RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeastyeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15YER148W YCR100CP25606 316 aa3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W ECM25P32525 599 aa3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W GLC7P32598 312 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W ARA1P38115 344 aa3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W VHC1P38329 1120 aa3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W RFC3P38629 340 aa3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W VAB2P40003 282 aa3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W AVT4P50944 713 aa3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W BOR1P53838 576 aa3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W DSL1P53847 754 aa3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W SIL1Q08199 421 aa3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W HNT3Q08702 217 aa3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W HSP42Q12329 375 aa3.61□□□□□ -1.83
SPT15YER148W HIS4P00815 799 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W PDX1P16451 410 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W RPC53P25441 422 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W YCR051WP25631 222 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W ADK2P26364 225 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W SIN4P32259 974 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W YME2P32843 850 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W KAP120Q02932 1032 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W MRP51Q02950 344 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W PIR3Q03180 325 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W YDR131CQ03899 556 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W DON1Q05610 365 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W ISN1Q99312 450 aa3.6□□□□□ -1.83
SPT15YER148W GEX1P25596 615 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W SPL2P38839 148 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W SSU1P41930 458 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W ECM27P47144 725 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W SSN8P47821 323 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W YIP1P53039 248 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W YGL138CP53122 345 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W POP6P53218 158 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W RPT4P53549 437 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W SKO1Q02100 647 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W TLG2Q08144 397 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W VAM3Q12241 283 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W YCL021W-AQ96VH3 125 aa3.59□□□□□ -1.83
SPT15YER148W CBS2P14905 389 aa3.58□□□□□ -1.84
SPT15YER148W APE2P32454 952 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YCR041WP37265 110 aa3.58□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YHR054CP38780 354 aa3.58□□□□□ -1.84
SPT15YER148W SAS2P40963 338 aa3.58□□□□□ -1.84
SPT15YER148W PCP1P53259 346 aa3.58□□□□□ -1.84
SPT15YER148W WSC2P53832 503 aa3.58□□□□□ -1.84
SPT15YER148W IBD2P53892 351 aa3.58□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YDR387CQ04162 555 aa3.58□□□□□ -1.84
SPT15YER148W ROY1Q04847 553 aa3.58□□□□□ -1.84
SPT15YER148W MDM30Q05930 598 aa3.58□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YLL056CQ12177 298 aa3.58□□□□□ -1.84
SPT15YER148W CPR1P14832 162 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT15YER148W HEM15P16622 393 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT15YER148W MRP4P32902 394 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT15YER148W MPE1P35728 441 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT15YER148W PCA1P38360 1216 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT15YER148W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT15YER148W MKT1P40850 830 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT15YER148W BNI5P53890 448 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT15YER148W SCW10Q04951 389 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT15YER148W SGT1Q08446 395 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT15YER148W MUM3Q08750 479 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT15YER148W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT15YER148W URA7P28274 579 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT15YER148W HIR2P32480 875 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT15YER148W STB6P36085 766 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT15YER148W MIX23P38162 196 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT15YER148W MST28P39552 234 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT15YER148W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT15YER148W RRN11Q04712 507 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YPL199CQ08954 240 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YER078W-AQ3E7A2 54 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT15YER148W AFI1Q99222 893 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT15YER148W SCEIP03882 235 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W RPI1P23250 407 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W SPS22P25380 463 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W BEM1P29366 551 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W AVT5P38176 459 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YPI1P43587 155 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YNR048WP53740 393 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W THP3Q12049 470 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W MED2Q12124 431 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W RAD61Q99359 647 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT15YER148W CHS1P08004 1131 aa3.54□□□□□ -1.84
SPT15YER148W RHB1P25378 209 aa3.54□□□□□ -1.84
SPT15YER148W NAT2P37293 288 aa3.54□□□□□ -1.84
SPT15YER148W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data3.54□□□□□ -1.84not detected
SPT15YER148W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SPT15YER148W TOM22P49334 152 aa3.54□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YGL242CP53066 181 aa3.54□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YIF1P53845 314 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
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