Protein–RNA interactions for Protein: P48527

MSY1, Tyrosine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSY1P48527 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.17■□□□□ 0.5
MSY1P48527 NSR1YGR159C 1245 nt18.02■□□□□ 0.48
MSY1P48527 NOP1YDL014W 984 nt17.72■□□□□ 0.43
MSY1P48527 YKL036CYKL036C 393 nt16.41■□□□□ 0.22
MSY1P48527 MDJ1YFL016C 1536 nt16.04■□□□□ 0.16
MSY1P48527 Q0297Q0297 156 nt15.52■□□□□ 0.08
MSY1P48527 SRX1YKL086W 384 nt15.45■□□□□ 0.06
MSY1P48527 YJL027CYJL027C 417 nt15.32■□□□□ 0.04
MSY1P48527 SCS3YGL126W 1143 nt14.95□□□□□ -0.02
MSY1P48527 YCR051WYCR051W 669 nt14.64□□□□□ -0.07
MSY1P48527 YOL085CYOL085C 342 nt14.19□□□□□ -0.14
MSY1P48527 DBP2YNL112W 1641 nt14.17□□□□□ -0.14
MSY1P48527 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.95□□□□□ -0.18
MSY1P48527 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.95□□□□□ -0.18
MSY1P48527 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.95□□□□□ -0.18
MSY1P48527 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.95□□□□□ -0.18
MSY1P48527 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.95□□□□□ -0.18
MSY1P48527 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.95□□□□□ -0.18
MSY1P48527 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.95□□□□□ -0.18
MSY1P48527 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.95□□□□□ -0.18
MSY1P48527 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.95□□□□□ -0.18
MSY1P48527 RPP1BYDL130W 321 nt13.92□□□□□ -0.18
MSY1P48527 PKP1YIL042C 1185 nt13.91□□□□□ -0.18
MSY1P48527 CCC1YLR220W 969 nt13.82□□□□□ -0.2
MSY1P48527 YBR190WYBR190W 312 nt13.65□□□□□ -0.22
MSY1P48527 SCJ1YMR214W 1134 nt13.46□□□□□ -0.25
MSY1P48527 ATS1YAL020C 1002 nt13.42□□□□□ -0.26
MSY1P48527 RTC3YHR087W 336 nt13.38□□□□□ -0.27
MSY1P48527 RVS167YDR388W 1449 nt13.33□□□□□ -0.28
MSY1P48527 PET122YER153C 765 nt13.26□□□□□ -0.29
MSY1P48527 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.19□□□□□ -0.3
MSY1P48527 SCR1SCR1 522 nt13.19□□□□□ -0.3
MSY1P48527 RRN5YLR141W 1092 nt12.88□□□□□ -0.35
MSY1P48527 SHR5YOL110W 714 nt12.87□□□□□ -0.35
MSY1P48527 YDJ1YNL064C 1230 nt12.78□□□□□ -0.36
MSY1P48527 RSB1YOR049C 1065 nt12.65□□□□□ -0.38
MSY1P48527 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.64□□□□□ -0.39
MSY1P48527 SSA3YBL075C 1950 nt12.57□□□□□ -0.4
MSY1P48527 DEP1YAL013W 1218 nt12.53□□□□□ -0.4
MSY1P48527 URN1YPR152C 1398 nt12.52□□□□□ -0.41
MSY1P48527 GAR1YHR089C 618 nt12.49□□□□□ -0.41
MSY1P48527 PST2YDR032C 597 nt12.41□□□□□ -0.42
MSY1P48527 PUT4YOR348C 1884 nt12.4□□□□□ -0.42
MSY1P48527 RPN10YHR200W 807 nt12.32□□□□□ -0.44
MSY1P48527 OPI9YLR338W 858 nt12.32□□□□□ -0.44
MSY1P48527 YNL208WYNL208W 600 nt12.3□□□□□ -0.44
MSY1P48527 SAH1YER043C 1350 nt12.26□□□□□ -0.45
MSY1P48527 ARE1YCR048W 1833 nt12.18□□□□□ -0.46
MSY1P48527 TIR1YER011W 765 nt12.06□□□□□ -0.48
