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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
NSR1
YGR159C
1245 nt
17.17
■□□□□ 0.34
VAM3
Q12241
YML009W-B
YML009W-B
477 nt
17.04
■□□□□ 0.32
VAM3
Q12241
NOP1
YDL014W
984 nt
16.56
■□□□□ 0.24
VAM3
Q12241
MDJ1
YFL016C
1536 nt
15.57
■□□□□ 0.08
VAM3
Q12241
YKL036C
YKL036C
393 nt
15.14
■□□□□ 0.01
VAM3
Q12241
SRX1
YKL086W
384 nt
14.45
□□□□□ -0.1
VAM3
Q12241
Q0297
Q0297
156 nt
14.44
□□□□□ -0.1
VAM3
Q12241
YJL027C
YJL027C
417 nt
14.39
□□□□□ -0.11
VAM3
Q12241
SCS3
YGL126W
1143 nt
13.68
□□□□□ -0.22
VAM3
Q12241
YCR051W
YCR051W
669 nt
13.67
□□□□□ -0.22
VAM3
Q12241
DBP2
YNL112W
1641 nt
13.6
□□□□□ -0.23
VAM3
Q12241
YBR190W
YBR190W
312 nt
13.45
□□□□□ -0.26
VAM3
Q12241
TRN1
tP(UGG)A
72 nt
13.14
□□□□□ -0.31
VAM3
Q12241
SUF9
tP(UGG)F
72 nt
13.14
□□□□□ -0.31
VAM3
Q12241
SUF8
tP(UGG)H
72 nt
13.14
□□□□□ -0.31
VAM3
Q12241
tP(UGG)L
tP(UGG)L
72 nt
13.14
□□□□□ -0.31
VAM3
Q12241
SUF7
tP(UGG)M
72 nt
13.14
□□□□□ -0.31
VAM3
Q12241
tP(UGG)N1
tP(UGG)N1
72 nt
13.14
□□□□□ -0.31
VAM3
Q12241
tP(UGG)N2
tP(UGG)N2
72 nt
13.14
□□□□□ -0.31
VAM3
Q12241
tP(UGG)O1
tP(UGG)O1
72 nt
13.14
□□□□□ -0.31
VAM3
Q12241
SUF11
tP(UGG)O2
72 nt
13.14
□□□□□ -0.31
VAM3
Q12241
RTC3
YHR087W
336 nt
13.11
□□□□□ -0.31
VAM3
Q12241
YOL085C
YOL085C
342 nt
13.1
□□□□□ -0.31
VAM3
Q12241
CCC1
YLR220W
969 nt
12.96
□□□□□ -0.33
VAM3
Q12241
RPP1B
YDL130W
321 nt
12.95
□□□□□ -0.34
VAM3
Q12241
PKP1
YIL042C
1185 nt
12.88
□□□□□ -0.35
VAM3
Q12241
RVS167
YDR388W
1449 nt
12.79
□□□□□ -0.36
VAM3
Q12241
SSA3
YBL075C
1950 nt
12.71
□□□□□ -0.37
VAM3
Q12241
SCJ1
YMR214W
1134 nt
12.54
□□□□□ -0.4
VAM3
Q12241
PUT4
YOR348C
1884 nt
12.48
□□□□□ -0.41
VAM3
Q12241
tP(UGG)O3
tP(UGG)O3
72 nt
12.38
□□□□□ -0.43
VAM3
Q12241
PET122
YER153C
765 nt
12.36
□□□□□ -0.43
VAM3
Q12241
SCR1
SCR1
522 nt
12.24
□□□□□ -0.45
VAM3
Q12241
SHR5
YOL110W
714 nt
12.22
□□□□□ -0.45
VAM3
Q12241
ATS1
YAL020C
1002 nt
12.21
□□□□□ -0.45
VAM3
Q12241
ARE1
YCR048W
1833 nt
12.13
□□□□□ -0.47
VAM3
Q12241
URN1
YPR152C
1398 nt
12.11
□□□□□ -0.47
VAM3
Q12241
POA1
YBR022W
534 nt
12.06
□□□□□ -0.48
VAM3
Q12241
SAH1
YER043C
1350 nt
12.04
□□□□□ -0.48
VAM3
Q12241
OPI9
YLR338W
858 nt
12.03
□□□□□ -0.48
VAM3
Q12241
YDJ1
YNL064C
1230 nt
12
□□□□□ -0.49
VAM3
Q12241
YHR049C-A
YHR049C-A
297 nt
11.99
□□□□□ -0.49
VAM3
Q12241
RRN5
YLR141W
1092 nt
11.99
□□□□□ -0.49
VAM3
Q12241
DEP1
YAL013W
1218 nt
11.95
□□□□□ -0.5
VAM3
Q12241
RPN10
YHR200W
807 nt
11.9
□□□□□ -0.5
VAM3
Q12241
BSC6
YOL137W
1494 nt
11.89
□□□□□ -0.51
VAM3
Q12241
YNL208W
YNL208W
600 nt
11.78
□□□□□ -0.52
VAM3
Q12241
Q0182
Q0182
405 nt
11.77
□□□□□ -0.53
VAM3
Q12241
YER088W-B
YER088W-B
147 nt
11.76
□□□□□ -0.53
VAM3
Q12241
GAR1
YHR089C
618 nt
11.71
□□□□□ -0.53
VAM3
Q12241
PUN1
YLR414C
792 nt
11.71
□□□□□ -0.53
VAM3
Q12241
RSB1
YOR049C
1065 nt
11.71
□□□□□ -0.53
VAM3
