Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.31■■□□□ 1
SGO1Q08490 NOP1YDL014W 984 nt20.88■□□□□ 0.93
SGO1Q08490 NSR1YGR159C 1245 nt20.66■□□□□ 0.9
SGO1Q08490 YKL036CYKL036C 393 nt19.82■□□□□ 0.76
SGO1Q08490 YJL027CYJL027C 417 nt18.6■□□□□ 0.57
SGO1Q08490 Q0297Q0297 156 nt18.5■□□□□ 0.55
SGO1Q08490 SCS3YGL126W 1143 nt18.35■□□□□ 0.53
SGO1Q08490 SRX1YKL086W 384 nt18.28■□□□□ 0.52
SGO1Q08490 MDJ1YFL016C 1536 nt17.88■□□□□ 0.45
SGO1Q08490 YCR051WYCR051W 669 nt17.39■□□□□ 0.37
SGO1Q08490 YOL085CYOL085C 342 nt17.17■□□□□ 0.34
SGO1Q08490 SCJ1YMR214W 1134 nt16.9■□□□□ 0.3
SGO1Q08490 PKP1YIL042C 1185 nt16.86■□□□□ 0.29
SGO1Q08490 RPP1BYDL130W 321 nt16.59■□□□□ 0.25
SGO1Q08490 ATS1YAL020C 1002 nt16.55■□□□□ 0.24
SGO1Q08490 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.23■□□□□ 0.19
SGO1Q08490 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.23■□□□□ 0.19
SGO1Q08490 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.23■□□□□ 0.19
SGO1Q08490 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.23■□□□□ 0.19
SGO1Q08490 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.23■□□□□ 0.19
SGO1Q08490 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.23■□□□□ 0.19
SGO1Q08490 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.23■□□□□ 0.19
SGO1Q08490 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.23■□□□□ 0.19
SGO1Q08490 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.23■□□□□ 0.19
SGO1Q08490 CCC1YLR220W 969 nt16.06■□□□□ 0.16
SGO1Q08490 DBP2YNL112W 1641 nt16.05■□□□□ 0.16
SGO1Q08490 PET122YER153C 765 nt15.82■□□□□ 0.12
SGO1Q08490 SCR1SCR1 522 nt15.75■□□□□ 0.11
SGO1Q08490 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.53■□□□□ 0.08
SGO1Q08490 RRN5YLR141W 1092 nt15.41■□□□□ 0.06
SGO1Q08490 RTC3YHR087W 336 nt15.39■□□□□ 0.05
SGO1Q08490 RSB1YOR049C 1065 nt15.25■□□□□ 0.03
SGO1Q08490 PST2YDR032C 597 nt15.24■□□□□ 0.03
SGO1Q08490 RVS167YDR388W 1449 nt15.15■□□□□ 0.02
SGO1Q08490 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.11■□□□□ 0.01
SGO1Q08490 YBR190WYBR190W 312 nt15.05■□□□□ -0
SGO1Q08490 YDJ1YNL064C 1230 nt14.99□□□□□ -0.01
SGO1Q08490 YKL097CYKL097C 411 nt14.92□□□□□ -0.02
SGO1Q08490 SSA3YBL075C 1950 nt14.85□□□□□ -0.03
SGO1Q08490 SHR5YOL110W 714 nt14.78□□□□□ -0.04
SGO1Q08490 GAR1YHR089C 618 nt14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q08490 SHU1YHL006C 453 nt14.51□□□□□ -0.09
SGO1Q08490 YOR139CYOR139C 393 nt14.26□□□□□ -0.13
SGO1Q08490 DEP1YAL013W 1218 nt14.21□□□□□ -0.13
SGO1Q08490 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.12□□□□□ -0.15
SGO1Q08490 TIR1YER011W 765 nt14.07□□□□□ -0.16
SGO1Q08490 URN1YPR152C 1398 nt14.04□□□□□ -0.16
SGO1Q08490 YNL208WYNL208W 600 nt14.01□□□□□ -0.17
SGO1Q08490 NPL3YDR432W 1245 nt13.97□□□□□ -0.17
