0.21
NEJ1Q06148 RVS167YDR388W 1449 nt13.73□□□□□ -0.21
NEJ1Q06148 PUT4YOR348C 1884 nt13.61□□□□□ -0.23
NEJ1Q06148 SCJ1YMR214W 1134 nt13.48□□□□□ -0.25
NEJ1Q06148 RPP1BYDL130W 321 nt13.42□□□□□ -0.26
NEJ1Q06148 YOL085CYOL085C 342 nt13.36□□□□□ -0.27
NEJ1Q06148 PKP1YIL042C 1185 nt13.21□□□□□ -0.29
NEJ1Q06148 ARE1YCR048W 1833 nt13.18□□□□□ -0.3
NEJ1Q06148 POA1YBR022W 534 nt13.12□□□□□ -0.31
NEJ1Q06148 SHR5YOL110W 714 nt13.1□□□□□ -0.31
NEJ1Q06148 URN1YPR152C 1398 nt13.07□□□□□ -0.32
NEJ1Q06148 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.04□□□□□ -0.32
NEJ1Q06148 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.04□□□□□ -0.32
NEJ1Q06148 SAH1YER043C 1350 nt13.03□□□□□ -0.32
NEJ1Q06148 OPI9YLR338W 858 nt13□□□□□ -0.33
NEJ1Q06148 BSC6YOL137W 1494 nt12.97□□□□□ -0.33
NEJ1Q06148 PET122YER153C 765 nt12.87□□□□□ -0.35
NEJ1Q06148 DEP1YAL013W 1218 nt12.87□□□□□ -0.35
NEJ1Q06148 RPN10YHR200W 807 nt12.8□□□□□ -0.36
NEJ1Q06148 SPT5YML010W 3192 nt12.73□□□□□ -0.37
NEJ1Q06148 BUD23YCR047C 828 nt12.69□□□□□ -0.38
NEJ1Q06148 YNL208WYNL208W 600 nt12.65□□□□□ -0.38
NEJ1Q06148 PUN1YLR414C 792 nt12.64□□□□□ -0.39
NEJ1Q06148 YDJ1YNL064C 1230 nt12.64□□□□□ -0.39
NEJ1Q06148 SCR1SCR1 522 nt12.63□□□□□ -0.39
NEJ1Q06148 SSA4YER103W 1929 nt12.59□□□□□ -0.39
NEJ1Q06148 PTC2YER089C 1395 nt12.55□□□□□ -0.4
NEJ1Q06148 NAB2YGL122C 1578 nt12.48□□□□□ -0.41
NEJ1Q06148 YJR018WYJR018W 363 nt12.43□□□□□ -0.42
NEJ1Q06148 RRN5YLR141W 1092 nt12.43□□□□□ -0.42
NEJ1Q06148 GAR1YHR089C 618 nt12.42□□□□□ -0.42
NEJ1Q06148 FIS1YIL065C 468 nt12.24□□□□□ -0.45
NEJ1Q06148 MEP2YNL142W 1500 nt12.24□□□□□ -0.45
NEJ1Q06148 DAL1YIR027C 1383 nt12.21□□□□□ -0.45
NEJ1Q06148 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.18□□□□□ -0.46
NEJ1Q06148 FPR4YLR449W 1179 nt12.15□□□□□ -0.46
NEJ1Q06148 BDF1YLR399C 2061 nt12.14□□□□□ -0.47
NEJ1Q06148 ATS1YAL020C 1002 nt12.12□□□□□ -0.47
NEJ1Q06148 PHO4YFR034C 939 nt12.09□□□□□ -0.47
NEJ1Q06148 YJR120WYJR120W 351 nt12.08□□□□□ -0.48
NEJ1Q06148 INM2YDR287W 879 nt12.07□□□□□ -0.48
NEJ1Q06148 RPP2BYDR382W 333 nt12.07□□□□□ -0.48
NEJ1Q06148 TIR1YER011W 765 nt12.05□□□□□ -0.48
NEJ1Q06148 YPS1YLR120C 1710 nt12.05□□□□□ -0.48
NEJ1Q06148 RSB1YOR049C 1065 nt12.03□□□□□ -0.48
NEJ1Q06148 DCW1YKL046C 1350 nt12□□□□□ -0.49
NEJ1Q06148 TAT1YBR069C 1860 nt11.99□□□□□ -0.49
NEJ1Q06148 SSA1YAL005C 1929 nt11.99□□□□□ -0.49
NEJ1Q06148 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.97□□□□□ -0.49
NEJ1Q06148 YDR095CYDR095C 411 nt11.89□□□□□ -0.51
NEJ1Q06148 YMR090WYMR090W 684 nt11.87□□□□□ -0.51
NEJ1Q06148 YBL100CYBL100C 315 nt11.87□□□□□ -0.51
NEJ1Q06148 EMI2YDR516C 1503 nt11.86□□□□□ -0.51
NEJ1Q06148 YBR220CYBR220C 1683 nt11.81□□□□□ -0.52
NEJ1Q06148 YDL221WYDL221W 552 nt11.73□□□□□ -0.53
NEJ1Q06148 BDH2YAL061W 1254 nt11.71□□□□□ -0.53
NEJ1Q06148 FUN26YAL022C 1554 nt11.69□□□□□ -0.54
NEJ1Q06148 SDH1YKL148C 1923 nt11.68□□□□□ -0.54
NEJ1Q06148 ALF1YNL148C 765 nt11.68□□□□□ -0.54
NEJ1Q06148 RPP2AYOL039W 321 nt11.67□□□□□ -0.54
NEJ1Q06148 CAC2YML102W 1407 nt11.64□□□□□ -0.55
NEJ1Q06148 PTP1YDL230W 1008 nt11.64□□□□□ -0.55
NEJ1Q06148 SRB2YHR041C 633 nt11.64□□□□□ -0.55
NEJ1Q06148 PAC11YDR488C 1602 nt11.59□□□□□ -0.55
NEJ1Q06148 TRM9YML014W 840 nt11.58□□□□□ -0.56
NEJ1Q06148 SCC4YER147C 1875 nt11.54□□□□□ -0.56
NEJ1Q06148 SEC11YIR022W 504 nt11.52□□□□□ -0.57
NEJ1Q06148 PCH2YBR186W 1695 nt11.51□□□□□ -0.57
NEJ1Q06148 CCT6YDR188W 1641 nt11.49□□□□□ -0.57
NEJ1Q06148 IRC15YPL017C 1500 nt11.47□□□□□ -0.57
NEJ1Q06148 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.47□□□□□ -0.57
NEJ1Q06148 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.47□□□□□ -0.57
NEJ1Q06148 SIS1YNL007C 1059 nt11.47□□□□□ -0.57
NEJ1Q06148 LSM3YLR438C-A 270 nt11.46□□□□□ -0.57
NEJ1Q06148 GUT2YIL155C 1950 nt11.45□□□□□ -0.58
NEJ1Q06148 GIS3YLR094C 1509 nt11.41□□□□□ -0.58
NEJ1Q06148 WWM1YFL010C 636 nt11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.1 ms