RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA MTM1P53320 366 aa2.64□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA RHO5P53879 331 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA URH1Q04179 340 aa2.64□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA BCH1Q05029 724 aa2.64□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA HRT3Q12347 344 aa2.64□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA ISA2Q12425 185 aa2.64□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA MTR10Q99189 972 aa2.64□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA HOM3P10869 527 aa2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA CLN3P13365 580 aa2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA ERV1P27882 189 aa2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA KAR9P32526 644 aa2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA SWD3P38123 315 aa2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA MSG5P38590 489 aa2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA TCB2P48231 1178 aa2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA OCA2P53949 197 aa2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA OAZ1Q02803 292 aa2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA YLR345WQ06137 509 aa2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA FDH1Q08911 376 aa2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA RUP1Q12242 671 aa2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA TPT1Q12272 230 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA ADH2P00331 348 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA NFT1P0CE68 1218 aa2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA RAD57P25301 460 aa2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA RVS161P25343 265 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA POP5P28005 173 aa2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA MPE1P35728 441 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA JLP2P40206 208 aa2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA VHS2P40463 436 aa2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA PHB2P50085 310 aa2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA PEX25Q02969 394 aa2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA RPN9Q04062 393 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA VPS54Q12071 889 aa2.62□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA CYC3P06182 269 aa2.61□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data2.61□□□□□ -1.99not detected
15S_rRNA15S_rRNA RRP1P35178 278 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA ASC1P38011 319 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA YBR056WP38081 501 aa2.61□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA OLA1P38219 394 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA YPS6P40583 537 aa2.61□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA ZIM17P42844 174 aa2.61□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA YGL039WP53183 348 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA RRP9Q06506 573 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA MHR1Q06630 226 aa2.61□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA NDE2Q07500 545 aa2.61□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA AEP3Q12089 606 aa2.61□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA SPR1P32603 445 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA SLX1P38324 304 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA GAT2P40209 560 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA PRP42Q03776 544 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA YMR027WQ04371 470 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA AIM32Q04689 311 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA IRC25Q07951 179 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA RAX1Q08760 435 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA RBD2Q12270 262 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA COX3P00420 269 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA IMA3P0CW40 589 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA IMA4P0CW41 589 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA YCL068CP25593 260 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA ATP3P38077 311 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA SRP72P38688 640 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA MDE1P47095 244 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA MMT1Q03218 510 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA ADD37Q03233 198 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA IMA2Q08295 589 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA YRM1Q12340 786 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA WTM1Q12363 437 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA CEX1Q12453 761 aa2.6□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA HSP104P31539 908 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA LTV1P34078 463 aa2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA CHK1P38147 527 aa2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA ZTA1P38230 334 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA SER3P40054 469 aa2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA BRO1P48582 844 aa2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA YML6P51998 286 aa2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA YGR111WP53265 400 aa2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA SHY1P53266 389 aa2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA MTQ1P53944 314 aa2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA YLR152CP54072 576 aa2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA STD1Q02794 444 aa2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA SMC6Q12749 1114 aa2.59□□□□□ -1.99
15S_rRNA15S_rRNA ARO3P14843 370 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA CYS4P32582 507 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA STN1P38960 494 aa2.58□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA COX14P39103 70 aa2.58□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
15S_rRNA15S_rRNA CIK1Q01649 594 aa2.58□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA HXT1P32465 570 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA HEL1P36113 551 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA YIL029CP40538 142 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA NUP116Q02630 1113 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA CCE1Q03702 353 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA UAF30Q08747 228 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA NAM2P11325 894 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA PHA2P32452 334 aa2.57□□□□□ -2
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