SGO1Q08490 RPN10YHR200W 807 nt13.91□□□□□ -0.18
SGO1Q08490 SSA1YAL005C 1929 nt13.82□□□□□ -0.2
SGO1Q08490 SRB2YHR041C 633 nt13.75□□□□□ -0.21
SGO1Q08490 OPI9YLR338W 858 nt13.71□□□□□ -0.21
SGO1Q08490 MNP1YGL068W 585 nt13.68□□□□□ -0.22
SGO1Q08490 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.64□□□□□ -0.23
SGO1Q08490 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.64□□□□□ -0.23
SGO1Q08490 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.64□□□□□ -0.23
SGO1Q08490 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.64□□□□□ -0.23
SGO1Q08490 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.64□□□□□ -0.23
SGO1Q08490 HOM6YJR139C 1080 nt13.64□□□□□ -0.23
SGO1Q08490 YOL037CYOL037C 354 nt13.62□□□□□ -0.23
SGO1Q08490 YGR021WYGR021W 873 nt13.61□□□□□ -0.23
SGO1Q08490 WWM1YFL010C 636 nt13.57□□□□□ -0.24
SGO1Q08490 PUT4YOR348C 1884 nt13.57□□□□□ -0.24
SGO1Q08490 SAH1YER043C 1350 nt13.5□□□□□ -0.25
SGO1Q08490 RKM5YLR137W 1104 nt13.43□□□□□ -0.26
SGO1Q08490 YJR018WYJR018W 363 nt13.41□□□□□ -0.26
SGO1Q08490 YJR120WYJR120W 351 nt13.4□□□□□ -0.26
SGO1Q08490 MOT3YMR070W 1473 nt13.35□□□□□ -0.27
SGO1Q08490 PUS2YGL063W 1113 nt13.33□□□□□ -0.28
SGO1Q08490 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.31□□□□□ -0.28
SGO1Q08490 PUN1YLR414C 792 nt13.3□□□□□ -0.28
SGO1Q08490 YLR281CYLR281C 468 nt13.28□□□□□ -0.28
SGO1Q08490 RPP2BYDR382W 333 nt13.26□□□□□ -0.29
SGO1Q08490 ARE1YCR048W 1833 nt13.22□□□□□ -0.29
SGO1Q08490 BSC6YOL137W 1494 nt13.19□□□□□ -0.3
SGO1Q08490 WHI5YOR083W 888 nt13.15□□□□□ -0.3
SGO1Q08490 BDH2YAL061W 1254 nt13.12□□□□□ -0.31
SGO1Q08490 POA1YBR022W 534 nt13.07□□□□□ -0.32
SGO1Q08490 SPT5YML010W 3192 nt13.07□□□□□ -0.32
SGO1Q08490 PTC2YER089C 1395 nt13.06□□□□□ -0.32
SGO1Q08490 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.04□□□□□ -0.32
SGO1Q08490 LSM3YLR438C-A 270 nt13.04□□□□□ -0.32
SGO1Q08490 FMP45YDL222C 930 nt13.01□□□□□ -0.33
SGO1Q08490 YPR011CYPR011C 981 nt13□□□□□ -0.33
SGO1Q08490 SSA4YER103W 1929 nt13□□□□□ -0.33
SGO1Q08490 MRPL8YJL063C 717 nt12.98□□□□□ -0.33
SGO1Q08490 YLR236CYLR236C 324 nt12.93□□□□□ -0.34
SGO1Q08490 DSK2YMR276W 1122 nt12.93□□□□□ -0.34
SGO1Q08490 YCH1YGR203W 447 nt12.89□□□□□ -0.35
SGO1Q08490 INM2YDR287W 879 nt12.84□□□□□ -0.35
SGO1Q08490 YBL100CYBL100C 315 nt12.84□□□□□ -0.35
SGO1Q08490 IMP2'YIL154C 1041 nt12.81□□□□□ -0.36
SGO1Q08490 NAB2YGL122C 1578 nt12.79□□□□□ -0.36
SGO1Q08490 UBX6YJL048C 1191 nt12.79□□□□□ -0.36
SGO1Q08490 BUD23YCR047C 828 nt12.77□□□□□ -0.37
SGO1Q08490 ADO1YJR105W 1023 nt12.75□□□□□ -0.37
SGO1Q08490 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.75□□□□□ -0.37
SGO1Q08490 TRM9YML014W 840 nt12.75□□□□□ -0.37
SGO1Q08490 DAL1YIR027C 1383 nt12.74□□□□□ -0.37
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