Protein–RNA interactions for Protein: Q08968

FMP40, UPF0061 protein FMP40, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FMP40Q08968 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.72■□□□□ 0.59
FMP40Q08968 NSR1YGR159C 1245 nt18.57■□□□□ 0.56
FMP40Q08968 NOP1YDL014W 984 nt18.17■□□□□ 0.5
FMP40Q08968 YKL036CYKL036C 393 nt16.72■□□□□ 0.27
FMP40Q08968 MDJ1YFL016C 1536 nt16.55■□□□□ 0.24
FMP40Q08968 Q0297Q0297 156 nt15.85■□□□□ 0.13
FMP40Q08968 SRX1YKL086W 384 nt15.84■□□□□ 0.13
FMP40Q08968 YJL027CYJL027C 417 nt15.63■□□□□ 0.09
FMP40Q08968 SCS3YGL126W 1143 nt15.19■□□□□ 0.02
FMP40Q08968 YCR051WYCR051W 669 nt15.08■□□□□ 0
FMP40Q08968 DBP2YNL112W 1641 nt14.57□□□□□ -0.08
FMP40Q08968 YOL085CYOL085C 342 nt14.46□□□□□ -0.09
FMP40Q08968 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.34□□□□□ -0.11
FMP40Q08968 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.34□□□□□ -0.11
FMP40Q08968 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.34□□□□□ -0.11
FMP40Q08968 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.34□□□□□ -0.11
FMP40Q08968 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.34□□□□□ -0.11
FMP40Q08968 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.34□□□□□ -0.11
FMP40Q08968 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.34□□□□□ -0.11
FMP40Q08968 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.34□□□□□ -0.11
FMP40Q08968 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.34□□□□□ -0.11
FMP40Q08968 PKP1YIL042C 1185 nt14.29□□□□□ -0.12
FMP40Q08968 CCC1YLR220W 969 nt14.26□□□□□ -0.13
FMP40Q08968 RPP1BYDL130W 321 nt14.24□□□□□ -0.13
FMP40Q08968 YBR190WYBR190W 312 nt14.1□□□□□ -0.15
FMP40Q08968 RTC3YHR087W 336 nt13.86□□□□□ -0.19
FMP40Q08968 SSA3YBL075C 1950 nt13.85□□□□□ -0.19
FMP40Q08968 RVS167YDR388W 1449 nt13.79□□□□□ -0.2
FMP40Q08968 SCJ1YMR214W 1134 nt13.66□□□□□ -0.22
FMP40Q08968 PET122YER153C 765 nt13.62□□□□□ -0.23
FMP40Q08968 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.57□□□□□ -0.24
FMP40Q08968 ATS1YAL020C 1002 nt13.56□□□□□ -0.24
FMP40Q08968 SCR1SCR1 522 nt13.5□□□□□ -0.25
FMP40Q08968 SHR5YOL110W 714 nt13.26□□□□□ -0.29
FMP40Q08968 RRN5YLR141W 1092 nt13.22□□□□□ -0.29
FMP40Q08968 YDJ1YNL064C 1230 nt13.11□□□□□ -0.31
FMP40Q08968 RSB1YOR049C 1065 nt12.98□□□□□ -0.33
FMP40Q08968 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.95□□□□□ -0.34
FMP40Q08968 DEP1YAL013W 1218 nt12.93□□□□□ -0.34
FMP40Q08968 PUT4YOR348C 1884 nt12.93□□□□□ -0.34
FMP40Q08968 URN1YPR152C 1398 nt12.92□□□□□ -0.34
FMP40Q08968 GAR1YHR089C 618 nt12.87□□□□□ -0.35
FMP40Q08968 RPN10YHR200W 807 nt12.76□□□□□ -0.37
FMP40Q08968 OPI9YLR338W 858 nt12.71□□□□□ -0.37
FMP40Q08968 YNL208WYNL208W 600 nt12.7□□□□□ -0.38
FMP40Q08968 SAH1YER043C 1350 nt12.66□□□□□ -0.38
FMP40Q08968 ARE1YCR048W 1833 nt12.58□□□□□ -0.4
