Protein–RNA interactions for Protein: Q12122

LYS21, Homocitrate synthase, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LYS21Q12122 NSR1YGR159C 1245 nt17.86■□□□□ 0.45
LYS21Q12122 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.71■□□□□ 0.43
LYS21Q12122 NOP1YDL014W 984 nt17.04■□□□□ 0.32
LYS21Q12122 MDJ1YFL016C 1536 nt16.21■□□□□ 0.19
LYS21Q12122 YKL036CYKL036C 393 nt15.45■□□□□ 0.06
LYS21Q12122 SRX1YKL086W 384 nt14.92□□□□□ -0.02
LYS21Q12122 YJL027CYJL027C 417 nt14.89□□□□□ -0.03
LYS21Q12122 Q0297Q0297 156 nt14.86□□□□□ -0.03
LYS21Q12122 DBP2YNL112W 1641 nt14.23□□□□□ -0.13
LYS21Q12122 YCR051WYCR051W 669 nt14.12□□□□□ -0.15
LYS21Q12122 SSA3YBL075C 1950 nt14□□□□□ -0.17
LYS21Q12122 SCS3YGL126W 1143 nt13.93□□□□□ -0.18
LYS21Q12122 YBR190WYBR190W 312 nt13.87□□□□□ -0.19
LYS21Q12122 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.71□□□□□ -0.21
LYS21Q12122 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.71□□□□□ -0.21
LYS21Q12122 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.71□□□□□ -0.21
LYS21Q12122 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.71□□□□□ -0.21
LYS21Q12122 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.71□□□□□ -0.21
LYS21Q12122 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.71□□□□□ -0.21
LYS21Q12122 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.71□□□□□ -0.21
LYS21Q12122 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.71□□□□□ -0.21
LYS21Q12122 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.71□□□□□ -0.21
LYS21Q12122 CCC1YLR220W 969 nt13.54□□□□□ -0.24
LYS21Q12122 RTC3YHR087W 336 nt13.52□□□□□ -0.25
LYS21Q12122 YOL085CYOL085C 342 nt13.42□□□□□ -0.26
LYS21Q12122 RPP1BYDL130W 321 nt13.32□□□□□ -0.28
LYS21Q12122 PKP1YIL042C 1185 nt13.27□□□□□ -0.29
LYS21Q12122 RVS167YDR388W 1449 nt13.22□□□□□ -0.29
LYS21Q12122 SCJ1YMR214W 1134 nt13.19□□□□□ -0.3
LYS21Q12122 PUT4YOR348C 1884 nt12.88□□□□□ -0.35
LYS21Q12122 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.85□□□□□ -0.35
LYS21Q12122 PET122YER153C 765 nt12.79□□□□□ -0.36
LYS21Q12122 SHR5YOL110W 714 nt12.72□□□□□ -0.37
LYS21Q12122 URN1YPR152C 1398 nt12.56□□□□□ -0.4
LYS21Q12122 Q0182Q0182 405 nt12.55□□□□□ -0.4
LYS21Q12122 ARE1YCR048W 1833 nt12.55□□□□□ -0.4
LYS21Q12122 SCR1SCR1 522 nt12.5□□□□□ -0.41
LYS21Q12122 DEP1YAL013W 1218 nt12.49□□□□□ -0.41
LYS21Q12122 SAH1YER043C 1350 nt12.47□□□□□ -0.41
LYS21Q12122 OPI9YLR338W 858 nt12.46□□□□□ -0.41
LYS21Q12122 POA1YBR022W 534 nt12.44□□□□□ -0.42
LYS21Q12122 YDJ1YNL064C 1230 nt12.43□□□□□ -0.42
LYS21Q12122 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.38□□□□□ -0.43
LYS21Q12122 RRN5YLR141W 1092 nt12.38□□□□□ -0.43
LYS21Q12122 ATS1YAL020C 1002 nt12.35□□□□□ -0.43
LYS21Q12122 RPN10YHR200W 807 nt12.26□□□□□ -0.45
LYS21Q12122 BSC6YOL137W 1494 nt12.24□□□□□ -0.45
