Protein–RNA interactions for Protein: Q08446

SGT1, Protein SGT1, yeastyeast

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGT1Q08446 NSR1YGR159C 1245 nt19.8■□□□□ 0.76
SGT1Q08446 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.57■□□□□ 0.72
SGT1Q08446 NOP1YDL014W 984 nt18.95■□□□□ 0.62
SGT1Q08446 MDJ1YFL016C 1536 nt17.8■□□□□ 0.44
SGT1Q08446 YKL036CYKL036C 393 nt17.19■□□□□ 0.34
SGT1Q08446 SRX1YKL086W 384 nt16.56■□□□□ 0.24
SGT1Q08446 Q0297Q0297 156 nt16.51■□□□□ 0.23
SGT1Q08446 YJL027CYJL027C 417 nt16.43■□□□□ 0.22
SGT1Q08446 DBP2YNL112W 1641 nt15.67■□□□□ 0.1
SGT1Q08446 YCR051WYCR051W 669 nt15.64■□□□□ 0.09
SGT1Q08446 SCS3YGL126W 1143 nt15.46■□□□□ 0.07
SGT1Q08446 YBR190WYBR190W 312 nt15.32■□□□□ 0.04
SGT1Q08446 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.16■□□□□ 0.02
SGT1Q08446 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.16■□□□□ 0.02
SGT1Q08446 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.16■□□□□ 0.02
SGT1Q08446 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.16■□□□□ 0.02
SGT1Q08446 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.16■□□□□ 0.02
SGT1Q08446 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.16■□□□□ 0.02
SGT1Q08446 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.16■□□□□ 0.02
SGT1Q08446 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.16■□□□□ 0.02
SGT1Q08446 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.16■□□□□ 0.02
SGT1Q08446 CCC1YLR220W 969 nt14.95□□□□□ -0.02
SGT1Q08446 YOL085CYOL085C 342 nt14.91□□□□□ -0.02
SGT1Q08446 RTC3YHR087W 336 nt14.9□□□□□ -0.02
SGT1Q08446 RPP1BYDL130W 321 nt14.79□□□□□ -0.04
SGT1Q08446 PKP1YIL042C 1185 nt14.66□□□□□ -0.06
SGT1Q08446 RVS167YDR388W 1449 nt14.65□□□□□ -0.06
SGT1Q08446 SSA3YBL075C 1950 nt14.54□□□□□ -0.08
SGT1Q08446 SCJ1YMR214W 1134 nt14.5□□□□□ -0.09
SGT1Q08446 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.23□□□□□ -0.13
SGT1Q08446 PET122YER153C 765 nt14.15□□□□□ -0.14
SGT1Q08446 PUT4YOR348C 1884 nt14.14□□□□□ -0.15
SGT1Q08446 SHR5YOL110W 714 nt14.08□□□□□ -0.16
SGT1Q08446 SCR1SCR1 522 nt13.92□□□□□ -0.18
SGT1Q08446 URN1YPR152C 1398 nt13.85□□□□□ -0.19
SGT1Q08446 YDJ1YNL064C 1230 nt13.8□□□□□ -0.2
SGT1Q08446 ARE1YCR048W 1833 nt13.78□□□□□ -0.2
SGT1Q08446 ATS1YAL020C 1002 nt13.76□□□□□ -0.21
SGT1Q08446 OPI9YLR338W 858 nt13.75□□□□□ -0.21
SGT1Q08446 DEP1YAL013W 1218 nt13.73□□□□□ -0.21
SGT1Q08446 RRN5YLR141W 1092 nt13.73□□□□□ -0.21
SGT1Q08446 SAH1YER043C 1350 nt13.71□□□□□ -0.22
SGT1Q08446 POA1YBR022W 534 nt13.65□□□□□ -0.22
SGT1Q08446 RPN10YHR200W 807 nt13.59□□□□□ -0.23
SGT1Q08446 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.58□□□□□ -0.24
SGT1Q08446 YNL208WYNL208W 600 nt13.53□□□□□ -0.24
SGT1Q08446 GAR1YHR089C 618 nt13.48□□□□□ -0.25
