Protein–RNA interactions for Protein: P53940

APJ1, J domain-containing protein APJ1, yeastyeast

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Length 528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APJ1P53940 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.82■□□□□ 0.28
APJ1P53940 NSR1YGR159C 1245 nt16.61■□□□□ 0.25
APJ1P53940 NOP1YDL014W 984 nt16.35■□□□□ 0.21
APJ1P53940 YKL036CYKL036C 393 nt15.28■□□□□ 0.04
APJ1P53940 MDJ1YFL016C 1536 nt15.25■□□□□ 0.03
APJ1P53940 Q0297Q0297 156 nt14.47□□□□□ -0.09
APJ1P53940 SRX1YKL086W 384 nt14.38□□□□□ -0.11
APJ1P53940 YJL027CYJL027C 417 nt14.27□□□□□ -0.13
APJ1P53940 SCS3YGL126W 1143 nt14.03□□□□□ -0.16
APJ1P53940 YCR051WYCR051W 669 nt13.59□□□□□ -0.23
APJ1P53940 YOL085CYOL085C 342 nt13.28□□□□□ -0.28
APJ1P53940 DBP2YNL112W 1641 nt13.21□□□□□ -0.3
APJ1P53940 YBR190WYBR190W 312 nt13.17□□□□□ -0.3
APJ1P53940 SSA3YBL075C 1950 nt13.11□□□□□ -0.31
APJ1P53940 PKP1YIL042C 1185 nt13.05□□□□□ -0.32
APJ1P53940 RPP1BYDL130W 321 nt12.96□□□□□ -0.33
APJ1P53940 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.95□□□□□ -0.34
APJ1P53940 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.95□□□□□ -0.34
APJ1P53940 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.95□□□□□ -0.34
APJ1P53940 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.95□□□□□ -0.34
APJ1P53940 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.95□□□□□ -0.34
APJ1P53940 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.95□□□□□ -0.34
APJ1P53940 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.95□□□□□ -0.34
APJ1P53940 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.95□□□□□ -0.34
APJ1P53940 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.95□□□□□ -0.34
APJ1P53940 RTC3YHR087W 336 nt12.86□□□□□ -0.35
APJ1P53940 CCC1YLR220W 969 nt12.73□□□□□ -0.37
APJ1P53940 ATS1YAL020C 1002 nt12.58□□□□□ -0.4
APJ1P53940 SCJ1YMR214W 1134 nt12.58□□□□□ -0.4
APJ1P53940 PUT4YOR348C 1884 nt12.41□□□□□ -0.42
APJ1P53940 PET122YER153C 765 nt12.39□□□□□ -0.43
APJ1P53940 RVS167YDR388W 1449 nt12.34□□□□□ -0.43
APJ1P53940 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.28□□□□□ -0.44
APJ1P53940 SCR1SCR1 522 nt12.19□□□□□ -0.46
APJ1P53940 RRN5YLR141W 1092 nt12.04□□□□□ -0.48
APJ1P53940 ARE1YCR048W 1833 nt12□□□□□ -0.49
APJ1P53940 POA1YBR022W 534 nt11.98□□□□□ -0.49
APJ1P53940 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.87□□□□□ -0.51
APJ1P53940 YDJ1YNL064C 1230 nt11.87□□□□□ -0.51
APJ1P53940 SHR5YOL110W 714 nt11.85□□□□□ -0.51
APJ1P53940 BSC6YOL137W 1494 nt11.84□□□□□ -0.51
APJ1P53940 SAH1YER043C 1350 nt11.83□□□□□ -0.52
APJ1P53940 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.81□□□□□ -0.52
APJ1P53940 URN1YPR152C 1398 nt11.79□□□□□ -0.52
APJ1P53940 RSB1YOR049C 1065 nt11.77□□□□□ -0.53
