Protein–RNA interactions for Protein: P32566

SMI1, Cell wall assembly regulator SMI1, yeastyeast

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMI1P32566 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.68■□□□□ 0.9
SMI1P32566 NSR1YGR159C 1245 nt20.6■□□□□ 0.89
SMI1P32566 NOP1YDL014W 984 nt20.02■□□□□ 0.8
SMI1P32566 MDJ1YFL016C 1536 nt18.47■□□□□ 0.55
SMI1P32566 YKL036CYKL036C 393 nt18.35■□□□□ 0.53
SMI1P32566 SRX1YKL086W 384 nt17.47■□□□□ 0.39
SMI1P32566 Q0297Q0297 156 nt17.45■□□□□ 0.38
SMI1P32566 YJL027CYJL027C 417 nt17.13■□□□□ 0.33
SMI1P32566 SCS3YGL126W 1143 nt16.63■□□□□ 0.25
SMI1P32566 YCR051WYCR051W 669 nt16.62■□□□□ 0.25
SMI1P32566 DBP2YNL112W 1641 nt16.23■□□□□ 0.19
SMI1P32566 YOL085CYOL085C 342 nt15.9■□□□□ 0.14
SMI1P32566 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SMI1P32566 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SMI1P32566 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SMI1P32566 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SMI1P32566 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SMI1P32566 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SMI1P32566 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SMI1P32566 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SMI1P32566 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SMI1P32566 CCC1YLR220W 969 nt15.79■□□□□ 0.12
SMI1P32566 YBR190WYBR190W 312 nt15.73■□□□□ 0.11
SMI1P32566 PKP1YIL042C 1185 nt15.72■□□□□ 0.11
SMI1P32566 RPP1BYDL130W 321 nt15.68■□□□□ 0.1
SMI1P32566 RTC3YHR087W 336 nt15.45■□□□□ 0.06
SMI1P32566 RVS167YDR388W 1449 nt15.28■□□□□ 0.04
SMI1P32566 SCJ1YMR214W 1134 nt15.17■□□□□ 0.02
SMI1P32566 PET122YER153C 765 nt15.01□□□□□ -0.01
SMI1P32566 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.99□□□□□ -0.01
SMI1P32566 ATS1YAL020C 1002 nt14.83□□□□□ -0.04
SMI1P32566 SCR1SCR1 522 nt14.82□□□□□ -0.04
SMI1P32566 SHR5YOL110W 714 nt14.7□□□□□ -0.06
SMI1P32566 SSA3YBL075C 1950 nt14.68□□□□□ -0.06
SMI1P32566 RRN5YLR141W 1092 nt14.57□□□□□ -0.08
SMI1P32566 YDJ1YNL064C 1230 nt14.47□□□□□ -0.09
SMI1P32566 URN1YPR152C 1398 nt14.38□□□□□ -0.11
SMI1P32566 DEP1YAL013W 1218 nt14.38□□□□□ -0.11
SMI1P32566 PUT4YOR348C 1884 nt14.38□□□□□ -0.11
SMI1P32566 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.27□□□□□ -0.13
SMI1P32566 RSB1YOR049C 1065 nt14.26□□□□□ -0.13
SMI1P32566 GAR1YHR089C 618 nt14.24□□□□□ -0.13
SMI1P32566 OPI9YLR338W 858 nt14.17□□□□□ -0.14
SMI1P32566 SAH1YER043C 1350 nt14.15□□□□□ -0.14
SMI1P32566 RPN10YHR200W 807 nt14.14□□□□□ -0.15
SMI1P32566 YNL208WYNL208W 600 nt14.09□□□□□ -0.15
SMI1P32566 ARE1YCR048W 1833 nt14.08□□□□□ -0.15
SMI1P32566 POA1YBR022W 534 nt13.97□□□□□ -0.17
