RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ECM7	Q06200	448 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
PDR10	YOR328W	POP4	P38336	279 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SPO71	Q03868	1245 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
PDR10	YOR328W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ATP4	P05626	244 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	AEP2	P22136	580 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	UBP5	P39944	805 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	PCL10	P53124	433 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SPC98	P53540	846 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YNL144C	P53907	740 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	COG6	P53959	839 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	GCN5	Q03330	439 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	NDI1	P32340	513 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	HSL7	P38274	827 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YIL054W	P40524	105 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	MAL11	P53048	616 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	HIP1	P06775	603 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	TUP1	P16649	713 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SIR1	P21691	654 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	RRN3	P36070	627 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ULI1	P43604	169 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	EEB1	Q02891	456 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	HEH2	Q03281	663 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	FMP25	Q08023	583 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	AIM39	Q08223	395 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YHR054C	P38780	354 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	TVP23	P38962	199 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	TMN3	P40071	706 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	TAD1	P53065	400 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	MEI4	P29467	408 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	VHC1	P38329	1120 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	AFG3	P39925	761 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	MAM33	P40513	266 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	CTF3	Q12748	733 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	NHA1	Q99271	985 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	PTH2	P34222	208 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	NUT1	P53114	1132 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	REG1	Q00816	1014 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	STP1	Q00947	519 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YPL034W	Q03083	165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ATG16	Q03818	150 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	UFO1	Q04511	668 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YHL026C	P38740	315 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	JHD1	P40034	492 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YJR079W	P47126	109 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ZIP2	P53061	704 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SNX41	Q04053	625 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	TAF9	Q05027	157 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ACM1	Q08981	209 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	VPS5	Q92331	675 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	BRF1	P29056	596 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	YMR134W	P40207	237 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	EFM4	P40516	257 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	GUF1	P46943	645 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	TRE2	Q08693	809 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	PET111	P08468	800 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	GPI10	P30777	616 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	MSC7	P38694	644 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SLX8	P40072	274 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	IRR1	P40541	1150 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	DAS1	P47005	663 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	VTI1	Q04338	217 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	ECI1	Q05871	280 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	SFL1	P20134	766 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PDR10	YOR328W	PEP7	P32609	515 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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