APJ1P53940 OPI9YLR338W 858 nt11.74□□□□□ -0.53
APJ1P53940 SPT5YML010W 3192 nt11.7□□□□□ -0.54
APJ1P53940 PST2YDR032C 597 nt11.67□□□□□ -0.54
APJ1P53940 SSA4YER103W 1929 nt11.64□□□□□ -0.55
APJ1P53940 DEP1YAL013W 1218 nt11.62□□□□□ -0.55
APJ1P53940 BUD23YCR047C 828 nt11.56□□□□□ -0.56
APJ1P53940 GAR1YHR089C 618 nt11.55□□□□□ -0.56
APJ1P53940 RPN10YHR200W 807 nt11.51□□□□□ -0.57
APJ1P53940 PUN1YLR414C 792 nt11.41□□□□□ -0.58
APJ1P53940 YNL208WYNL208W 600 nt11.37□□□□□ -0.59
APJ1P53940 PTC2YER089C 1395 nt11.37□□□□□ -0.59
APJ1P53940 NAB2YGL122C 1578 nt11.32□□□□□ -0.6
APJ1P53940 BDF1YLR399C 2061 nt11.23□□□□□ -0.61
APJ1P53940 YJR018WYJR018W 363 nt11.22□□□□□ -0.61
APJ1P53940 YKL097CYKL097C 411 nt11.2□□□□□ -0.62
APJ1P53940 TIR1YER011W 765 nt11.18□□□□□ -0.62
APJ1P53940 MEP2YNL142W 1500 nt11.18□□□□□ -0.62
APJ1P53940 SHU1YHL006C 453 nt11.16□□□□□ -0.62
APJ1P53940 FIS1YIL065C 468 nt11.08□□□□□ -0.64
APJ1P53940 TAT1YBR069C 1860 nt11.07□□□□□ -0.64
APJ1P53940 SSA1YAL005C 1929 nt11.07□□□□□ -0.64
APJ1P53940 DAL1YIR027C 1383 nt11.04□□□□□ -0.64
APJ1P53940 FPR4YLR449W 1179 nt11.03□□□□□ -0.64
APJ1P53940 SRB2YHR041C 633 nt11□□□□□ -0.65
APJ1P53940 DCW1YKL046C 1350 nt10.99□□□□□ -0.65
APJ1P53940 PHO4YFR034C 939 nt10.95□□□□□ -0.66
APJ1P53940 YPS1YLR120C 1710 nt10.94□□□□□ -0.66
APJ1P53940 YJR120WYJR120W 351 nt10.92□□□□□ -0.66
APJ1P53940 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.92□□□□□ -0.66
APJ1P53940 INM2YDR287W 879 nt10.89□□□□□ -0.67
APJ1P53940 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.89□□□□□ -0.67
APJ1P53940 PAC11YDR488C 1602 nt10.87□□□□□ -0.67
APJ1P53940 RPP2BYDR382W 333 nt10.85□□□□□ -0.67
APJ1P53940 YMR090WYMR090W 684 nt10.84□□□□□ -0.67
APJ1P53940 EMI2YDR516C 1503 nt10.84□□□□□ -0.67
APJ1P53940 YBR220CYBR220C 1683 nt10.83□□□□□ -0.68
APJ1P53940 YOR139CYOR139C 393 nt10.83□□□□□ -0.68
APJ1P53940 YDR095CYDR095C 411 nt10.77□□□□□ -0.69
APJ1P53940 WWM1YFL010C 636 nt10.73□□□□□ -0.69
APJ1P53940 YDL221WYDL221W 552 nt10.7□□□□□ -0.7
APJ1P53940 HOM6YJR139C 1080 nt10.7□□□□□ -0.7
APJ1P53940 YBL100CYBL100C 315 nt10.7□□□□□ -0.7
APJ1P53940 SDH1YKL148C 1923 nt10.68□□□□□ -0.7
APJ1P53940 MNP1YGL068W 585 nt10.67□□□□□ -0.7
APJ1P53940 YGR021WYGR021W 873 nt10.64□□□□□ -0.71
APJ1P53940 CAC2YML102W 1407 nt10.6□□□□□ -0.71
APJ1P53940 PCH2YBR186W 1695 nt10.59□□□□□ -0.71
APJ1P53940 RPP2AYOL039W 321 nt10.58□□□□□ -0.72
APJ1P53940 PTP1YDL230W 1008 nt10.57□□□□□ -0.72
APJ1P53940 NPL3YDR432W 1245 nt10.57□□□□□ -0.72
APJ1P53940 SEC11YIR022W 504 nt10.56□□□□□ -0.72
APJ1P53940 BDH2YAL061W 1254 nt10.55□□□□□ -0.72
APJ1P53940 GUT2YIL155C 1950 nt10.54□□□□□ -0.72
APJ1P53940 FUN26YAL022C 1554 nt10.54□□□□□ -0.72
APJ1P53940 ALF1YNL148C 765 nt10.54□□□□□ -0.72
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