RNA–Protein interactions for RNA: YLR119W

SRN2, Transcript of Component of the ESCRT-I complex, yeast

Gene SRN2, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRN2	YLR119W	RAD57	P25301	460 aa		5	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	ERV1	P27882	189 aa		5	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	YBR056W	P38081	501 aa		5	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	ZIM17	P42844	174 aa		5	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	SFH5	P47008	294 aa		5	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	TCB2	P48231	1178 aa		5	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	OCA2	P53949	197 aa		5	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	OAZ1	Q02803	292 aa		5	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	BCH1	Q05029	724 aa		5	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	MRPL35	Q06678	367 aa		5	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	YBR137W	P38276	179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	PAN6	P40459	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	PHB2	P50085	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	URH1	Q04179	340 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	NDE2	Q07500	545 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	AEP3	Q12089	606 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	VHS2	P40463	436 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	PEX25	Q02969	394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	AIM32	Q04689	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	POP5	P28005	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	MTM1	P53320	366 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	HRT3	Q12347	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	CEX1	Q12453	761 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SRN2	YLR119W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	PXA2	P34230	853 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	MSG5	P38590	489 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	JLP2	P40206	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	MMT1	Q03218	510 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	CLN3	P13365	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	KAR9	P32526	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	GAT2	P40209	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	YPS6	P40583	537 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	YML6	P51998	286 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	YGR111W	P53265	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	CIK1	Q01649	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
SRN2	YLR119W	BRO1	P48582	844 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	IRC25	Q07951	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	RAX1	Q08760	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	FDH1	Q08911	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	CYC3	P06182	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	LTV1	P34078	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	SWD3	P38123	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	MTQ1	P53944	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	STD1	Q02794	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	YRM1	Q12340	786 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	YCL068C	P25593	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	CHK1	P38147	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	COX14	P39103	70 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	MDE1	P47095	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	IMA2	Q08295	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	DCI1	Q08558	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	COX3	P00420	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	SER3	P40054	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	YIL029C	P40538	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	ALF1	P53904	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRN2	YLR119W	DST1	P07273	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	NAM2	P11325	894 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	SPR1	P32603	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	HEL1	P36113	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	VPS9	P54787	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	MHR1	Q06630	226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	RBD2	Q12270	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	STN1	P38960	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	SHY1	P53266	389 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	CCE1	Q03702	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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