Protein–RNA interactions for Protein: Q12754

RRP12, Ribosomal RNA-processing protein 12, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP12Q12754 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.72■□□□□ 0.75
RRP12Q12754 NSR1YGR159C 1245 nt19.44■□□□□ 0.7
RRP12Q12754 NOP1YDL014W 984 nt19.29■□□□□ 0.68
RRP12Q12754 YKL036CYKL036C 393 nt17.98■□□□□ 0.47
RRP12Q12754 MDJ1YFL016C 1536 nt17.02■□□□□ 0.32
RRP12Q12754 Q0297Q0297 156 nt16.94■□□□□ 0.3
RRP12Q12754 SRX1YKL086W 384 nt16.84■□□□□ 0.29
RRP12Q12754 YJL027CYJL027C 417 nt16.81■□□□□ 0.28
RRP12Q12754 SCS3YGL126W 1143 nt16.44■□□□□ 0.22
RRP12Q12754 YCR051WYCR051W 669 nt15.98■□□□□ 0.15
RRP12Q12754 YOL085CYOL085C 342 nt15.55■□□□□ 0.08
RRP12Q12754 PKP1YIL042C 1185 nt15.26■□□□□ 0.03
RRP12Q12754 RPP1BYDL130W 321 nt15.2■□□□□ 0.02
RRP12Q12754 DBP2YNL112W 1641 nt15.13■□□□□ 0.01
RRP12Q12754 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.1■□□□□ 0.01
RRP12Q12754 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.1■□□□□ 0.01
RRP12Q12754 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.1■□□□□ 0.01
RRP12Q12754 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.1■□□□□ 0.01
RRP12Q12754 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.1■□□□□ 0.01
RRP12Q12754 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.1■□□□□ 0.01
RRP12Q12754 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.1■□□□□ 0.01
RRP12Q12754 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.1■□□□□ 0.01
RRP12Q12754 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.1■□□□□ 0.01
RRP12Q12754 CCC1YLR220W 969 nt14.92□□□□□ -0.02
RRP12Q12754 SCJ1YMR214W 1134 nt14.87□□□□□ -0.03
RRP12Q12754 ATS1YAL020C 1002 nt14.77□□□□□ -0.05
RRP12Q12754 YBR190WYBR190W 312 nt14.5□□□□□ -0.09
RRP12Q12754 PET122YER153C 765 nt14.47□□□□□ -0.09
RRP12Q12754 SCR1SCR1 522 nt14.41□□□□□ -0.1
RRP12Q12754 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.35□□□□□ -0.11
RRP12Q12754 RVS167YDR388W 1449 nt14.34□□□□□ -0.11
RRP12Q12754 RTC3YHR087W 336 nt14.18□□□□□ -0.14
RRP12Q12754 RRN5YLR141W 1092 nt14.08□□□□□ -0.16
RRP12Q12754 SSA3YBL075C 1950 nt13.97□□□□□ -0.17
RRP12Q12754 YDJ1YNL064C 1230 nt13.9□□□□□ -0.18
RRP12Q12754 SHR5YOL110W 714 nt13.88□□□□□ -0.19
RRP12Q12754 RSB1YOR049C 1065 nt13.87□□□□□ -0.19
RRP12Q12754 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.81□□□□□ -0.2
RRP12Q12754 PST2YDR032C 597 nt13.63□□□□□ -0.23
RRP12Q12754 GAR1YHR089C 618 nt13.53□□□□□ -0.24
RRP12Q12754 DEP1YAL013W 1218 nt13.38□□□□□ -0.27
RRP12Q12754 URN1YPR152C 1398 nt13.34□□□□□ -0.27
RRP12Q12754 RPN10YHR200W 807 nt13.24□□□□□ -0.29
RRP12Q12754 YNL208WYNL208W 600 nt13.23□□□□□ -0.29
RRP12Q12754 YKL097CYKL097C 411 nt13.22□□□□□ -0.29
RRP12Q12754 PUT4YOR348C 1884 nt13.19□□□□□ -0.3
RRP12Q12754 OPI9YLR338W 858 nt13.12□□□□□ -0.31
RRP12Q12754 TIR1YER011W 765 nt13.07□□□□□ -0.32
