Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.29■□□□□ 0.84
CCE1Q03702 NSR1YGR159C 1245 nt20.11■□□□□ 0.81
CCE1Q03702 NOP1YDL014W 984 nt19.83■□□□□ 0.77
CCE1Q03702 YKL036CYKL036C 393 nt18.3■□□□□ 0.52
CCE1Q03702 MDJ1YFL016C 1536 nt17.72■□□□□ 0.43
CCE1Q03702 Q0297Q0297 156 nt17.28■□□□□ 0.36
CCE1Q03702 SRX1YKL086W 384 nt17.25■□□□□ 0.35
CCE1Q03702 YJL027CYJL027C 417 nt17.1■□□□□ 0.33
CCE1Q03702 SCS3YGL126W 1143 nt16.6■□□□□ 0.25
CCE1Q03702 YCR051WYCR051W 669 nt16.41■□□□□ 0.22
CCE1Q03702 YOL085CYOL085C 342 nt15.79■□□□□ 0.12
CCE1Q03702 DBP2YNL112W 1641 nt15.62■□□□□ 0.09
CCE1Q03702 PKP1YIL042C 1185 nt15.53■□□□□ 0.08
CCE1Q03702 RPP1BYDL130W 321 nt15.52■□□□□ 0.08
CCE1Q03702 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.51■□□□□ 0.07
CCE1Q03702 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.51■□□□□ 0.07
CCE1Q03702 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.51■□□□□ 0.07
CCE1Q03702 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.51■□□□□ 0.07
CCE1Q03702 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.51■□□□□ 0.07
CCE1Q03702 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.51■□□□□ 0.07
CCE1Q03702 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.51■□□□□ 0.07
CCE1Q03702 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.51■□□□□ 0.07
CCE1Q03702 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.51■□□□□ 0.07
CCE1Q03702 CCC1YLR220W 969 nt15.41■□□□□ 0.06
CCE1Q03702 YBR190WYBR190W 312 nt15.16■□□□□ 0.02
CCE1Q03702 RVS167YDR388W 1449 nt14.94□□□□□ -0.02
CCE1Q03702 RTC3YHR087W 336 nt14.89□□□□□ -0.03
CCE1Q03702 ATS1YAL020C 1002 nt14.88□□□□□ -0.03
CCE1Q03702 SCJ1YMR214W 1134 nt14.86□□□□□ -0.03
CCE1Q03702 SCR1SCR1 522 nt14.78□□□□□ -0.04
CCE1Q03702 PET122YER153C 765 nt14.77□□□□□ -0.05
CCE1Q03702 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.72□□□□□ -0.05
CCE1Q03702 RRN5YLR141W 1092 nt14.38□□□□□ -0.11
CCE1Q03702 SHR5YOL110W 714 nt14.35□□□□□ -0.11
CCE1Q03702 YDJ1YNL064C 1230 nt14.26□□□□□ -0.13
CCE1Q03702 RSB1YOR049C 1065 nt14.16□□□□□ -0.14
CCE1Q03702 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.08□□□□□ -0.16
CCE1Q03702 GAR1YHR089C 618 nt13.93□□□□□ -0.18
CCE1Q03702 URN1YPR152C 1398 nt13.89□□□□□ -0.19
CCE1Q03702 DEP1YAL013W 1218 nt13.89□□□□□ -0.19
CCE1Q03702 RPN10YHR200W 807 nt13.82□□□□□ -0.2
CCE1Q03702 PST2YDR032C 597 nt13.74□□□□□ -0.21
CCE1Q03702 YNL208WYNL208W 600 nt13.74□□□□□ -0.21
CCE1Q03702 OPI9YLR338W 858 nt13.67□□□□□ -0.22
CCE1Q03702 PUT4YOR348C 1884 nt13.59□□□□□ -0.23
CCE1Q03702 SAH1YER043C 1350 nt13.54□□□□□ -0.24
CCE1Q03702 TIR1YER011W 765 nt13.45□□□□□ -0.26
CCE1Q03702 ARE1YCR048W 1833 nt13.37□□□□□ -0.27
CCE1Q03702 PUN1YLR414C 792 nt13.34□□□□□ -0.27
CCE1Q03702 YKL097CYKL097C 411 nt13.32□□□□□ -0.28
CCE1Q03702 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.28□□□□□ -0.28
