Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.65■□□□□ 0.74
RRN11Q04712 NSR1YGR159C 1245 nt19.32■□□□□ 0.68
RRN11Q04712 NOP1YDL014W 984 nt19.26■□□□□ 0.67
RRN11Q04712 YKL036CYKL036C 393 nt17.89■□□□□ 0.45
RRN11Q04712 MDJ1YFL016C 1536 nt16.91■□□□□ 0.3
RRN11Q04712 Q0297Q0297 156 nt16.8■□□□□ 0.28
RRN11Q04712 YJL027CYJL027C 417 nt16.76■□□□□ 0.27
RRN11Q04712 SRX1YKL086W 384 nt16.73■□□□□ 0.27
RRN11Q04712 SCS3YGL126W 1143 nt16.31■□□□□ 0.2
RRN11Q04712 YCR051WYCR051W 669 nt15.94■□□□□ 0.14
RRN11Q04712 YOL085CYOL085C 342 nt15.42■□□□□ 0.06
RRN11Q04712 PKP1YIL042C 1185 nt15.16■□□□□ 0.02
RRN11Q04712 RPP1BYDL130W 321 nt15.1■□□□□ 0.01
RRN11Q04712 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.97□□□□□ -0.01
RRN11Q04712 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.97□□□□□ -0.01
RRN11Q04712 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.97□□□□□ -0.01
RRN11Q04712 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.97□□□□□ -0.01
RRN11Q04712 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.97□□□□□ -0.01
RRN11Q04712 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.97□□□□□ -0.01
RRN11Q04712 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.97□□□□□ -0.01
RRN11Q04712 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.97□□□□□ -0.01
RRN11Q04712 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.97□□□□□ -0.01
RRN11Q04712 DBP2YNL112W 1641 nt14.93□□□□□ -0.02
RRN11Q04712 CCC1YLR220W 969 nt14.88□□□□□ -0.03
RRN11Q04712 SCJ1YMR214W 1134 nt14.76□□□□□ -0.05
RRN11Q04712 ATS1YAL020C 1002 nt14.65□□□□□ -0.06
RRN11Q04712 SCR1SCR1 522 nt14.42□□□□□ -0.1
RRN11Q04712 YBR190WYBR190W 312 nt14.41□□□□□ -0.1
RRN11Q04712 RVS167YDR388W 1449 nt14.36□□□□□ -0.11
RRN11Q04712 PET122YER153C 765 nt14.36□□□□□ -0.11
RRN11Q04712 SSA3YBL075C 1950 nt14.34□□□□□ -0.11
RRN11Q04712 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.25□□□□□ -0.13
RRN11Q04712 RTC3YHR087W 336 nt14.19□□□□□ -0.14
RRN11Q04712 RRN5YLR141W 1092 nt13.97□□□□□ -0.17
RRN11Q04712 RSB1YOR049C 1065 nt13.84□□□□□ -0.19
RRN11Q04712 SHR5YOL110W 714 nt13.82□□□□□ -0.2
RRN11Q04712 YDJ1YNL064C 1230 nt13.8□□□□□ -0.2
RRN11Q04712 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.69□□□□□ -0.22
RRN11Q04712 PST2YDR032C 597 nt13.48□□□□□ -0.25
RRN11Q04712 GAR1YHR089C 618 nt13.47□□□□□ -0.25
RRN11Q04712 DEP1YAL013W 1218 nt13.32□□□□□ -0.28
RRN11Q04712 URN1YPR152C 1398 nt13.29□□□□□ -0.28
RRN11Q04712 RPN10YHR200W 807 nt13.27□□□□□ -0.29
RRN11Q04712 YNL208WYNL208W 600 nt13.19□□□□□ -0.3
RRN11Q04712 YKL097CYKL097C 411 nt13.18□□□□□ -0.3
RRN11Q04712 PUT4YOR348C 1884 nt13.06□□□□□ -0.32
RRN11Q04712 OPI9YLR338W 858 nt13.03□□□□□ -0.32
RRN11Q04712 TIR1YER011W 765 nt13□□□□□ -0.33
RRN11Q04712 SHU1YHL006C 453 nt12.89□□□□□ -0.35
RRN11Q04712 SAH1YER043C 1350 nt12.86□□□□□ -0.35
