RNA–Protein interactions for RNA: YOL033W

MSE1, Transcript of Mitochondrial glutamyl-tRNA synthetase, yeast

Gene MSE1, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSE1	YOL033W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PIN2	Q12057	282 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	AVL9	Q12500	764 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SMC4	Q12267	1418 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	TRP3	P00937	484 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YPK2	P18961	677 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MCM10	P32354	571 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SMI1	P32566	505 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	ORC2	P32833	620 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PMT1	P33775	817 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	STP2	P38704	541 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YHI9	P38765	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	LAM4	P38800	1345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	RCY1	P39531	840 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SAW1	P39735	261 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	RPN14	P53196	417 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PEF1	P53238	335 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YNR063W	P53749	607 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	GTR1	Q00582	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	TAF12	Q03761	539 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SDH5	Q08230	162 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SPO21	Q12411	609 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	DRS2	P39524	1355 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	AI3	P03877	415 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PDE2	P06776	526 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	BIK1	P11709	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
MSE1	YOL033W	PRD1	P25375	712 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	NUP133	P36161	1157 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	TAT1	P38085	619 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	FZO1	P38297	855 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	NUP60	P39705	539 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	CEP3	P40969	608 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SKP2	P42843	763 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	CIT3	P43635	486 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SPO74	P45819	413 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YJR120W	P47157	116 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	TAF4	P50105	388 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YBP2	P53169	641 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MRPL50	P53724	139 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	RMI1	Q02685	241 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	RTT103	Q05543	409 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	GRS2	Q06817	618 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YPD1	Q07688	167 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	GAS5	Q08193	484 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	ATG29	Q12092	213 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SCM3	Q12334	223 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	LAG2	Q92325	660 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SIR3	P06701	978 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MET8	P15807	274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	CDC15	P27636	974 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YUH1	P35127	236 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SEA4	P38164	1038 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YER186C	P40101	306 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YRB2	P40517	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
MSE1	YOL033W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	COX16	P47081	118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	TOF1	P53840	1238 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	TGL2	P54857	326 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MET14	Q02196	202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	UFO1	Q04511	668 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SPR28	Q04921	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SGO1	Q08490	590 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	ELG1	Q12050	791 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PHO8	P11491	566 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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