RNA–Protein interactions for RNA: YJR136C

TTI2, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI2, Length 1,266 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI2	YJR136C	TDP1	P38319	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	RIC1	P40395	1056 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	CBK1	P53894	756 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	UFO1	Q04511	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	TFC6	Q06339	672 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	TGS1	Q12052	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	CBF2	P32504	956 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	LOT5	P34234	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	IFA38	P38286	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	BNA1	P47096	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	COS12	P53053	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	RKI1	Q12189	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	MED1	Q12321	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	ENT1	Q12518	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	SEM1	O94742	89 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	SPO16	P17122	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	MRPL7	P36519	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	LNP1	P38878	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	AXL2	P38928	823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	DIP5	P53388	608 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	MFM1	Q02783	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	HOF1	Q05080	669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	MRP7	P12687	371 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	YCR061W	P25639	631 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	PAH1	P32567	862 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	CCL1	P37366	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	SDH8	P38345	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	STB5	P38699	743 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	ZAP1	P47043	880 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	NMA2	P53204	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	SPC98	P53540	846 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	SPC19	Q03954	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	TRM8	Q12009	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	COX17	Q12287	69 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	SKM1	Q12469	655 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	LAM4	P38800	1345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	YLR302C	O13544	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	PDE1	P22434	369 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	ELF1	P36053	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	MUP3	P38734	546 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	PIH1	P38768	344 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	YEL020C	P39994	560 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	ASE1	P50275	885 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	SNF12	P53628	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	BSC5	P53755	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	USA1	Q03714	838 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	RCO1	Q04779	684 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	ATG23	Q06671	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	NUS1	Q12063	375 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	SPO11	P23179	398 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	PRE8	P23639	250 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	CRF1	Q04930	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	ICL2	Q12031	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	SUL2	Q12325	893 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	CDC16	P09798	840 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	YMC2	P38087	329 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	VPS8	P39702	1274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	YEL068C	P39977	110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	NDE1	P40215	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	PMT6	P42934	759 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	MRK1	P50873	501 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	VPS4	P52917	437 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	COG1	P53079	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	SNO4	Q04902	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	GTB1	Q04924	702 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	CRT10	Q08226	957 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	HSP32	Q08992	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	SUT2	Q12286	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTI2	YJR136C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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