Protein–RNA interactions for Protein: P08417

FUM1, Fumarate hydratase, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FUM1P08417 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.06■□□□□ 0.8
FUM1P08417 NSR1YGR159C 1245 nt19.85■□□□□ 0.77
FUM1P08417 NOP1YDL014W 984 nt19.44■□□□□ 0.7
FUM1P08417 YKL036CYKL036C 393 nt18.03■□□□□ 0.48
FUM1P08417 MDJ1YFL016C 1536 nt17.67■□□□□ 0.42
FUM1P08417 Q0297Q0297 156 nt17.08■□□□□ 0.32
FUM1P08417 SRX1YKL086W 384 nt17.03■□□□□ 0.32
FUM1P08417 YJL027CYJL027C 417 nt16.84■□□□□ 0.29
FUM1P08417 SCS3YGL126W 1143 nt16.47■□□□□ 0.23
FUM1P08417 YCR051WYCR051W 669 nt16.18■□□□□ 0.18
FUM1P08417 DBP2YNL112W 1641 nt15.67■□□□□ 0.1
FUM1P08417 YOL085CYOL085C 342 nt15.65■□□□□ 0.1
FUM1P08417 PKP1YIL042C 1185 nt15.44■□□□□ 0.06
FUM1P08417 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.4■□□□□ 0.06
FUM1P08417 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.4■□□□□ 0.06
FUM1P08417 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.4■□□□□ 0.06
FUM1P08417 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.4■□□□□ 0.06
FUM1P08417 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.4■□□□□ 0.06
FUM1P08417 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.4■□□□□ 0.06
FUM1P08417 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.4■□□□□ 0.06
FUM1P08417 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.4■□□□□ 0.06
FUM1P08417 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.4■□□□□ 0.06
FUM1P08417 RPP1BYDL130W 321 nt15.33■□□□□ 0.04
FUM1P08417 CCC1YLR220W 969 nt15.26■□□□□ 0.03
FUM1P08417 YBR190WYBR190W 312 nt14.98□□□□□ -0.01
FUM1P08417 ATS1YAL020C 1002 nt14.73□□□□□ -0.05
FUM1P08417 PET122YER153C 765 nt14.69□□□□□ -0.06
FUM1P08417 SCJ1YMR214W 1134 nt14.67□□□□□ -0.06
FUM1P08417 RTC3YHR087W 336 nt14.66□□□□□ -0.06
FUM1P08417 RVS167YDR388W 1449 nt14.61□□□□□ -0.07
FUM1P08417 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.58□□□□□ -0.08
FUM1P08417 SCR1SCR1 522 nt14.45□□□□□ -0.1
FUM1P08417 RRN5YLR141W 1092 nt14.26□□□□□ -0.13
FUM1P08417 SHR5YOL110W 714 nt14.15□□□□□ -0.14
FUM1P08417 YDJ1YNL064C 1230 nt14.07□□□□□ -0.16
FUM1P08417 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.98□□□□□ -0.17
FUM1P08417 RSB1YOR049C 1065 nt13.95□□□□□ -0.18
FUM1P08417 DEP1YAL013W 1218 nt13.81□□□□□ -0.2
FUM1P08417 GAR1YHR089C 618 nt13.79□□□□□ -0.2
FUM1P08417 URN1YPR152C 1398 nt13.76□□□□□ -0.21
FUM1P08417 SSA3YBL075C 1950 nt13.68□□□□□ -0.22
FUM1P08417 PST2YDR032C 597 nt13.65□□□□□ -0.22
FUM1P08417 PUT4YOR348C 1884 nt13.62□□□□□ -0.23
FUM1P08417 OPI9YLR338W 858 nt13.54□□□□□ -0.24
FUM1P08417 YNL208WYNL208W 600 nt13.53□□□□□ -0.24
FUM1P08417 RPN10YHR200W 807 nt13.49□□□□□ -0.25
FUM1P08417 SAH1YER043C 1350 nt13.47□□□□□ -0.25
FUM1P08417 ARE1YCR048W 1833 nt13.4□□□□□ -0.26
FUM1P08417 TIR1YER011W 765 nt13.32□□□□□ -0.28
