Protein–RNA interactions for Protein: Q12159

YRA1, RNA annealing protein YRA1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRA1Q12159 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.45■□□□□ 0.54
YRA1Q12159 NSR1YGR159C 1245 nt18.32■□□□□ 0.52
YRA1Q12159 NOP1YDL014W 984 nt17.9■□□□□ 0.46
YRA1Q12159 YKL036CYKL036C 393 nt16.53■□□□□ 0.24
YRA1Q12159 MDJ1YFL016C 1536 nt16.3■□□□□ 0.2
YRA1Q12159 Q0297Q0297 156 nt15.68■□□□□ 0.1
YRA1Q12159 SRX1YKL086W 384 nt15.65■□□□□ 0.1
YRA1Q12159 YJL027CYJL027C 417 nt15.44■□□□□ 0.06
YRA1Q12159 SCS3YGL126W 1143 nt15.06■□□□□ 0
YRA1Q12159 YCR051WYCR051W 669 nt14.86□□□□□ -0.03
YRA1Q12159 DBP2YNL112W 1641 nt14.42□□□□□ -0.1
YRA1Q12159 YOL085CYOL085C 342 nt14.33□□□□□ -0.12
YRA1Q12159 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.17□□□□□ -0.14
YRA1Q12159 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.17□□□□□ -0.14
YRA1Q12159 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.17□□□□□ -0.14
YRA1Q12159 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.17□□□□□ -0.14
YRA1Q12159 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.17□□□□□ -0.14
YRA1Q12159 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.17□□□□□ -0.14
YRA1Q12159 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.17□□□□□ -0.14
YRA1Q12159 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.17□□□□□ -0.14
YRA1Q12159 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.17□□□□□ -0.14
YRA1Q12159 PKP1YIL042C 1185 nt14.13□□□□□ -0.15
YRA1Q12159 RPP1BYDL130W 321 nt14.07□□□□□ -0.16
YRA1Q12159 CCC1YLR220W 969 nt14.04□□□□□ -0.16
YRA1Q12159 SCJ1YMR214W 1134 nt13.96□□□□□ -0.17
YRA1Q12159 YBR190WYBR190W 312 nt13.87□□□□□ -0.19
YRA1Q12159 RTC3YHR087W 336 nt13.58□□□□□ -0.24
YRA1Q12159 RVS167YDR388W 1449 nt13.52□□□□□ -0.25
YRA1Q12159 PET122YER153C 765 nt13.47□□□□□ -0.25
YRA1Q12159 ATS1YAL020C 1002 nt13.46□□□□□ -0.25
YRA1Q12159 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.41□□□□□ -0.26
YRA1Q12159 SCR1SCR1 522 nt13.29□□□□□ -0.28
YRA1Q12159 RRN5YLR141W 1092 nt13.08□□□□□ -0.32
YRA1Q12159 SHR5YOL110W 714 nt13.07□□□□□ -0.32
YRA1Q12159 YDJ1YNL064C 1230 nt12.96□□□□□ -0.33
YRA1Q12159 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.83□□□□□ -0.36
YRA1Q12159 RSB1YOR049C 1065 nt12.8□□□□□ -0.36
YRA1Q12159 DEP1YAL013W 1218 nt12.72□□□□□ -0.37
YRA1Q12159 URN1YPR152C 1398 nt12.7□□□□□ -0.38
YRA1Q12159 GAR1YHR089C 618 nt12.69□□□□□ -0.38
YRA1Q12159 PUT4YOR348C 1884 nt12.62□□□□□ -0.39
YRA1Q12159 OPI9YLR338W 858 nt12.52□□□□□ -0.41
YRA1Q12159 YNL208WYNL208W 600 nt12.5□□□□□ -0.41
YRA1Q12159 RPN10YHR200W 807 nt12.49□□□□□ -0.41
YRA1Q12159 PST2YDR032C 597 nt12.47□□□□□ -0.41
YRA1Q12159 SAH1YER043C 1350 nt12.46□□□□□ -0.41
YRA1Q12159 ARE1YCR048W 1833 nt12.4□□□□□ -0.42
YRA1Q12159 TIR1YER011W 765 nt12.25□□□□□ -0.45
YRA1Q12159 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.23□□□□□ -0.45
