RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	MDR1	P53258	950 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	VPS75	P53853	264 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YAP6	Q03935	383 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	DON1	Q05610	365 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YLR456W	Q06199	204 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	ENV7	Q12003	364 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YVC1	Q12324	675 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.45	□□□□□ -1.54	not detected
YMD8	YML038C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	MRPL40	P36534	297 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PIH1	P38768	344 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PKP1	P40530	394 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	NAS2	P40555	220 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YFL054C	P43549	646 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	CUL3	P53202	744 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	TFC6	Q06339	672 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	ACM1	Q08981	209 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	HER1	Q12276	1246 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PSY3	Q12318	242 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YOR019W	Q99248	730 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	SWI6	P09959	803 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	APE1	P14904	514 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	BET2	P20133	325 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	SEC65	P29478	273 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	SLA2	P33338	968 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	TGL1	P34163	548 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	KDX1	P36005	433 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	DAD2	P36162	133 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	COS111	P38308	924 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	SLX1	P38324	304 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	SWD1	P39706	426 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PRM2	P40534	656 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	INA22	P40576	216 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	CGR1	P53188	120 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	DSL1	P53847	754 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	ATP12	P22135	325 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	CLB3	P24870	427 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	HMX1	P32339	317 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	KRE6	P32486	720 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	FAT1	P38225	669 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PEX32	P38292	413 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YJR061W	P40355	935 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	EFM4	P40516	257 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	GTB1	Q04924	702 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	TRE1	Q08919	783 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	APC2	Q12440	853 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YOR111W	Q99210	232 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	ADH4	P10127	382 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PHO91	P27514	894 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PEP3	P27801	918 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YDR089W	P38966	869 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	EAF5	P39995	279 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YFL052W	P43551	465 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	FET5	P43561	622 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	ALY2	P47029	1046 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	GGA1	Q06336	557 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	RRT8	Q08219	342 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	RCN2	Q12044	265 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	NBP2	Q12163	236 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	GAL7	P08431	366 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SAM35	P14693	329 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CWH43	P25618	953 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	DOA4	P32571	926 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YSC84	P32793	468 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SRB2	P34162	210 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	PFF1	P38244	976 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YHL017W	P38745	532 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	PEX7	P39108	375 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MRX6	P48564	524 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MLC1	P53141	149 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55

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