Protein–RNA interactions for Protein: P53010

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAN2P53010 NSR1YGR159C 1245 nt20.33■□□□□ 0.85
PAN2P53010 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.18■□□□□ 0.82
PAN2P53010 NOP1YDL014W 984 nt19.4■□□□□ 0.7
PAN2P53010 MDJ1YFL016C 1536 nt18.48■□□□□ 0.55
PAN2P53010 YKL036CYKL036C 393 nt17.61■□□□□ 0.41
PAN2P53010 SRX1YKL086W 384 nt16.98■□□□□ 0.31
PAN2P53010 YJL027CYJL027C 417 nt16.97■□□□□ 0.31
PAN2P53010 Q0297Q0297 156 nt16.88■□□□□ 0.29
PAN2P53010 DBP2YNL112W 1641 nt16.19■□□□□ 0.18
PAN2P53010 YCR051WYCR051W 669 nt16.1■□□□□ 0.17
PAN2P53010 SCS3YGL126W 1143 nt16.03■□□□□ 0.16
PAN2P53010 YBR190WYBR190W 312 nt15.8■□□□□ 0.12
PAN2P53010 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.59■□□□□ 0.09
PAN2P53010 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.59■□□□□ 0.09
PAN2P53010 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.59■□□□□ 0.09
PAN2P53010 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.59■□□□□ 0.09
PAN2P53010 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.59■□□□□ 0.09
PAN2P53010 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.59■□□□□ 0.09
PAN2P53010 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.59■□□□□ 0.09
PAN2P53010 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.59■□□□□ 0.09
PAN2P53010 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.59■□□□□ 0.09
PAN2P53010 CCC1YLR220W 969 nt15.46■□□□□ 0.07
PAN2P53010 RTC3YHR087W 336 nt15.45■□□□□ 0.06
PAN2P53010 YOL085CYOL085C 342 nt15.27■□□□□ 0.04
PAN2P53010 RPP1BYDL130W 321 nt15.16■□□□□ 0.02
PAN2P53010 PKP1YIL042C 1185 nt15.12■□□□□ 0.01
PAN2P53010 RVS167YDR388W 1449 nt15.06■□□□□ 0
PAN2P53010 SCJ1YMR214W 1134 nt14.99□□□□□ -0.01
PAN2P53010 PUT4YOR348C 1884 nt14.66□□□□□ -0.06
PAN2P53010 SSA3YBL075C 1950 nt14.64□□□□□ -0.07
PAN2P53010 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.63□□□□□ -0.07
PAN2P53010 PET122YER153C 765 nt14.56□□□□□ -0.08
PAN2P53010 SHR5YOL110W 714 nt14.47□□□□□ -0.09
PAN2P53010 ATS1YAL020C 1002 nt14.41□□□□□ -0.1
PAN2P53010 URN1YPR152C 1398 nt14.33□□□□□ -0.12
PAN2P53010 ARE1YCR048W 1833 nt14.29□□□□□ -0.12
PAN2P53010 DEP1YAL013W 1218 nt14.26□□□□□ -0.13
PAN2P53010 SCR1SCR1 522 nt14.24□□□□□ -0.13
PAN2P53010 SAH1YER043C 1350 nt14.22□□□□□ -0.13
PAN2P53010 POA1YBR022W 534 nt14.19□□□□□ -0.14
PAN2P53010 OPI9YLR338W 858 nt14.18□□□□□ -0.14
PAN2P53010 YDJ1YNL064C 1230 nt14.12□□□□□ -0.15
PAN2P53010 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.11□□□□□ -0.15
PAN2P53010 RRN5YLR141W 1092 nt14.1□□□□□ -0.15
PAN2P53010 RPN10YHR200W 807 nt13.97□□□□□ -0.17
PAN2P53010 BSC6YOL137W 1494 nt13.94□□□□□ -0.18
PAN2P53010 YNL208WYNL208W 600 nt13.93□□□□□ -0.18
PAN2P53010 GAR1YHR089C 618 nt13.91□□□□□ -0.18