SMI1P32566 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.95□□□□□ -0.18
SMI1P32566 PUN1YLR414C 792 nt13.77□□□□□ -0.21
SMI1P32566 PST2YDR032C 597 nt13.74□□□□□ -0.21
SMI1P32566 TIR1YER011W 765 nt13.73□□□□□ -0.21
SMI1P32566 YJR018WYJR018W 363 nt13.7□□□□□ -0.22
SMI1P32566 BSC6YOL137W 1494 nt13.67□□□□□ -0.22
SMI1P32566 BUD23YCR047C 828 nt13.65□□□□□ -0.22
SMI1P32566 PTC2YER089C 1395 nt13.65□□□□□ -0.22
SMI1P32566 SSA1YAL005C 1929 nt13.59□□□□□ -0.23
SMI1P32566 NAB2YGL122C 1578 nt13.45□□□□□ -0.26
SMI1P32566 YJR120WYJR120W 351 nt13.44□□□□□ -0.26
SMI1P32566 RPP2BYDR382W 333 nt13.41□□□□□ -0.26
SMI1P32566 SRB2YHR041C 633 nt13.35□□□□□ -0.27
SMI1P32566 FPR4YLR449W 1179 nt13.31□□□□□ -0.28
SMI1P32566 DAL1YIR027C 1383 nt13.27□□□□□ -0.29
SMI1P32566 FIS1YIL065C 468 nt13.26□□□□□ -0.29
SMI1P32566 SHU1YHL006C 453 nt13.24□□□□□ -0.29
SMI1P32566 INM2YDR287W 879 nt13.22□□□□□ -0.29
SMI1P32566 PHO4YFR034C 939 nt13.16□□□□□ -0.3
SMI1P32566 YKL097CYKL097C 411 nt13.16□□□□□ -0.3
SMI1P32566 WWM1YFL010C 636 nt13.12□□□□□ -0.31
SMI1P32566 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.11□□□□□ -0.31
SMI1P32566 YBL100CYBL100C 315 nt13.1□□□□□ -0.31
SMI1P32566 BDH2YAL061W 1254 nt13.09□□□□□ -0.31
SMI1P32566 SPT5YML010W 3192 nt13□□□□□ -0.33
SMI1P32566 YGR021WYGR021W 873 nt12.98□□□□□ -0.33
SMI1P32566 HOM6YJR139C 1080 nt12.93□□□□□ -0.34
SMI1P32566 FUN26YAL022C 1554 nt12.93□□□□□ -0.34
SMI1P32566 YPS1YLR120C 1710 nt12.91□□□□□ -0.34
SMI1P32566 MNP1YGL068W 585 nt12.89□□□□□ -0.35
SMI1P32566 TRM9YML014W 840 nt12.89□□□□□ -0.35
SMI1P32566 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.88□□□□□ -0.35
SMI1P32566 LSM3YLR438C-A 270 nt12.88□□□□□ -0.35
SMI1P32566 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.83□□□□□ -0.36
SMI1P32566 MEP2YNL142W 1500 nt12.82□□□□□ -0.36
SMI1P32566 YDR095CYDR095C 411 nt12.81□□□□□ -0.36
SMI1P32566 ALF1YNL148C 765 nt12.8□□□□□ -0.36
SMI1P32566 RKM5YLR137W 1104 nt12.75□□□□□ -0.37
SMI1P32566 CCT6YDR188W 1641 nt12.73□□□□□ -0.37
SMI1P32566 SSA4YER103W 1929 nt12.65□□□□□ -0.38
SMI1P32566 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.65□□□□□ -0.38
SMI1P32566 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.65□□□□□ -0.38
SMI1P32566 YOR139CYOR139C 393 nt12.64□□□□□ -0.39
SMI1P32566 DCW1YKL046C 1350 nt12.64□□□□□ -0.39
SMI1P32566 Q0182Q0182 405 nt12.63□□□□□ -0.39
SMI1P32566 NPL3YDR432W 1245 nt12.6□□□□□ -0.39
SMI1P32566 YOL037CYOL037C 354 nt12.58□□□□□ -0.4
SMI1P32566 RPP2AYOL039W 321 nt12.58□□□□□ -0.4
SMI1P32566 SIS1YNL007C 1059 nt12.55□□□□□ -0.4
SMI1P32566 PTP1YDL230W 1008 nt12.53□□□□□ -0.4
SMI1P32566 EMI2YDR516C 1503 nt12.47□□□□□ -0.41
SMI1P32566 CAC2YML102W 1407 nt12.46□□□□□ -0.41
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