CCE1Q03702 YJR018WYJR018W 363 nt13.28□□□□□ -0.28
CCE1Q03702 POA1YBR022W 534 nt13.25□□□□□ -0.29
CCE1Q03702 SSA1YAL005C 1929 nt13.19□□□□□ -0.3
CCE1Q03702 SHU1YHL006C 453 nt13.16□□□□□ -0.3
CCE1Q03702 RPP2BYDR382W 333 nt13.12□□□□□ -0.31
CCE1Q03702 PTC2YER089C 1395 nt13.1□□□□□ -0.31
CCE1Q03702 BUD23YCR047C 828 nt13.03□□□□□ -0.32
CCE1Q03702 NAB2YGL122C 1578 nt12.95□□□□□ -0.34
CCE1Q03702 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.94□□□□□ -0.34
CCE1Q03702 BSC6YOL137W 1494 nt12.93□□□□□ -0.34
CCE1Q03702 YJR120WYJR120W 351 nt12.92□□□□□ -0.34
CCE1Q03702 YGR021WYGR021W 873 nt12.88□□□□□ -0.35
CCE1Q03702 SRB2YHR041C 633 nt12.88□□□□□ -0.35
CCE1Q03702 INM2YDR287W 879 nt12.84□□□□□ -0.35
CCE1Q03702 WWM1YFL010C 636 nt12.84□□□□□ -0.35
CCE1Q03702 FPR4YLR449W 1179 nt12.8□□□□□ -0.36
CCE1Q03702 DAL1YIR027C 1383 nt12.78□□□□□ -0.36
CCE1Q03702 BDH2YAL061W 1254 nt12.77□□□□□ -0.37
CCE1Q03702 SSA3YBL075C 1950 nt12.76□□□□□ -0.37
CCE1Q03702 HOM6YJR139C 1080 nt12.74□□□□□ -0.37
CCE1Q03702 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.69□□□□□ -0.38
CCE1Q03702 YBL100CYBL100C 315 nt12.69□□□□□ -0.38
CCE1Q03702 NPL3YDR432W 1245 nt12.68□□□□□ -0.38
CCE1Q03702 FIS1YIL065C 468 nt12.68□□□□□ -0.38
CCE1Q03702 MNP1YGL068W 585 nt12.66□□□□□ -0.38
CCE1Q03702 LSM3YLR438C-A 270 nt12.65□□□□□ -0.38
CCE1Q03702 YOR139CYOR139C 393 nt12.65□□□□□ -0.38
CCE1Q03702 PHO4YFR034C 939 nt12.64□□□□□ -0.39
CCE1Q03702 TRM9YML014W 840 nt12.58□□□□□ -0.4
CCE1Q03702 YOL037CYOL037C 354 nt12.58□□□□□ -0.4
CCE1Q03702 RKM5YLR137W 1104 nt12.57□□□□□ -0.4
CCE1Q03702 FUN26YAL022C 1554 nt12.52□□□□□ -0.41
CCE1Q03702 ALF1YNL148C 765 nt12.43□□□□□ -0.42
CCE1Q03702 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.37□□□□□ -0.43
CCE1Q03702 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.37□□□□□ -0.43
CCE1Q03702 CCT6YDR188W 1641 nt12.37□□□□□ -0.43
CCE1Q03702 YPS1YLR120C 1710 nt12.34□□□□□ -0.43
CCE1Q03702 YDR095CYDR095C 411 nt12.29□□□□□ -0.44
CCE1Q03702 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.28□□□□□ -0.44
CCE1Q03702 YLR281CYLR281C 468 nt12.22□□□□□ -0.45
CCE1Q03702 WHI5YOR083W 888 nt12.19□□□□□ -0.46
CCE1Q03702 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.18□□□□□ -0.46
CCE1Q03702 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.18□□□□□ -0.46
CCE1Q03702 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.18□□□□□ -0.46
CCE1Q03702 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.18□□□□□ -0.46
CCE1Q03702 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.18□□□□□ -0.46
CCE1Q03702 PUS2YGL063W 1113 nt12.15□□□□□ -0.46
CCE1Q03702 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.13□□□□□ -0.47
CCE1Q03702 MEP2YNL142W 1500 nt12.12□□□□□ -0.47
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