RRN11Q04712 PUN1YLR414C 792 nt12.73□□□□□ -0.37
RRN11Q04712 SSA1YAL005C 1929 nt12.7□□□□□ -0.38
RRN11Q04712 YJR018WYJR018W 363 nt12.7□□□□□ -0.38
RRN11Q04712 ARE1YCR048W 1833 nt12.69□□□□□ -0.38
RRN11Q04712 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.63□□□□□ -0.39
RRN11Q04712 RPP2BYDR382W 333 nt12.61□□□□□ -0.39
RRN11Q04712 POA1YBR022W 534 nt12.6□□□□□ -0.39
RRN11Q04712 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.58□□□□□ -0.4
RRN11Q04712 YGR021WYGR021W 873 nt12.54□□□□□ -0.4
RRN11Q04712 NPL3YDR432W 1245 nt12.5□□□□□ -0.41
RRN11Q04712 PTC2YER089C 1395 nt12.47□□□□□ -0.41
RRN11Q04712 YOR139CYOR139C 393 nt12.46□□□□□ -0.41
RRN11Q04712 FPS1YLL043W 2010 nt12.44□□□□□ -0.42
RRN11Q04712 BSC6YOL137W 1494 nt12.42□□□□□ -0.42
RRN11Q04712 WWM1YFL010C 636 nt12.41□□□□□ -0.42
RRN11Q04712 SRB2YHR041C 633 nt12.41□□□□□ -0.42
RRN11Q04712 PAC11YDR488C 1602 nt12.4□□□□□ -0.42
RRN11Q04712 NVJ2YPR091C 2313 nt12.39□□□□□ -0.43
RRN11Q04712 HOM6YJR139C 1080 nt12.38□□□□□ -0.43
RRN11Q04712 BUD23YCR047C 828 nt12.36□□□□□ -0.43
RRN11Q04712 YJR120WYJR120W 351 nt12.36□□□□□ -0.43
RRN11Q04712 MNP1YGL068W 585 nt12.34□□□□□ -0.43
RRN11Q04712 YOL037CYOL037C 354 nt12.33□□□□□ -0.44
RRN11Q04712 NAB2YGL122C 1578 nt12.3□□□□□ -0.44
RRN11Q04712 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.29□□□□□ -0.44
RRN11Q04712 BDH2YAL061W 1254 nt12.28□□□□□ -0.44
RRN11Q04712 INM2YDR287W 879 nt12.26□□□□□ -0.45
RRN11Q04712 RKM5YLR137W 1104 nt12.23□□□□□ -0.45
RRN11Q04712 FPR4YLR449W 1179 nt12.22□□□□□ -0.45
RRN11Q04712 DAL1YIR027C 1383 nt12.18□□□□□ -0.46
RRN11Q04712 LSM3YLR438C-A 270 nt12.18□□□□□ -0.46
RRN11Q04712 SPT5YML010W 3192 nt12.16□□□□□ -0.46
RRN11Q04712 YBL100CYBL100C 315 nt12.16□□□□□ -0.46
RRN11Q04712 FIS1YIL065C 468 nt12.08□□□□□ -0.48
RRN11Q04712 TRM9YML014W 840 nt12.06□□□□□ -0.48
RRN11Q04712 PHO4YFR034C 939 nt12.05□□□□□ -0.48
RRN11Q04712 FUN26YAL022C 1554 nt11.98□□□□□ -0.49
RRN11Q04712 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.98□□□□□ -0.49
RRN11Q04712 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.98□□□□□ -0.49
RRN11Q04712 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.98□□□□□ -0.49
RRN11Q04712 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.98□□□□□ -0.49
RRN11Q04712 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.98□□□□□ -0.49
RRN11Q04712 SSA4YER103W 1929 nt11.95□□□□□ -0.5
RRN11Q04712 PUS2YGL063W 1113 nt11.92□□□□□ -0.5
RRN11Q04712 YLR281CYLR281C 468 nt11.92□□□□□ -0.5
RRN11Q04712 ALF1YNL148C 765 nt11.89□□□□□ -0.51
RRN11Q04712 WHI5YOR083W 888 nt11.88□□□□□ -0.51
RRN11Q04712 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.87□□□□□ -0.51
RRN11Q04712 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.87□□□□□ -0.51
RRN11Q04712 CCT6YDR188W 1641 nt11.86□□□□□ -0.51
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