Protein–RNA interactions for Protein: P14693

SAM35, Sorting assembly machinery 35 kDa subunit, yeastyeast

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SAM35P14693 NSR1YGR159C 1245 nt18.6■□□□□ 0.57
SAM35P14693 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.35■□□□□ 0.53
SAM35P14693 NOP1YDL014W 984 nt17.67■□□□□ 0.42
SAM35P14693 MDJ1YFL016C 1536 nt16.91■□□□□ 0.3
SAM35P14693 YKL036CYKL036C 393 nt15.93■□□□□ 0.14
SAM35P14693 YJL027CYJL027C 417 nt15.55■□□□□ 0.08
SAM35P14693 SRX1YKL086W 384 nt15.45■□□□□ 0.06
SAM35P14693 Q0297Q0297 156 nt15.35■□□□□ 0.05
SAM35P14693 DBP2YNL112W 1641 nt14.81□□□□□ -0.04
SAM35P14693 YCR051WYCR051W 669 nt14.6□□□□□ -0.07
SAM35P14693 YBR190WYBR190W 312 nt14.52□□□□□ -0.09
SAM35P14693 SCS3YGL126W 1143 nt14.3□□□□□ -0.12
SAM35P14693 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.23□□□□□ -0.13
SAM35P14693 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.23□□□□□ -0.13
SAM35P14693 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.23□□□□□ -0.13
SAM35P14693 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.23□□□□□ -0.13
SAM35P14693 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.23□□□□□ -0.13
SAM35P14693 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.23□□□□□ -0.13
SAM35P14693 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.23□□□□□ -0.13
SAM35P14693 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.23□□□□□ -0.13
SAM35P14693 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.23□□□□□ -0.13
SAM35P14693 RTC3YHR087W 336 nt14.15□□□□□ -0.14
SAM35P14693 CCC1YLR220W 969 nt14.04□□□□□ -0.16
SAM35P14693 YOL085CYOL085C 342 nt13.82□□□□□ -0.2
SAM35P14693 RVS167YDR388W 1449 nt13.8□□□□□ -0.2
SAM35P14693 RPP1BYDL130W 321 nt13.77□□□□□ -0.21
SAM35P14693 SCJ1YMR214W 1134 nt13.69□□□□□ -0.22
SAM35P14693 PKP1YIL042C 1185 nt13.64□□□□□ -0.23
SAM35P14693 SSA3YBL075C 1950 nt13.61□□□□□ -0.23
SAM35P14693 PUT4YOR348C 1884 nt13.52□□□□□ -0.25
SAM35P14693 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.31□□□□□ -0.28
SAM35P14693 SHR5YOL110W 714 nt13.24□□□□□ -0.29
SAM35P14693 PET122YER153C 765 nt13.21□□□□□ -0.29
SAM35P14693 ARE1YCR048W 1833 nt13.15□□□□□ -0.3
SAM35P14693 URN1YPR152C 1398 nt13.12□□□□□ -0.31
SAM35P14693 SAH1YER043C 1350 nt13.04□□□□□ -0.32
SAM35P14693 POA1YBR022W 534 nt13.03□□□□□ -0.32
SAM35P14693 OPI9YLR338W 858 nt13.01□□□□□ -0.33
SAM35P14693 DEP1YAL013W 1218 nt12.98□□□□□ -0.33
SAM35P14693 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.97□□□□□ -0.33
SAM35P14693 SCR1SCR1 522 nt12.93□□□□□ -0.34
SAM35P14693 YDJ1YNL064C 1230 nt12.89□□□□□ -0.35
SAM35P14693 BSC6YOL137W 1494 nt12.85□□□□□ -0.35
SAM35P14693 RPN10YHR200W 807 nt12.82□□□□□ -0.36
SAM35P14693 RRN5YLR141W 1092 nt12.77□□□□□ -0.37
SAM35P14693 YNL208WYNL208W 600 nt12.75□□□□□ -0.37
SAM35P14693 ATS1YAL020C 1002 nt12.66□□□□□ -0.38
