Protein–RNA interactions for Protein: P40072

SLX8, E3 ubiquitin-protein ligase complex SLX5-SLX8 subunit SLX8, yeastyeast

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX8P40072 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.54■□□□□ 0.88
SLX8P40072 NSR1YGR159C 1245 nt20.53■□□□□ 0.88
SLX8P40072 NOP1YDL014W 984 nt19.98■□□□□ 0.79
SLX8P40072 YKL036CYKL036C 393 nt18.43■□□□□ 0.54
SLX8P40072 MDJ1YFL016C 1536 nt18.21■□□□□ 0.51
SLX8P40072 Q0297Q0297 156 nt17.56■□□□□ 0.4
SLX8P40072 SRX1YKL086W 384 nt17.51■□□□□ 0.39
SLX8P40072 Q0182Q0182 405 nt17.43■□□□□ 0.38
SLX8P40072 YJL027CYJL027C 417 nt17.16■□□□□ 0.34
SLX8P40072 MOT3YMR070W 1473 nt16.92■□□□□ 0.3
SLX8P40072 SCS3YGL126W 1143 nt16.78■□□□□ 0.28
SLX8P40072 YCR051WYCR051W 669 nt16.53■□□□□ 0.24
SLX8P40072 DBP2YNL112W 1641 nt16.2■□□□□ 0.18
SLX8P40072 YOL085CYOL085C 342 nt16■□□□□ 0.15
SLX8P40072 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.86■□□□□ 0.13
SLX8P40072 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.86■□□□□ 0.13
SLX8P40072 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.86■□□□□ 0.13
SLX8P40072 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.86■□□□□ 0.13
SLX8P40072 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.86■□□□□ 0.13
SLX8P40072 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.86■□□□□ 0.13
SLX8P40072 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.86■□□□□ 0.13
SLX8P40072 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.86■□□□□ 0.13
SLX8P40072 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.86■□□□□ 0.13
SLX8P40072 RPP1BYDL130W 321 nt15.73■□□□□ 0.11
SLX8P40072 PKP1YIL042C 1185 nt15.71■□□□□ 0.11
SLX8P40072 CCC1YLR220W 969 nt15.6■□□□□ 0.09
SLX8P40072 YBR190WYBR190W 312 nt15.57■□□□□ 0.08
SLX8P40072 RTC3YHR087W 336 nt15.12■□□□□ 0.01
SLX8P40072 SCJ1YMR214W 1134 nt15.1■□□□□ 0.01
SLX8P40072 RVS167YDR388W 1449 nt15.08■□□□□ 0
SLX8P40072 PET122YER153C 765 nt15.02■□□□□ -0
SLX8P40072 ATS1YAL020C 1002 nt15.01□□□□□ -0.01
SLX8P40072 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.98□□□□□ -0.01
SLX8P40072 SCR1SCR1 522 nt14.8□□□□□ -0.04
SLX8P40072 SHR5YOL110W 714 nt14.61□□□□□ -0.07
SLX8P40072 RRN5YLR141W 1092 nt14.59□□□□□ -0.07
SLX8P40072 YDJ1YNL064C 1230 nt14.52□□□□□ -0.09
SLX8P40072 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.32□□□□□ -0.12
SLX8P40072 RSB1YOR049C 1065 nt14.21□□□□□ -0.13
SLX8P40072 PUT4YOR348C 1884 nt14.2□□□□□ -0.14
SLX8P40072 URN1YPR152C 1398 nt14.2□□□□□ -0.14
SLX8P40072 DEP1YAL013W 1218 nt14.15□□□□□ -0.14
SLX8P40072 GAR1YHR089C 618 nt14.13□□□□□ -0.15
SLX8P40072 OPI9YLR338W 858 nt14.05□□□□□ -0.16
SLX8P40072 SSA1YAL005C 1929 nt13.96□□□□□ -0.17
SLX8P40072 YNL208WYNL208W 600 nt13.96□□□□□ -0.17
SLX8P40072 PST2YDR032C 597 nt13.95□□□□□ -0.18
