Protein–RNA interactions for Protein: Q12439

TY2A-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2A-OR1Q12439 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.57■□□□□ 0.72
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TY2A-OR1Q12439 MDJ1YFL016C 1536 nt17.38■□□□□ 0.37
TY2A-OR1Q12439 SRX1YKL086W 384 nt16.56■□□□□ 0.24
TY2A-OR1Q12439 Q0297Q0297 156 nt16.55■□□□□ 0.24
TY2A-OR1Q12439 YJL027CYJL027C 417 nt16.27■□□□□ 0.2
TY2A-OR1Q12439 SCS3YGL126W 1143 nt15.82■□□□□ 0.12
TY2A-OR1Q12439 YCR051WYCR051W 669 nt15.74■□□□□ 0.11
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TY2A-OR1Q12439 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.02■□□□□ -0
TY2A-OR1Q12439 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.02■□□□□ -0
TY2A-OR1Q12439 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.02■□□□□ -0
TY2A-OR1Q12439 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.02■□□□□ -0
TY2A-OR1Q12439 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.02■□□□□ -0
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TY2A-OR1Q12439 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.19□□□□□ -0.14
TY2A-OR1Q12439 ATS1YAL020C 1002 nt14.11□□□□□ -0.15
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TY2A-OR1Q12439 URN1YPR152C 1398 nt13.56□□□□□ -0.24
TY2A-OR1Q12439 DEP1YAL013W 1218 nt13.54□□□□□ -0.24
TY2A-OR1Q12439 RSB1YOR049C 1065 nt13.53□□□□□ -0.24
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TY2A-OR1Q12439 SHU1YHL006C 453 nt12.57□□□□□ -0.4
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TY2A-OR1Q12439 RKM5YLR137W 1104 nt12.09□□□□□ -0.47
TY2A-OR1Q12439 YDR095CYDR095C 411 nt12.08□□□□□ -0.48
TY2A-OR1Q12439 ALF1YNL148C 765 nt12.08□□□□□ -0.48
TY2A-OR1Q12439 MOT3YMR070W 1473 nt12.08□□□□□ -0.48
TY2A-OR1Q12439 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.06□□□□□ -0.48
TY2A-OR1Q12439 MEP2YNL142W 1500 nt12.03□□□□□ -0.48
TY2A-OR1Q12439 CCT6YDR188W 1641 nt12.03□□□□□ -0.48
TY2A-OR1Q12439 YOR139CYOR139C 393 nt12.02□□□□□ -0.49
TY2A-OR1Q12439 NPL3YDR432W 1245 nt12□□□□□ -0.49
TY2A-OR1Q12439 YOL037CYOL037C 354 nt11.99□□□□□ -0.49
TY2A-OR1Q12439 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.97□□□□□ -0.49
TY2A-OR1Q12439 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.97□□□□□ -0.49
TY2A-OR1Q12439 RPP2AYOL039W 321 nt11.85□□□□□ -0.51
TY2A-OR1Q12439 DCW1YKL046C 1350 nt11.84□□□□□ -0.51
TY2A-OR1Q12439 SIS1YNL007C 1059 nt11.83□□□□□ -0.52
TY2A-OR1Q12439 SSA4YER103W 1929 nt11.81□□□□□ -0.52
TY2A-OR1Q12439 PTP1YDL230W 1008 nt11.77□□□□□ -0.53
TY2A-OR1Q12439 EMI2YDR516C 1503 nt11.7□□□□□ -0.54
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