RNA–Protein interactions for RNA: YJR048W

CYC1, Transcript of Cytochrome c, isoform 1, yeast

Gene CYC1, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYC1	YJR048W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	AFI1	Q99222	893 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ARG1	P22768	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	KAR4	P25583	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	PHO91	P27514	894 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ERV1	P27882	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	SRB2	P34162	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YUH1	P35127	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YPT53	P36019	220 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	APN2	P38207	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	VID24	P38263	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YHR033W	P38690	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YDR089W	P38966	869 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	BUD8	P41698	603 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	AAD10	P47182	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ROY1	Q04847	553 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ENB1	Q08299	606 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CTF3	Q12748	733 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ISN1	Q99312	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
CYC1	YJR048W	PUT4	P15380	627 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	LTV1	P34078	463 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
CYC1	YJR048W	YSW1	P38280	609 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	GSM1	P42950	618 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	RAD17	P48581	401 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	LSB1	P53281	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	THI22	Q06490	572 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	PCL8	Q08966	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	NUS1	Q12063	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	UPC2	Q12151	913 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YRM1	Q12340	786 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	IME1	P21190	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ERG8	P24521	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MRP4	P32902	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	OAR1	P35731	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ALY1	P36117	915 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	RPC37	P36121	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MOH1	P38191	138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CDS1	P38221	457 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CST26	P38226	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	COS111	P38308	924 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TDP1	P38319	544 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	REV7	P38927	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TAF4	P50105	388 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ALT2	P52892	507 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YGR066C	P53242	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MDR1	P53258	950 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	VPS64	Q03944	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TCO89	Q08921	799 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	PET122	P10355	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	PET127	P32606	800 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	YBL028C	P38202	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	PEX18	P38855	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	YIL089W	P40500	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	PKP1	P40530	394 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	DOT5	P40553	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	CHS6	P40955	746 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	TAH11	P47112	604 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	YGR111W	P53265	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	ADY4	Q05955	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	RRT8	Q08219	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYC1	YJR048W	ICL2	Q12031	575 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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