RRP12Q12754 SHU1YHL006C 453 nt13.03□□□□□ -0.32
RRP12Q12754 SAH1YER043C 1350 nt12.95□□□□□ -0.34
RRP12Q12754 SSA1YAL005C 1929 nt12.84□□□□□ -0.35
RRP12Q12754 ARE1YCR048W 1833 nt12.83□□□□□ -0.35
RRP12Q12754 POA1YBR022W 534 nt12.78□□□□□ -0.36
RRP12Q12754 PUN1YLR414C 792 nt12.76□□□□□ -0.37
RRP12Q12754 YJR018WYJR018W 363 nt12.75□□□□□ -0.37
RRP12Q12754 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.74□□□□□ -0.37
RRP12Q12754 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.69□□□□□ -0.38
RRP12Q12754 SRB2YHR041C 633 nt12.64□□□□□ -0.39
RRP12Q12754 YOR139CYOR139C 393 nt12.63□□□□□ -0.39
RRP12Q12754 RPP2BYDR382W 333 nt12.58□□□□□ -0.4
RRP12Q12754 YJR120WYJR120W 351 nt12.57□□□□□ -0.4
RRP12Q12754 YGR021WYGR021W 873 nt12.56□□□□□ -0.4
RRP12Q12754 BSC6YOL137W 1494 nt12.55□□□□□ -0.4
RRP12Q12754 PTC2YER089C 1395 nt12.53□□□□□ -0.4
RRP12Q12754 WWM1YFL010C 636 nt12.52□□□□□ -0.41
RRP12Q12754 NPL3YDR432W 1245 nt12.51□□□□□ -0.41
RRP12Q12754 HOM6YJR139C 1080 nt12.49□□□□□ -0.41
RRP12Q12754 MNP1YGL068W 585 nt12.44□□□□□ -0.42
RRP12Q12754 BUD23YCR047C 828 nt12.41□□□□□ -0.42
RRP12Q12754 YOL037CYOL037C 354 nt12.37□□□□□ -0.43
RRP12Q12754 NAB2YGL122C 1578 nt12.35□□□□□ -0.43
RRP12Q12754 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.35□□□□□ -0.43
RRP12Q12754 BDH2YAL061W 1254 nt12.34□□□□□ -0.43
RRP12Q12754 RKM5YLR137W 1104 nt12.31□□□□□ -0.44
RRP12Q12754 INM2YDR287W 879 nt12.29□□□□□ -0.44
RRP12Q12754 DAL1YIR027C 1383 nt12.24□□□□□ -0.45
RRP12Q12754 LSM3YLR438C-A 270 nt12.24□□□□□ -0.45
RRP12Q12754 FPR4YLR449W 1179 nt12.2□□□□□ -0.46
RRP12Q12754 FIS1YIL065C 468 nt12.19□□□□□ -0.46
RRP12Q12754 YBL100CYBL100C 315 nt12.19□□□□□ -0.46
RRP12Q12754 SPT5YML010W 3192 nt12.16□□□□□ -0.46
RRP12Q12754 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RRP12Q12754 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RRP12Q12754 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RRP12Q12754 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RRP12Q12754 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RRP12Q12754 PHO4YFR034C 939 nt12.11□□□□□ -0.47
RRP12Q12754 TRM9YML014W 840 nt12.08□□□□□ -0.48
RRP12Q12754 FUN26YAL022C 1554 nt12.05□□□□□ -0.48
RRP12Q12754 YLR281CYLR281C 468 nt12.04□□□□□ -0.48
RRP12Q12754 SSA4YER103W 1929 nt12.01□□□□□ -0.49
RRP12Q12754 PUS2YGL063W 1113 nt11.98□□□□□ -0.49
RRP12Q12754 WHI5YOR083W 888 nt11.97□□□□□ -0.49
RRP12Q12754 CCT6YDR188W 1641 nt11.94□□□□□ -0.5
RRP12Q12754 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.85□□□□□ -0.51
RRP12Q12754 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.85□□□□□ -0.51
RRP12Q12754 ALF1YNL148C 765 nt11.85□□□□□ -0.51
RRP12Q12754 MEP2YNL142W 1500 nt11.82□□□□□ -0.52
RRP12Q12754 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.8□□□□□ -0.52
RRP12Q12754 PAC11YDR488C 1602 nt11.78□□□□□ -0.52
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