RNA–Protein interactions for RNA: YKL062W

MSN4, Transcript of Stress-responsive transcriptional activator, yeast

Gene MSN4, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSN4	YKL062W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	NMA2	P53204	395 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	RRT8	Q08219	342 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	NMD4	Q12129	218 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	SUT2	Q12286	268 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YRM1	Q12340	786 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	STE12	P13574	688 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.25	□□□□□ -1.73	not detected
MSN4	YKL062W	OCA4	P25366	362 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YUH1	P35127	236 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	APL3	P38065	1025 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YHR033W	P38690	423 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.25	□□□□□ -1.73	RIP-Chip
MSN4	YKL062W	SMF1	P38925	575 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	SSU1	P41930	458 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	TAH11	P47112	604 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	MGR3	Q04472	501 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	RIT1	P23796	513 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	PEP3	P27801	918 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	ERV1	P27882	189 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	MSP1	P28737	362 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	CDS1	P38221	457 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	DIP5	P53388	608 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	SPC98	P53540	846 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	ENT4	Q07872	247 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	IZH3	Q07959	543 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	COX17	Q12287	69 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	CBS1	P14066	229 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	DAP2	P18962	818 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	MRP20	P32387	263 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	MRP4	P32902	394 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.24	□□□□□ -1.73	not detected
MSN4	YKL062W	ELF1	P36053	145 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	DAD2	P36162	133 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	MRPL36	P36531	177 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	MRPL40	P36534	297 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	PEX32	P38292	413 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	FLC2	P39719	783 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	TMN3	P40071	706 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	FTR1	P40088	404 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YNR071C	P53757	342 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	MDM36	Q06820	579 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	PUT4	P15380	627 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YCR051W	P25631	222 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	MRE11	P32829	692 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	RPC37	P36121	282 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YSW1	P38280	609 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YDR089W	P38966	869 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	MET18	P40469	1032 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	MNT2	P53059	558 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	ACS1	Q01574	713 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	RAD30	Q04049	632 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	ECM18	Q04623	453 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	HER1	Q12276	1246 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	LAM4	P38800	1345 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	CPR2	P23285	205 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	SPS22	P25380	463 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	PHO91	P27514	894 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	EMP70	P32802	667 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	TAF5	P38129	798 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	UBP13	P38187	747 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	INP2	Q03824	705 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	RCN2	Q12044	265 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	RKI1	Q12189	258 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	SEC39	Q12745	709 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	TUP1	P16649	713 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MSN4	YKL062W	KRE6	P32486	720 aa		4.22	□□□□□ -1.73

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