SGT1Q08446 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.45□□□□□ -0.26
SGT1Q08446 BSC6YOL137W 1494 nt13.42□□□□□ -0.26
SGT1Q08446 PUN1YLR414C 792 nt13.34□□□□□ -0.27
SGT1Q08446 RSB1YOR049C 1065 nt13.31□□□□□ -0.28
SGT1Q08446 PTC2YER089C 1395 nt13.21□□□□□ -0.29
SGT1Q08446 BUD23YCR047C 828 nt13.21□□□□□ -0.29
SGT1Q08446 YJR018WYJR018W 363 nt13.2□□□□□ -0.3
SGT1Q08446 NAB2YGL122C 1578 nt13.1□□□□□ -0.31
SGT1Q08446 SPT5YML010W 3192 nt13.08□□□□□ -0.32
SGT1Q08446 TIR1YER011W 765 nt13.07□□□□□ -0.32
SGT1Q08446 SSA1YAL005C 1929 nt12.97□□□□□ -0.33
SGT1Q08446 YJR120WYJR120W 351 nt12.96□□□□□ -0.33
SGT1Q08446 FIS1YIL065C 468 nt12.88□□□□□ -0.35
SGT1Q08446 DAL1YIR027C 1383 nt12.86□□□□□ -0.35
SGT1Q08446 RPP2BYDR382W 333 nt12.85□□□□□ -0.35
SGT1Q08446 PST2YDR032C 597 nt12.82□□□□□ -0.36
SGT1Q08446 INM2YDR287W 879 nt12.8□□□□□ -0.36
SGT1Q08446 FPR4YLR449W 1179 nt12.78□□□□□ -0.36
SGT1Q08446 PHO4YFR034C 939 nt12.73□□□□□ -0.37
SGT1Q08446 SSA4YER103W 1929 nt12.72□□□□□ -0.37
SGT1Q08446 SRB2YHR041C 633 nt12.69□□□□□ -0.38
SGT1Q08446 MEP2YNL142W 1500 nt12.64□□□□□ -0.39
SGT1Q08446 YPS1YLR120C 1710 nt12.61□□□□□ -0.39
SGT1Q08446 YBL100CYBL100C 315 nt12.6□□□□□ -0.39
SGT1Q08446 BDH2YAL061W 1254 nt12.56□□□□□ -0.4
SGT1Q08446 YDR095CYDR095C 411 nt12.49□□□□□ -0.41
SGT1Q08446 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.46□□□□□ -0.41
SGT1Q08446 FUN26YAL022C 1554 nt12.45□□□□□ -0.42
SGT1Q08446 WWM1YFL010C 636 nt12.43□□□□□ -0.42
SGT1Q08446 DCW1YKL046C 1350 nt12.42□□□□□ -0.42
SGT1Q08446 LSM3YLR438C-A 270 nt12.37□□□□□ -0.43
SGT1Q08446 TRM9YML014W 840 nt12.37□□□□□ -0.43
SGT1Q08446 SHU1YHL006C 453 nt12.34□□□□□ -0.43
SGT1Q08446 ALF1YNL148C 765 nt12.32□□□□□ -0.44
SGT1Q08446 BDF1YLR399C 2061 nt12.31□□□□□ -0.44
SGT1Q08446 YGR021WYGR021W 873 nt12.28□□□□□ -0.44
SGT1Q08446 CCT6YDR188W 1641 nt12.28□□□□□ -0.44
SGT1Q08446 EMI2YDR516C 1503 nt12.27□□□□□ -0.45
SGT1Q08446 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.26□□□□□ -0.45
SGT1Q08446 PTP1YDL230W 1008 nt12.25□□□□□ -0.45
SGT1Q08446 RPP2AYOL039W 321 nt12.25□□□□□ -0.45
SGT1Q08446 HOM6YJR139C 1080 nt12.23□□□□□ -0.45
SGT1Q08446 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.21□□□□□ -0.45
SGT1Q08446 YMR090WYMR090W 684 nt12.21□□□□□ -0.45
SGT1Q08446 PAC11YDR488C 1602 nt12.19□□□□□ -0.46
SGT1Q08446 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.18□□□□□ -0.46
SGT1Q08446 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.18□□□□□ -0.46
SGT1Q08446 SIS1YNL007C 1059 nt12.18□□□□□ -0.46
SGT1Q08446 CAC2YML102W 1407 nt12.18□□□□□ -0.46
SGT1Q08446 YDL221WYDL221W 552 nt12.16□□□□□ -0.46
SGT1Q08446 YBR220CYBR220C 1683 nt12.15□□□□□ -0.46
SGT1Q08446 TAT1YBR069C 1860 nt12.14□□□□□ -0.47
SGT1Q08446 YKL097CYKL097C 411 nt12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 392.2 ms