FMP40Q08968 PST2YDR032C 597 nt12.54□□□□□ -0.4
FMP40Q08968 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.46□□□□□ -0.41
FMP40Q08968 POA1YBR022W 534 nt12.46□□□□□ -0.41
FMP40Q08968 TIR1YER011W 765 nt12.42□□□□□ -0.42
FMP40Q08968 PUN1YLR414C 792 nt12.37□□□□□ -0.43
FMP40Q08968 YJR018WYJR018W 363 nt12.32□□□□□ -0.44
FMP40Q08968 BSC6YOL137W 1494 nt12.27□□□□□ -0.45
FMP40Q08968 SSA1YAL005C 1929 nt12.25□□□□□ -0.45
FMP40Q08968 PTC2YER089C 1395 nt12.22□□□□□ -0.45
FMP40Q08968 BUD23YCR047C 828 nt12.2□□□□□ -0.46
FMP40Q08968 Q0182Q0182 405 nt12.14□□□□□ -0.47
FMP40Q08968 RPP2BYDR382W 333 nt12.1□□□□□ -0.47
FMP40Q08968 YKL097CYKL097C 411 nt12.09□□□□□ -0.47
FMP40Q08968 SPT5YML010W 3192 nt12.07□□□□□ -0.48
FMP40Q08968 YJR120WYJR120W 351 nt12.07□□□□□ -0.48
FMP40Q08968 SHU1YHL006C 453 nt12.06□□□□□ -0.48
FMP40Q08968 NAB2YGL122C 1578 nt12.05□□□□□ -0.48
FMP40Q08968 SRB2YHR041C 633 nt12.01□□□□□ -0.49
FMP40Q08968 FPR4YLR449W 1179 nt11.93□□□□□ -0.5
FMP40Q08968 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.91□□□□□ -0.5
FMP40Q08968 DAL1YIR027C 1383 nt11.9□□□□□ -0.5
FMP40Q08968 INM2YDR287W 879 nt11.88□□□□□ -0.51
FMP40Q08968 FIS1YIL065C 468 nt11.88□□□□□ -0.51
FMP40Q08968 WWM1YFL010C 636 nt11.87□□□□□ -0.51
FMP40Q08968 SSA4YER103W 1929 nt11.86□□□□□ -0.51
FMP40Q08968 BDH2YAL061W 1254 nt11.81□□□□□ -0.52
FMP40Q08968 YGR021WYGR021W 873 nt11.8□□□□□ -0.52
FMP40Q08968 PHO4YFR034C 939 nt11.79□□□□□ -0.52
FMP40Q08968 YBL100CYBL100C 315 nt11.79□□□□□ -0.52
FMP40Q08968 PAC11YDR488C 1602 nt11.73□□□□□ -0.53
FMP40Q08968 HOM6YJR139C 1080 nt11.73□□□□□ -0.53
FMP40Q08968 MNP1YGL068W 585 nt11.7□□□□□ -0.54
FMP40Q08968 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.67□□□□□ -0.54
FMP40Q08968 FPS1YLL043W 2010 nt11.64□□□□□ -0.55
FMP40Q08968 LSM3YLR438C-A 270 nt11.63□□□□□ -0.55
FMP40Q08968 FUN26YAL022C 1554 nt11.62□□□□□ -0.55
FMP40Q08968 TRM9YML014W 840 nt11.61□□□□□ -0.55
FMP40Q08968 MEP2YNL142W 1500 nt11.57□□□□□ -0.56
FMP40Q08968 RKM5YLR137W 1104 nt11.57□□□□□ -0.56
FMP40Q08968 YOR139CYOR139C 393 nt11.56□□□□□ -0.56
FMP40Q08968 NPL3YDR432W 1245 nt11.54□□□□□ -0.56
FMP40Q08968 MOT3YMR070W 1473 nt11.53□□□□□ -0.56
FMP40Q08968 YPS1YLR120C 1710 nt11.53□□□□□ -0.56
FMP40Q08968 ALF1YNL148C 765 nt11.52□□□□□ -0.57
FMP40Q08968 NVJ2YPR091C 2313 nt11.52□□□□□ -0.57
FMP40Q08968 BDF1YLR399C 2061 nt11.51□□□□□ -0.57
FMP40Q08968 YOL037CYOL037C 354 nt11.49□□□□□ -0.57
FMP40Q08968 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.48□□□□□ -0.57
FMP40Q08968 YDR095CYDR095C 411 nt11.47□□□□□ -0.57
FMP40Q08968 CCT6YDR188W 1641 nt11.46□□□□□ -0.58
FMP40Q08968 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.41□□□□□ -0.58
FMP40Q08968 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.41□□□□□ -0.58
FMP40Q08968 TAT1YBR069C 1860 nt11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.6 ms