MSY1P48527 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.05□□□□□ -0.48
MSY1P48527 POA1YBR022W 534 nt12.02□□□□□ -0.49
MSY1P48527 YKL097CYKL097C 411 nt11.99□□□□□ -0.49
MSY1P48527 PUN1YLR414C 792 nt11.96□□□□□ -0.49
MSY1P48527 YJR018WYJR018W 363 nt11.93□□□□□ -0.5
MSY1P48527 SSA1YAL005C 1929 nt11.92□□□□□ -0.5
MSY1P48527 SHU1YHL006C 453 nt11.85□□□□□ -0.51
MSY1P48527 PTC2YER089C 1395 nt11.83□□□□□ -0.52
MSY1P48527 Q0182Q0182 405 nt11.82□□□□□ -0.52
MSY1P48527 BUD23YCR047C 828 nt11.77□□□□□ -0.53
MSY1P48527 BSC6YOL137W 1494 nt11.76□□□□□ -0.53
MSY1P48527 YJR120WYJR120W 351 nt11.75□□□□□ -0.53
MSY1P48527 SRB2YHR041C 633 nt11.73□□□□□ -0.53
MSY1P48527 RPP2BYDR382W 333 nt11.7□□□□□ -0.54
MSY1P48527 NAB2YGL122C 1578 nt11.66□□□□□ -0.54
MSY1P48527 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.61□□□□□ -0.55
MSY1P48527 WWM1YFL010C 636 nt11.54□□□□□ -0.56
MSY1P48527 FIS1YIL065C 468 nt11.53□□□□□ -0.56
MSY1P48527 YGR021WYGR021W 873 nt11.52□□□□□ -0.57
MSY1P48527 DAL1YIR027C 1383 nt11.52□□□□□ -0.57
MSY1P48527 FPR4YLR449W 1179 nt11.51□□□□□ -0.57
MSY1P48527 INM2YDR287W 879 nt11.49□□□□□ -0.57
MSY1P48527 BDH2YAL061W 1254 nt11.45□□□□□ -0.58
MSY1P48527 HOM6YJR139C 1080 nt11.44□□□□□ -0.58
MSY1P48527 YOR139CYOR139C 393 nt11.44□□□□□ -0.58
MSY1P48527 PHO4YFR034C 939 nt11.42□□□□□ -0.58
MSY1P48527 YBL100CYBL100C 315 nt11.41□□□□□ -0.58
MSY1P48527 MOT3YMR070W 1473 nt11.4□□□□□ -0.58
MSY1P48527 MNP1YGL068W 585 nt11.39□□□□□ -0.59
MSY1P48527 NPL3YDR432W 1245 nt11.37□□□□□ -0.59
MSY1P48527 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.35□□□□□ -0.59
MSY1P48527 LSM3YLR438C-A 270 nt11.3□□□□□ -0.6
MSY1P48527 YOL037CYOL037C 354 nt11.3□□□□□ -0.6
MSY1P48527 RKM5YLR137W 1104 nt11.28□□□□□ -0.6
MSY1P48527 FUN26YAL022C 1554 nt11.27□□□□□ -0.61
MSY1P48527 TRM9YML014W 840 nt11.23□□□□□ -0.61
MSY1P48527 SPT5YML010W 3192 nt11.21□□□□□ -0.61
MSY1P48527 YPS1YLR120C 1710 nt11.18□□□□□ -0.62
MSY1P48527 CCT6YDR188W 1641 nt11.13□□□□□ -0.63
MSY1P48527 ALF1YNL148C 765 nt11.12□□□□□ -0.63
MSY1P48527 YDR095CYDR095C 411 nt11.11□□□□□ -0.63
MSY1P48527 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.08□□□□□ -0.64
MSY1P48527 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.03□□□□□ -0.64
MSY1P48527 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.03□□□□□ -0.64
MSY1P48527 MEP2YNL142W 1500 nt11.03□□□□□ -0.64
MSY1P48527 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.01□□□□□ -0.65
MSY1P48527 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.01□□□□□ -0.65
MSY1P48527 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.01□□□□□ -0.65
MSY1P48527 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.01□□□□□ -0.65
MSY1P48527 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.01□□□□□ -0.65
MSY1P48527 YLR281CYLR281C 468 nt11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms