RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	FLO1	P32768	1537 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	MYO1	P08964	1928 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YCR051W	P25631	222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	OAF3	P36023	863 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YKR018C	P36114	725 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	PET10	P36139	283 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	OCA5	P38738	679 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	VID27	P40157	782 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	ILM1	P47155	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	KAP114	P53067	1004 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YAP1802	P53309	568 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	HOT1	Q03213	719 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	PIG1	Q06216	648 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YLR177W	Q06251	628 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	DSE3	Q08729	430 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SNF3	P10870	884 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	CKA2	P19454	339 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	EMP70	P32802	667 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YBR184W	P38299	523 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RCK2	P38623	610 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SIP3	P38717	1229 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YEL020C	P39994	560 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	IRR1	P40541	1150 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SSY5	P47002	699 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YJR142W	P47173	342 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	UBC11	P52492	156 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	TOF1	P53840	1238 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	IRC4	Q03036	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	USA1	Q03714	838 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	UBX2	Q04228	584 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	TAF9	Q05027	157 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	ASM4	Q05166	528 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	TAF10	Q12030	206 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	TGL5	Q12043	749 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	XRS2	P33301	854 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	MCD4	P36051	919 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
TVP38	YKR088C	YEL076C	P39971	216 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	HOS4	P40480	1083 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YFH7	P43591	353 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	TOS3	P43637	560 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RPC17	P47076	161 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SGM1	P47166	707 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YGR021W	P53212	290 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	CBK1	P53894	756 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SPC24	Q04477	213 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	NCA2	Q12374	616 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	JIP3	O13555	125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TVP38	YKR088C	MRPS28	P21771	286 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TVP38	YKR088C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TVP38	YKR088C	CDC11	P32458	415 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TVP38	YKR088C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TVP38	YKR088C	SAS3	P34218	831 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TVP38	YKR088C	JNM1	P36224	373 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TVP38	YKR088C	YBR062C	P38239	180 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TVP38	YKR088C	REV7	P38927	245 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TVP38	YKR088C	SAP185	P40856	1058 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TVP38	YKR088C	PFA3	P42836	336 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TVP38	YKR088C	NMD5	P46970	1048 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TVP38	YKR088C	URB2	P47108	1174 aa		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 94.8 ms