PAN2P53010 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.81□□□□□ -0.2
PAN2P53010 BUD23YCR047C 828 nt13.76□□□□□ -0.21
PAN2P53010 PUN1YLR414C 792 nt13.75□□□□□ -0.21
PAN2P53010 RSB1YOR049C 1065 nt13.68□□□□□ -0.22
PAN2P53010 PTC2YER089C 1395 nt13.68□□□□□ -0.22
PAN2P53010 YJR018WYJR018W 363 nt13.64□□□□□ -0.23
PAN2P53010 SPT5YML010W 3192 nt13.56□□□□□ -0.24
PAN2P53010 NAB2YGL122C 1578 nt13.53□□□□□ -0.24
PAN2P53010 TIR1YER011W 765 nt13.45□□□□□ -0.26
PAN2P53010 YJR120WYJR120W 351 nt13.4□□□□□ -0.26
PAN2P53010 SSA1YAL005C 1929 nt13.39□□□□□ -0.27
PAN2P53010 FIS1YIL065C 468 nt13.33□□□□□ -0.28
PAN2P53010 PST2YDR032C 597 nt13.29□□□□□ -0.28
PAN2P53010 DAL1YIR027C 1383 nt13.28□□□□□ -0.28
PAN2P53010 FPR4YLR449W 1179 nt13.27□□□□□ -0.29
PAN2P53010 SSA4YER103W 1929 nt13.25□□□□□ -0.29
PAN2P53010 RPP2BYDR382W 333 nt13.22□□□□□ -0.29
PAN2P53010 PHO4YFR034C 939 nt13.18□□□□□ -0.3
PAN2P53010 INM2YDR287W 879 nt13.17□□□□□ -0.3
PAN2P53010 SRB2YHR041C 633 nt13.15□□□□□ -0.3
PAN2P53010 MEP2YNL142W 1500 nt13.12□□□□□ -0.31
PAN2P53010 YPS1YLR120C 1710 nt13.05□□□□□ -0.32
PAN2P53010 YBL100CYBL100C 315 nt13.01□□□□□ -0.33
PAN2P53010 DCW1YKL046C 1350 nt12.94□□□□□ -0.34
PAN2P53010 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.93□□□□□ -0.34
PAN2P53010 BDH2YAL061W 1254 nt12.92□□□□□ -0.34
PAN2P53010 YDR095CYDR095C 411 nt12.9□□□□□ -0.34
PAN2P53010 YKL097CYKL097C 411 nt12.9□□□□□ -0.34
PAN2P53010 FUN26YAL022C 1554 nt12.86□□□□□ -0.35
PAN2P53010 WWM1YFL010C 636 nt12.83□□□□□ -0.36
PAN2P53010 BDF1YLR399C 2061 nt12.77□□□□□ -0.37
PAN2P53010 EMI2YDR516C 1503 nt12.74□□□□□ -0.37
PAN2P53010 TRM9YML014W 840 nt12.74□□□□□ -0.37
PAN2P53010 ALF1YNL148C 765 nt12.73□□□□□ -0.37
PAN2P53010 SHU1YHL006C 453 nt12.7□□□□□ -0.38
PAN2P53010 PTP1YDL230W 1008 nt12.69□□□□□ -0.38
PAN2P53010 CAC2YML102W 1407 nt12.66□□□□□ -0.38
PAN2P53010 LSM3YLR438C-A 270 nt12.66□□□□□ -0.38
PAN2P53010 RPP2AYOL039W 321 nt12.66□□□□□ -0.38
PAN2P53010 YMR090WYMR090W 684 nt12.63□□□□□ -0.39
PAN2P53010 YBR220CYBR220C 1683 nt12.63□□□□□ -0.39
PAN2P53010 CCT6YDR188W 1641 nt12.62□□□□□ -0.39
PAN2P53010 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.62□□□□□ -0.39
PAN2P53010 YDL221WYDL221W 552 nt12.6□□□□□ -0.39
PAN2P53010 TAT1YBR069C 1860 nt12.59□□□□□ -0.39
PAN2P53010 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.57□□□□□ -0.4
PAN2P53010 YGR021WYGR021W 873 nt12.56□□□□□ -0.4
PAN2P53010 SIS1YNL007C 1059 nt12.55□□□□□ -0.4
PAN2P53010 HOM6YJR139C 1080 nt12.54□□□□□ -0.4
PAN2P53010 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.52□□□□□ -0.41
PAN2P53010 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.52□□□□□ -0.41
PAN2P53010 SDH1YKL148C 1923 nt12.52□□□□□ -0.41
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