SLX8P40072 RPN10YHR200W 807 nt13.94□□□□□ -0.18
SLX8P40072 SAH1YER043C 1350 nt13.94□□□□□ -0.18
SLX8P40072 ARE1YCR048W 1833 nt13.93□□□□□ -0.18
SLX8P40072 TIR1YER011W 765 nt13.69□□□□□ -0.22
SLX8P40072 POA1YBR022W 534 nt13.69□□□□□ -0.22
SLX8P40072 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.68□□□□□ -0.22
SLX8P40072 PUN1YLR414C 792 nt13.6□□□□□ -0.23
SLX8P40072 NME1NME1 340 nt13.59□□□□□ -0.23
SLX8P40072 YJR018WYJR018W 363 nt13.55□□□□□ -0.24
SLX8P40072 SSA3YBL075C 1950 nt13.48□□□□□ -0.25
SLX8P40072 YJR120WYJR120W 351 nt13.45□□□□□ -0.26
SLX8P40072 PTC2YER089C 1395 nt13.44□□□□□ -0.26
SLX8P40072 BSC6YOL137W 1494 nt13.42□□□□□ -0.26
SLX8P40072 YKL097CYKL097C 411 nt13.4□□□□□ -0.26
SLX8P40072 SRB2YHR041C 633 nt13.39□□□□□ -0.27
SLX8P40072 SHU1YHL006C 453 nt13.36□□□□□ -0.27
SLX8P40072 BUD23YCR047C 828 nt13.31□□□□□ -0.28
SLX8P40072 NAB2YGL122C 1578 nt13.27□□□□□ -0.29
SLX8P40072 YGR139WYGR139W 339 nt13.22□□□□□ -0.29
SLX8P40072 RPP2BYDR382W 333 nt13.21□□□□□ -0.29
SLX8P40072 FIS1YIL065C 468 nt13.13□□□□□ -0.31
SLX8P40072 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.13□□□□□ -0.31
SLX8P40072 DAL1YIR027C 1383 nt13.09□□□□□ -0.31
SLX8P40072 INM2YDR287W 879 nt13.08□□□□□ -0.32
SLX8P40072 WWM1YFL010C 636 nt13.08□□□□□ -0.32
SLX8P40072 BDH2YAL061W 1254 nt13.02□□□□□ -0.33
SLX8P40072 YGR021WYGR021W 873 nt12.98□□□□□ -0.33
SLX8P40072 HOM6YJR139C 1080 nt12.98□□□□□ -0.33
SLX8P40072 SPT5YML010W 3192 nt12.97□□□□□ -0.33
SLX8P40072 PHO4YFR034C 939 nt12.97□□□□□ -0.33
SLX8P40072 FPR4YLR449W 1179 nt12.97□□□□□ -0.33
SLX8P40072 YBL100CYBL100C 315 nt12.93□□□□□ -0.34
SLX8P40072 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.88□□□□□ -0.35
SLX8P40072 MNP1YGL068W 585 nt12.87□□□□□ -0.35
SLX8P40072 LSM3YLR438C-A 270 nt12.87□□□□□ -0.35
SLX8P40072 YOR139CYOR139C 393 nt12.86□□□□□ -0.35
SLX8P40072 FRE6YLL051C 2139 nt12.83□□□□□ -0.35
SLX8P40072 FUN26YAL022C 1554 nt12.8□□□□□ -0.36
SLX8P40072 RKM5YLR137W 1104 nt12.78□□□□□ -0.36
SLX8P40072 YPS1YLR120C 1710 nt12.76□□□□□ -0.37
SLX8P40072 NPL3YDR432W 1245 nt12.76□□□□□ -0.37
SLX8P40072 TRM9YML014W 840 nt12.74□□□□□ -0.37
SLX8P40072 FPS1YLL043W 2010 nt12.72□□□□□ -0.37
SLX8P40072 YDR095CYDR095C 411 nt12.68□□□□□ -0.38
SLX8P40072 CCT6YDR188W 1641 nt12.68□□□□□ -0.38
SLX8P40072 RPM1RPM1 483 nt12.66□□□□□ -0.38
SLX8P40072 YOL037CYOL037C 354 nt12.66□□□□□ -0.38
SLX8P40072 MEP2YNL142W 1500 nt12.62□□□□□ -0.39
SLX8P40072 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.54□□□□□ -0.4
SLX8P40072 ALF1YNL148C 765 nt12.54□□□□□ -0.4
SLX8P40072 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.5□□□□□ -0.41
SLX8P40072 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.5□□□□□ -0.41
SLX8P40072 SIS1YNL007C 1059 nt12.48□□□□□ -0.41
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