Protein–RNA interactions for Protein: Q12287

COX17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, yeastyeast

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
COX17Q12287 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.14■□□□□ 0.49
COX17Q12287 NOP1YDL014W 984 nt17.88■□□□□ 0.45
COX17Q12287 NSR1YGR159C 1245 nt17.82■□□□□ 0.44
COX17Q12287 YKL036CYKL036C 393 nt16.73■□□□□ 0.27
COX17Q12287 Q0297Q0297 156 nt15.69■□□□□ 0.1
COX17Q12287 YJL027CYJL027C 417 nt15.66■□□□□ 0.1
COX17Q12287 SRX1YKL086W 384 nt15.56■□□□□ 0.08
COX17Q12287 MDJ1YFL016C 1536 nt15.39■□□□□ 0.05
COX17Q12287 SCS3YGL126W 1143 nt15.31■□□□□ 0.04
COX17Q12287 YCR051WYCR051W 669 nt14.76□□□□□ -0.05
COX17Q12287 YOL085CYOL085C 342 nt14.42□□□□□ -0.1
COX17Q12287 SCJ1YMR214W 1134 nt14.1□□□□□ -0.15
COX17Q12287 PKP1YIL042C 1185 nt14.09□□□□□ -0.15
COX17Q12287 RPP1BYDL130W 321 nt14.07□□□□□ -0.16
COX17Q12287 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.85□□□□□ -0.19
COX17Q12287 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.85□□□□□ -0.19
COX17Q12287 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.85□□□□□ -0.19
COX17Q12287 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.85□□□□□ -0.19
COX17Q12287 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.85□□□□□ -0.19
COX17Q12287 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.85□□□□□ -0.19
COX17Q12287 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.85□□□□□ -0.19
COX17Q12287 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.85□□□□□ -0.19
COX17Q12287 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.85□□□□□ -0.19
COX17Q12287 ATS1YAL020C 1002 nt13.8□□□□□ -0.2
COX17Q12287 DBP2YNL112W 1641 nt13.72□□□□□ -0.21
COX17Q12287 CCC1YLR220W 969 nt13.67□□□□□ -0.22
COX17Q12287 SCR1SCR1 522 nt13.42□□□□□ -0.26
COX17Q12287 PET122YER153C 765 nt13.34□□□□□ -0.27
COX17Q12287 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.2□□□□□ -0.3
COX17Q12287 RVS167YDR388W 1449 nt13.18□□□□□ -0.3
COX17Q12287 YBR190WYBR190W 312 nt13.15□□□□□ -0.3
COX17Q12287 RRN5YLR141W 1092 nt12.99□□□□□ -0.33
COX17Q12287 RTC3YHR087W 336 nt12.86□□□□□ -0.35
COX17Q12287 RSB1YOR049C 1065 nt12.86□□□□□ -0.35
COX17Q12287 YDJ1YNL064C 1230 nt12.83□□□□□ -0.36
COX17Q12287 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.74□□□□□ -0.37
COX17Q12287 Q0182Q0182 405 nt12.73□□□□□ -0.37
COX17Q12287 SHR5YOL110W 714 nt12.73□□□□□ -0.37
COX17Q12287 PST2YDR032C 597 nt12.71□□□□□ -0.37
COX17Q12287 YKL097CYKL097C 411 nt12.43□□□□□ -0.42
COX17Q12287 GAR1YHR089C 618 nt12.41□□□□□ -0.42
COX17Q12287 MOT3YMR070W 1473 nt12.21□□□□□ -0.45
COX17Q12287 RPN10YHR200W 807 nt12.16□□□□□ -0.46
COX17Q12287 DEP1YAL013W 1218 nt12.14□□□□□ -0.47
COX17Q12287 URN1YPR152C 1398 nt12.13□□□□□ -0.47
COX17Q12287 YNL208WYNL208W 600 nt12.12□□□□□ -0.47
COX17Q12287 SHU1YHL006C 453 nt12.08□□□□□ -0.48
COX17Q12287 TIR1YER011W 765 nt12.01□□□□□ -0.49