SAM35P14693 GAR1YHR089C 618 nt12.64□□□□□ -0.39
SAM35P14693 PUN1YLR414C 792 nt12.63□□□□□ -0.39
SAM35P14693 BUD23YCR047C 828 nt12.61□□□□□ -0.39
SAM35P14693 SPT5YML010W 3192 nt12.6□□□□□ -0.39
SAM35P14693 PTC2YER089C 1395 nt12.54□□□□□ -0.4
SAM35P14693 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.53□□□□□ -0.4
SAM35P14693 Q0182Q0182 405 nt12.49□□□□□ -0.41
SAM35P14693 YJR018WYJR018W 363 nt12.48□□□□□ -0.41
SAM35P14693 NAB2YGL122C 1578 nt12.43□□□□□ -0.42
SAM35P14693 RSB1YOR049C 1065 nt12.38□□□□□ -0.43
SAM35P14693 MOT3YMR070W 1473 nt12.34□□□□□ -0.43
SAM35P14693 SSA4YER103W 1929 nt12.31□□□□□ -0.44
SAM35P14693 FIS1YIL065C 468 nt12.26□□□□□ -0.45
SAM35P14693 TIR1YER011W 765 nt12.25□□□□□ -0.45
SAM35P14693 YJR120WYJR120W 351 nt12.25□□□□□ -0.45
SAM35P14693 DAL1YIR027C 1383 nt12.19□□□□□ -0.46
SAM35P14693 SSA1YAL005C 1929 nt12.19□□□□□ -0.46
SAM35P14693 FPR4YLR449W 1179 nt12.13□□□□□ -0.47
SAM35P14693 RPP2BYDR382W 333 nt12.11□□□□□ -0.47
SAM35P14693 MEP2YNL142W 1500 nt12.11□□□□□ -0.47
SAM35P14693 PHO4YFR034C 939 nt12.1□□□□□ -0.47
SAM35P14693 INM2YDR287W 879 nt12.09□□□□□ -0.47
SAM35P14693 YPS1YLR120C 1710 nt12.01□□□□□ -0.49
SAM35P14693 SRB2YHR041C 633 nt11.94□□□□□ -0.5
SAM35P14693 YBL100CYBL100C 315 nt11.92□□□□□ -0.5
SAM35P14693 DCW1YKL046C 1350 nt11.92□□□□□ -0.5
SAM35P14693 BDF1YLR399C 2061 nt11.89□□□□□ -0.51
SAM35P14693 YDR095CYDR095C 411 nt11.88□□□□□ -0.51
SAM35P14693 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.88□□□□□ -0.51
SAM35P14693 BDH2YAL061W 1254 nt11.82□□□□□ -0.52
SAM35P14693 PST2YDR032C 597 nt11.81□□□□□ -0.52
SAM35P14693 FUN26YAL022C 1554 nt11.76□□□□□ -0.53
SAM35P14693 EMI2YDR516C 1503 nt11.74□□□□□ -0.53
SAM35P14693 TAT1YBR069C 1860 nt11.73□□□□□ -0.53
SAM35P14693 YBR220CYBR220C 1683 nt11.67□□□□□ -0.54
SAM35P14693 PTP1YDL230W 1008 nt11.66□□□□□ -0.54
SAM35P14693 YMR090WYMR090W 684 nt11.66□□□□□ -0.54
SAM35P14693 ALF1YNL148C 765 nt11.66□□□□□ -0.54
SAM35P14693 WWM1YFL010C 636 nt11.64□□□□□ -0.55
SAM35P14693 TRM9YML014W 840 nt11.64□□□□□ -0.55
SAM35P14693 RPP2AYOL039W 321 nt11.64□□□□□ -0.55
SAM35P14693 YDL221WYDL221W 552 nt11.63□□□□□ -0.55
SAM35P14693 CAC2YML102W 1407 nt11.62□□□□□ -0.55
SAM35P14693 CCT6YDR188W 1641 nt11.58□□□□□ -0.56
SAM35P14693 LSM3YLR438C-A 270 nt11.58□□□□□ -0.56
SAM35P14693 SDH1YKL148C 1923 nt11.56□□□□□ -0.56
SAM35P14693 SIS1YNL007C 1059 nt11.52□□□□□ -0.57
SAM35P14693 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.49□□□□□ -0.57
SAM35P14693 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.49□□□□□ -0.57
SAM35P14693 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.47□□□□□ -0.57
SAM35P14693 IRC15YPL017C 1500 nt11.46□□□□□ -0.57
SAM35P14693 YGR021WYGR021W 873 nt11.45□□□□□ -0.58
SAM35P14693 SCC4YER147C 1875 nt11.43□□□□□ -0.58
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