Q12241
BUD23
YCR047C
828 nt
11.68
□□□□□ -0.54
VAM3
Q12241
SPT5
YML010W
3192 nt
11.6
□□□□□ -0.55
VAM3
Q12241
PTC2
YER089C
1395 nt
11.59
□□□□□ -0.55
VAM3
Q12241
NAB2
YGL122C
1578 nt
11.54
□□□□□ -0.56
VAM3
Q12241
YJR018W
YJR018W
363 nt
11.53
□□□□□ -0.56
VAM3
Q12241
SSA4
YER103W
1929 nt
11.43
□□□□□ -0.58
VAM3
Q12241
TIR1
YER011W
765 nt
11.35
□□□□□ -0.59
VAM3
Q12241
PST2
YDR032C
597 nt
11.33
□□□□□ -0.6
VAM3
Q12241
DAL1
YIR027C
1383 nt
11.29
□□□□□ -0.6
VAM3
Q12241
FIS1
YIL065C
468 nt
11.28
□□□□□ -0.6
VAM3
Q12241
SSA1
YAL005C
1929 nt
11.25
□□□□□ -0.61
VAM3
Q12241
RPP2B
YDR382W
333 nt
11.24
□□□□□ -0.61
VAM3
Q12241
FPS1
YLL043W
2010 nt
11.23
□□□□□ -0.61
VAM3
Q12241
FPR4
YLR449W
1179 nt
11.23
□□□□□ -0.61
VAM3
Q12241
MEP2
YNL142W
1500 nt
11.21
□□□□□ -0.61
VAM3
Q12241
INM2
YDR287W
879 nt
11.21
□□□□□ -0.61
VAM3
Q12241
YJR120W
YJR120W
351 nt
11.2
□□□□□ -0.62
VAM3
Q12241
MOT3
YMR070W
1473 nt
11.18
□□□□□ -0.62
VAM3
Q12241
PHO4
YFR034C
939 nt
11.17
□□□□□ -0.62
VAM3
Q12241
NVJ2
YPR091C
2313 nt
11.14
□□□□□ -0.63
VAM3
Q12241
YPS1
YLR120C
1710 nt
11.1
□□□□□ -0.63
VAM3
Q12241
YHR165W-A
YHR165W-A
312 nt
11.02
□□□□□ -0.65
VAM3
Q12241
YBL100C
YBL100C
315 nt
11.01
□□□□□ -0.65
VAM3
Q12241
BDF1
YLR399C
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11
□□□□□ -0.65
VAM3
Q12241
DCW1
YKL046C
1350 nt
10.99
□□□□□ -0.65
VAM3
Q12241
SRB2
YHR041C
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10.98
□□□□□ -0.65
VAM3
Q12241
PAC11
YDR488C
1602 nt
10.98
□□□□□ -0.65
VAM3
Q12241
YDR095C
YDR095C
411 nt
10.97
□□□□□ -0.65
VAM3
Q12241
BDH2
YAL061W
1254 nt
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□□□□□ -0.66
VAM3
Q12241
YMR090W
YMR090W
684 nt
10.9
□□□□□ -0.66
VAM3
Q12241
SHU1
YHL006C
453 nt
10.88
□□□□□ -0.67
VAM3
Q12241
EMI2
YDR516C
1503 nt
10.87
□□□□□ -0.67
VAM3
Q12241
TAT1
YBR069C
1860 nt
10.87
□□□□□ -0.67
VAM3
Q12241
FUN26
YAL022C
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10.86
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VAM3
Q12241
ALF1
YNL148C
765 nt
10.83
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VAM3
Q12241
YKL097C
YKL097C
411 nt
10.81
□□□□□ -0.68
VAM3
Q12241
WWM1
YFL010C
636 nt
10.8
□□□□□ -0.68
VAM3
Q12241
YBR220C
YBR220C
1683 nt
10.79
□□□□□ -0.68
VAM3
Q12241
TRM9
YML014W
840 nt
10.79
□□□□□ -0.68
VAM3
Q12241
RPP2A
YOL039W
321 nt
10.78
□□□□□ -0.68
VAM3
Q12241
YDL221W
YDL221W
552 nt
10.76
□□□□□ -0.69
VAM3
Q12241
YGR021W
YGR021W
873 nt
10.75
□□□□□ -0.69
VAM3
Q12241
PTP1
YDL230W
1008 nt
10.72
□□□□□ -0.69
VAM3
Q12241
YAL037C-B
YAL037C-B
975 nt
10.72
□□□□□ -0.69
VAM3
Q12241
SDH1
YKL148C
1923 nt
10.71
□□□□□ -0.69
VAM3
Q12241
LSM3
YLR438C-A
270 nt
10.71
□□□□□ -0.69
VAM3
Q12241
CAC2
YML102W
1407 nt
10.69
□□□□□ -0.7
VAM3
Q12241
CCT6
YDR188W
1641 nt
10.69
□□□□□ -0.7
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