YRA1Q12159 POA1YBR022W 534 nt12.23□□□□□ -0.45
YRA1Q12159 PUN1YLR414C 792 nt12.15□□□□□ -0.46
YRA1Q12159 YKL097CYKL097C 411 nt12.14□□□□□ -0.47
YRA1Q12159 SSA1YAL005C 1929 nt12.12□□□□□ -0.47
YRA1Q12159 YJR018WYJR018W 363 nt12.11□□□□□ -0.47
YRA1Q12159 PTC2YER089C 1395 nt12.02□□□□□ -0.49
YRA1Q12159 SHU1YHL006C 453 nt11.97□□□□□ -0.49
YRA1Q12159 BSC6YOL137W 1494 nt11.96□□□□□ -0.49
YRA1Q12159 YJR120WYJR120W 351 nt11.96□□□□□ -0.49
YRA1Q12159 SRB2YHR041C 633 nt11.95□□□□□ -0.5
YRA1Q12159 BUD23YCR047C 828 nt11.94□□□□□ -0.5
YRA1Q12159 RPP2BYDR382W 333 nt11.86□□□□□ -0.51
YRA1Q12159 NAB2YGL122C 1578 nt11.84□□□□□ -0.51
YRA1Q12159 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.8□□□□□ -0.52
YRA1Q12159 SSA3YBL075C 1950 nt11.72□□□□□ -0.53
YRA1Q12159 WWM1YFL010C 636 nt11.72□□□□□ -0.53
YRA1Q12159 FIS1YIL065C 468 nt11.71□□□□□ -0.53
YRA1Q12159 DAL1YIR027C 1383 nt11.7□□□□□ -0.54
YRA1Q12159 FPR4YLR449W 1179 nt11.68□□□□□ -0.54
YRA1Q12159 INM2YDR287W 879 nt11.67□□□□□ -0.54
YRA1Q12159 BDH2YAL061W 1254 nt11.63□□□□□ -0.55
YRA1Q12159 YGR021WYGR021W 873 nt11.62□□□□□ -0.55
YRA1Q12159 HOM6YJR139C 1080 nt11.61□□□□□ -0.55
YRA1Q12159 PHO4YFR034C 939 nt11.59□□□□□ -0.55
YRA1Q12159 YBL100CYBL100C 315 nt11.58□□□□□ -0.56
YRA1Q12159 YOR139CYOR139C 393 nt11.57□□□□□ -0.56
YRA1Q12159 MNP1YGL068W 585 nt11.56□□□□□ -0.56
YRA1Q12159 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.51□□□□□ -0.57
YRA1Q12159 LSM3YLR438C-A 270 nt11.48□□□□□ -0.57
YRA1Q12159 FUN26YAL022C 1554 nt11.45□□□□□ -0.58
YRA1Q12159 RKM5YLR137W 1104 nt11.44□□□□□ -0.58
YRA1Q12159 TRM9YML014W 840 nt11.41□□□□□ -0.58
YRA1Q12159 SPT5YML010W 3192 nt11.4□□□□□ -0.58
YRA1Q12159 NPL3YDR432W 1245 nt11.39□□□□□ -0.59
YRA1Q12159 YPS1YLR120C 1710 nt11.37□□□□□ -0.59
YRA1Q12159 YOL037CYOL037C 354 nt11.34□□□□□ -0.59
YRA1Q12159 CCT6YDR188W 1641 nt11.3□□□□□ -0.6
YRA1Q12159 YDR095CYDR095C 411 nt11.29□□□□□ -0.6
YRA1Q12159 ALF1YNL148C 765 nt11.27□□□□□ -0.61
YRA1Q12159 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.23□□□□□ -0.61
YRA1Q12159 MEP2YNL142W 1500 nt11.22□□□□□ -0.61
YRA1Q12159 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.19□□□□□ -0.62
YRA1Q12159 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.19□□□□□ -0.62
YRA1Q12159 SIS1YNL007C 1059 nt11.11□□□□□ -0.63
YRA1Q12159 YLR281CYLR281C 468 nt11.1□□□□□ -0.63
YRA1Q12159 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.09□□□□□ -0.63
YRA1Q12159 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.09□□□□□ -0.63
YRA1Q12159 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.09□□□□□ -0.63
YRA1Q12159 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.09□□□□□ -0.63
YRA1Q12159 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.09□□□□□ -0.63
YRA1Q12159 RPP2AYOL039W 321 nt11.08□□□□□ -0.64
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