FUM1P08417 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.21□□□□□ -0.29
FUM1P08417 POA1YBR022W 534 nt13.2□□□□□ -0.3
FUM1P08417 SSA1YAL005C 1929 nt13.19□□□□□ -0.3
FUM1P08417 YJR018WYJR018W 363 nt13.12□□□□□ -0.31
FUM1P08417 PUN1YLR414C 792 nt13.12□□□□□ -0.31
FUM1P08417 SHU1YHL006C 453 nt13.11□□□□□ -0.31
FUM1P08417 YKL097CYKL097C 411 nt13.1□□□□□ -0.31
FUM1P08417 Q0182Q0182 405 nt13.09□□□□□ -0.31
FUM1P08417 SRB2YHR041C 633 nt13.06□□□□□ -0.32
FUM1P08417 YJR120WYJR120W 351 nt13.01□□□□□ -0.33
FUM1P08417 PTC2YER089C 1395 nt12.99□□□□□ -0.33
FUM1P08417 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.93□□□□□ -0.34
FUM1P08417 BUD23YCR047C 828 nt12.9□□□□□ -0.34
FUM1P08417 BSC6YOL137W 1494 nt12.9□□□□□ -0.34
FUM1P08417 RPP2BYDR382W 333 nt12.81□□□□□ -0.36
FUM1P08417 NAB2YGL122C 1578 nt12.78□□□□□ -0.36
FUM1P08417 WWM1YFL010C 636 nt12.78□□□□□ -0.36
FUM1P08417 FIS1YIL065C 468 nt12.66□□□□□ -0.38
FUM1P08417 HOM6YJR139C 1080 nt12.65□□□□□ -0.38
FUM1P08417 MNP1YGL068W 585 nt12.64□□□□□ -0.39
FUM1P08417 YOR139CYOR139C 393 nt12.64□□□□□ -0.39
FUM1P08417 DAL1YIR027C 1383 nt12.64□□□□□ -0.39
FUM1P08417 YGR021WYGR021W 873 nt12.63□□□□□ -0.39
FUM1P08417 FPR4YLR449W 1179 nt12.62□□□□□ -0.39
FUM1P08417 INM2YDR287W 879 nt12.61□□□□□ -0.39
FUM1P08417 BDH2YAL061W 1254 nt12.61□□□□□ -0.39
FUM1P08417 PHO4YFR034C 939 nt12.54□□□□□ -0.4
FUM1P08417 YBL100CYBL100C 315 nt12.53□□□□□ -0.4
FUM1P08417 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.51□□□□□ -0.41
FUM1P08417 RKM5YLR137W 1104 nt12.46□□□□□ -0.41
FUM1P08417 MOT3YMR070W 1473 nt12.46□□□□□ -0.42
FUM1P08417 NPL3YDR432W 1245 nt12.44□□□□□ -0.42
FUM1P08417 LSM3YLR438C-A 270 nt12.43□□□□□ -0.42
FUM1P08417 SPT5YML010W 3192 nt12.4□□□□□ -0.42
FUM1P08417 FUN26YAL022C 1554 nt12.39□□□□□ -0.43
FUM1P08417 TRM9YML014W 840 nt12.35□□□□□ -0.43
FUM1P08417 YOL037CYOL037C 354 nt12.35□□□□□ -0.43
FUM1P08417 YPS1YLR120C 1710 nt12.28□□□□□ -0.44
FUM1P08417 CCT6YDR188W 1641 nt12.24□□□□□ -0.45
FUM1P08417 SSA4YER103W 1929 nt12.22□□□□□ -0.45
FUM1P08417 YDR095CYDR095C 411 nt12.2□□□□□ -0.46
FUM1P08417 ALF1YNL148C 765 nt12.16□□□□□ -0.46
FUM1P08417 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.13□□□□□ -0.47
FUM1P08417 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.13□□□□□ -0.47
FUM1P08417 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.13□□□□□ -0.47
FUM1P08417 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.13□□□□□ -0.47
FUM1P08417 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.13□□□□□ -0.47
FUM1P08417 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.12□□□□□ -0.47
FUM1P08417 YLR281CYLR281C 468 nt12.1□□□□□ -0.47
FUM1P08417 MEP2YNL142W 1500 nt12.09□□□□□ -0.47
FUM1P08417 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.07□□□□□ -0.48
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