RNA–Protein interactions for RNA: YGL246C

RAI1, Transcript of Nuclear protein with decapping endonuclease activity, yeast

Gene RAI1, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAI1	YGL246C	YGR210C	P42942	411 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAI1	YGL246C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RAI1	YGL246C	YAP3	P38749	330 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	ZIM17	P42844	174 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	NCA3	P46955	337 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	HER2	Q03557	464 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	TMS1	Q12116	473 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	SWH1	P35845	1188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	MTR10	Q99189	972 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	SPO12	P17123	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	YML6	P51998	286 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	OCA2	P53949	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	URH1	Q04179	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	SMA2	Q04658	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	AIM32	Q04689	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	VPS54	Q12071	889 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	ATG34	Q12292	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	VMR1	P38735	1592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	IML1	P47170	1584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
RAI1	YGL246C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	SDS24	P38314	527 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	AZR1	P50080	613 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	SRL2	Q12020	392 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	COX3	P00420	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	SER3	P40054	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	VHS2	P40463	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	PHB2	P50085	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	MTM1	P53320	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	USO1	P25386	1790 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	RAD57	P25301	460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	TOA1	P32773	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	YPS6	P40583	537 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	SFH5	P47008	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	TRP1	P00912	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	PET123	P17558	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	YGR111W	P53265	400 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	BCH1	Q05029	724 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	AEP3	Q12089	606 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	RUP1	Q12242	671 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAI1	YGL246C	HOM3	P10869	527 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	REV1	P12689	985 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	DAL2	P25335	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	MNS1	P32906	549 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	GAT2	P40209	560 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
RAI1	YGL246C	CIK1	Q01649	594 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	UAF30	Q08747	228 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	LTV1	P34078	463 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	PXA2	P34230	853 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	JLP2	P40206	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	PAN6	P40459	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	IMA2	Q08295	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	CYC3	P06182	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	KAR9	P32526	644 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	YEL045C	P32616	141 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	MSG5	P38590	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	ERP4	Q12450	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	CLN3	P13365	580 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	LDB16	P25587	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	HEL1	P36113	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	YBR056W	P38081	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAI1	YGL246C	SWD3	P38123	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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