LYS21Q12122 YNL208WYNL208W 600 nt12.22□□□□□ -0.45
LYS21Q12122 GAR1YHR089C 618 nt12.2□□□□□ -0.46
LYS21Q12122 SPT5YML010W 3192 nt12.16□□□□□ -0.46
LYS21Q12122 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.14□□□□□ -0.47
LYS21Q12122 SSA4YER103W 1929 nt12.13□□□□□ -0.47
LYS21Q12122 PUN1YLR414C 792 nt12.07□□□□□ -0.48
LYS21Q12122 BUD23YCR047C 828 nt12.04□□□□□ -0.48
LYS21Q12122 RSB1YOR049C 1065 nt12.01□□□□□ -0.49
LYS21Q12122 PTC2YER089C 1395 nt12□□□□□ -0.49
LYS21Q12122 YJR018WYJR018W 363 nt11.96□□□□□ -0.49
LYS21Q12122 MOT3YMR070W 1473 nt11.87□□□□□ -0.51
LYS21Q12122 NAB2YGL122C 1578 nt11.87□□□□□ -0.51
LYS21Q12122 TIR1YER011W 765 nt11.81□□□□□ -0.52
LYS21Q12122 BDF1YLR399C 2061 nt11.81□□□□□ -0.52
LYS21Q12122 YJR120WYJR120W 351 nt11.79□□□□□ -0.52
LYS21Q12122 SSA1YAL005C 1929 nt11.76□□□□□ -0.53
LYS21Q12122 FIS1YIL065C 468 nt11.73□□□□□ -0.53
LYS21Q12122 PAC11YDR488C 1602 nt11.7□□□□□ -0.54
LYS21Q12122 DAL1YIR027C 1383 nt11.67□□□□□ -0.54
LYS21Q12122 TAT1YBR069C 1860 nt11.61□□□□□ -0.55
LYS21Q12122 FPR4YLR449W 1179 nt11.61□□□□□ -0.55
LYS21Q12122 RPP2BYDR382W 333 nt11.6□□□□□ -0.55
LYS21Q12122 PHO4YFR034C 939 nt11.57□□□□□ -0.56
LYS21Q12122 SRB2YHR041C 633 nt11.57□□□□□ -0.56
LYS21Q12122 INM2YDR287W 879 nt11.55□□□□□ -0.56
LYS21Q12122 MEP2YNL142W 1500 nt11.51□□□□□ -0.57
LYS21Q12122 PST2YDR032C 597 nt11.51□□□□□ -0.57
LYS21Q12122 NVJ2YPR091C 2313 nt11.49□□□□□ -0.57
LYS21Q12122 YPS1YLR120C 1710 nt11.46□□□□□ -0.58
LYS21Q12122 YBL100CYBL100C 315 nt11.42□□□□□ -0.58
LYS21Q12122 BDH2YAL061W 1254 nt11.35□□□□□ -0.59
LYS21Q12122 DCW1YKL046C 1350 nt11.35□□□□□ -0.59
LYS21Q12122 YDR095CYDR095C 411 nt11.34□□□□□ -0.59
LYS21Q12122 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.33□□□□□ -0.6
LYS21Q12122 FUN26YAL022C 1554 nt11.28□□□□□ -0.6
LYS21Q12122 WWM1YFL010C 636 nt11.26□□□□□ -0.61
LYS21Q12122 EMI2YDR516C 1503 nt11.18□□□□□ -0.62
LYS21Q12122 TRM9YML014W 840 nt11.16□□□□□ -0.62
LYS21Q12122 PTP1YDL230W 1008 nt11.15□□□□□ -0.62
LYS21Q12122 ALF1YNL148C 765 nt11.15□□□□□ -0.62
LYS21Q12122 SHU1YHL006C 453 nt11.13□□□□□ -0.63
LYS21Q12122 LSM3YLR438C-A 270 nt11.13□□□□□ -0.63
LYS21Q12122 CAC2YML102W 1407 nt11.11□□□□□ -0.63
LYS21Q12122 RPP2AYOL039W 321 nt11.11□□□□□ -0.63
LYS21Q12122 CCT6YDR188W 1641 nt11.1□□□□□ -0.63
LYS21Q12122 YBR220CYBR220C 1683 nt11.08□□□□□ -0.64
LYS21Q12122 YMR090WYMR090W 684 nt11.08□□□□□ -0.64
LYS21Q12122 YDL221WYDL221W 552 nt11.07□□□□□ -0.64
LYS21Q12122 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.06□□□□□ -0.64
LYS21Q12122 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.05□□□□□ -0.64
LYS21Q12122 YGR021WYGR021W 873 nt11.05□□□□□ -0.64
LYS21Q12122 HOM6YJR139C 1080 nt11.04□□□□□ -0.64
LYS21Q12122 SIS1YNL007C 1059 nt11.03□□□□□ -0.64
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