COX17Q12287 OPI9YLR338W 858 nt11.92□□□□□ -0.5
COX17Q12287 YOR139CYOR139C 393 nt11.76□□□□□ -0.53
COX17Q12287 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.74□□□□□ -0.53
COX17Q12287 SSA1YAL005C 1929 nt11.73□□□□□ -0.53
COX17Q12287 NPL3YDR432W 1245 nt11.72□□□□□ -0.53
COX17Q12287 SAH1YER043C 1350 nt11.68□□□□□ -0.54
COX17Q12287 YGR021WYGR021W 873 nt11.66□□□□□ -0.54
COX17Q12287 PUN1YLR414C 792 nt11.63□□□□□ -0.55
COX17Q12287 YJR018WYJR018W 363 nt11.61□□□□□ -0.55
COX17Q12287 PUT4YOR348C 1884 nt11.6□□□□□ -0.55
COX17Q12287 RPP2BYDR382W 333 nt11.55□□□□□ -0.56
COX17Q12287 YOL037CYOL037C 354 nt11.55□□□□□ -0.56
COX17Q12287 HOM6YJR139C 1080 nt11.53□□□□□ -0.56
COX17Q12287 ARE1YCR048W 1833 nt11.48□□□□□ -0.57
COX17Q12287 WWM1YFL010C 636 nt11.47□□□□□ -0.57
COX17Q12287 SRB2YHR041C 633 nt11.47□□□□□ -0.57
COX17Q12287 MNP1YGL068W 585 nt11.45□□□□□ -0.58
COX17Q12287 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.4□□□□□ -0.58
COX17Q12287 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.37□□□□□ -0.59
COX17Q12287 YJR120WYJR120W 351 nt11.37□□□□□ -0.59
COX17Q12287 RKM5YLR137W 1104 nt11.37□□□□□ -0.59
COX17Q12287 PTC2YER089C 1395 nt11.34□□□□□ -0.59
COX17Q12287 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.31□□□□□ -0.6
COX17Q12287 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.31□□□□□ -0.6
COX17Q12287 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.31□□□□□ -0.6
COX17Q12287 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.31□□□□□ -0.6
COX17Q12287 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.31□□□□□ -0.6
COX17Q12287 BDH2YAL061W 1254 nt11.31□□□□□ -0.6
COX17Q12287 LSM3YLR438C-A 270 nt11.27□□□□□ -0.61
COX17Q12287 POA1YBR022W 534 nt11.26□□□□□ -0.61
COX17Q12287 INM2YDR287W 879 nt11.22□□□□□ -0.61
COX17Q12287 NAB2YGL122C 1578 nt11.21□□□□□ -0.61
COX17Q12287 YLR281CYLR281C 468 nt11.16□□□□□ -0.62
COX17Q12287 PUS2YGL063W 1113 nt11.15□□□□□ -0.62
COX17Q12287 SSA3YBL075C 1950 nt11.15□□□□□ -0.62
COX17Q12287 BUD23YCR047C 828 nt11.14□□□□□ -0.63
COX17Q12287 DAL1YIR027C 1383 nt11.12□□□□□ -0.63
COX17Q12287 YBL100CYBL100C 315 nt11.11□□□□□ -0.63
COX17Q12287 WHI5YOR083W 888 nt11.08□□□□□ -0.64
COX17Q12287 TRM9YML014W 840 nt11.06□□□□□ -0.64
COX17Q12287 FPR4YLR449W 1179 nt11.05□□□□□ -0.64
COX17Q12287 FIS1YIL065C 468 nt11□□□□□ -0.65
COX17Q12287 IMP2'YIL154C 1041 nt10.99□□□□□ -0.65
COX17Q12287 PHO4YFR034C 939 nt10.97□□□□□ -0.65
COX17Q12287 BSC6YOL137W 1494 nt10.97□□□□□ -0.65
COX17Q12287 FUN26YAL022C 1554 nt10.97□□□□□ -0.65
COX17Q12287 DSK2YMR276W 1122 nt10.92□□□□□ -0.66
COX17Q12287 CCT6YDR188W 1641 nt10.91□□□□□ -0.66
COX17Q12287 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.88□□□□□ -0.67
COX17Q12287 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.88□□□□□ -0.67
COX17Q12287 FMP45YDL222C 930 nt10.86□□□□□ -0.67
COX17Q12287 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.4 ms