RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data2.86□□□□□ -1.95not detected
NSE4YDL105W MNS1P32906 549 aa2.86□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W PXA2P34230 853 aa2.86□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W YBR056WP38081 501 aa2.86□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W RRP4P38792 359 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W TCB2P48231 1178 aa2.86□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W CWC25P53854 179 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W OAZ1Q02803 292 aa2.86□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W AIM32Q04689 311 aa2.86□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W TMS1Q12116 473 aa2.86□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W ATG34Q12292 412 aa2.86□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W TRP1P00912 224 aa2.85□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W ADE4P04046 510 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W RAD57P25301 460 aa2.85□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W SFH5P47008 294 aa2.85□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W YGR111WP53265 400 aa2.85□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W RHO5P53879 331 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W PEX25Q02969 394 aa2.85□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W BCH1Q05029 724 aa2.85□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W YLR345WQ06137 509 aa2.85□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W MHR1Q06630 226 aa2.85□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W NDE2Q07500 545 aa2.85□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W VMA8P32610 256 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W ATP3P38077 311 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W YBR137WP38276 179 aa2.84□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W PAN6P40459 309 aa2.84□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W VHS2P40463 436 aa2.84□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W MTM1P53320 366 aa2.84□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W APJ1P53940 528 aa2.84□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W CIK1Q01649 594 aa2.84□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W URH1Q04179 340 aa2.84□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W MRPL35Q06678 367 aa2.84□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W SRL2Q12020 392 aa2.84□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
NSE4YDL105W CLN3P13365 580 aa2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W POP5P28005 173 aa2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W NIP1P32497 812 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W SPR1P32603 445 aa2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W PRS1P32895 427 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W ASC1P38011 319 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W OLA1P38219 394 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data2.83□□□□□ -1.96not detected
NSE4YDL105W TOM22P49334 152 aa2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W YML6P51998 286 aa2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W MMT1Q03218 510 aa2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W DCI1Q08558 271 aa2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W RUP1Q12242 671 aa2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W YRM1Q12340 786 aa2.83□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W SOD1P00445 154 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W NFT1P0CE68 1218 aa2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W NAT1P12945 854 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W RVS161P25343 265 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W HSP104P31539 908 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W RIM1P32445 135 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W CYS4P32582 507 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W MSG5P38590 489 aa2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W SER3P40054 469 aa2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W JLP2P40206 208 aa2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W GAT2P40209 560 aa2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W BRO1P48582 844 aa2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W PIB2P53191 635 aa2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W YLR152CP54072 576 aa2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W STD1Q02794 444 aa2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W HRT3Q12347 344 aa2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W ADH2P00331 348 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W CYC3P06182 269 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W IMA3P0CW40 589 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W IMA4P0CW41 589 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W NAM2P11325 894 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W ARO3P14843 370 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W YCL068CP25593 260 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W LTV1P34078 463 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W HEL1P36113 551 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W SWD3P38123 315 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W CHK1P38147 527 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W COX14P39103 70 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W YER079WP40052 210 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W YIL029CP40538 142 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W YPS6P40583 537 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W MDE1P47095 244 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W ALF1P53904 254 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W MTQ1P53944 314 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W CCE1Q03702 353 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W IRC25Q07951 179 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W IMA2Q08295 589 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W RAX1Q08760 435 aa2.81□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W CEX1Q12453 761 aa2.81□□□□□ -1.96
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