Protein–RNA interactions for Protein: P38336

POP4, RNases MRP/P 32.9 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POP4P38336 NSR1YGR159C 1245 nt21.05■□□□□ 0.96
POP4P38336 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.94■□□□□ 0.94
POP4P38336 NOP1YDL014W 984 nt20.27■□□□□ 0.84
POP4P38336 MDJ1YFL016C 1536 nt18.93■□□□□ 0.62
POP4P38336 YKL036CYKL036C 393 nt18.45■□□□□ 0.54
POP4P38336 SRX1YKL086W 384 nt17.7■□□□□ 0.42
POP4P38336 Q0297Q0297 156 nt17.65■□□□□ 0.42
POP4P38336 YJL027CYJL027C 417 nt17.46■□□□□ 0.39
POP4P38336 YCR051WYCR051W 669 nt16.77■□□□□ 0.28
POP4P38336 SCS3YGL126W 1143 nt16.64■□□□□ 0.25
POP4P38336 DBP2YNL112W 1641 nt16.63■□□□□ 0.25
POP4P38336 YBR190WYBR190W 312 nt16.22■□□□□ 0.19
POP4P38336 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.16■□□□□ 0.18
POP4P38336 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.16■□□□□ 0.18
POP4P38336 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.16■□□□□ 0.18
POP4P38336 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.16■□□□□ 0.18
POP4P38336 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.16■□□□□ 0.18
POP4P38336 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.16■□□□□ 0.18
POP4P38336 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.16■□□□□ 0.18
POP4P38336 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.16■□□□□ 0.18
POP4P38336 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.16■□□□□ 0.18
POP4P38336 CCC1YLR220W 969 nt15.99■□□□□ 0.15
POP4P38336 YOL085CYOL085C 342 nt15.98■□□□□ 0.15
POP4P38336 RTC3YHR087W 336 nt15.85■□□□□ 0.13
POP4P38336 RPP1BYDL130W 321 nt15.84■□□□□ 0.13
POP4P38336 PKP1YIL042C 1185 nt15.76■□□□□ 0.11
POP4P38336 RVS167YDR388W 1449 nt15.61■□□□□ 0.09
POP4P38336 SCJ1YMR214W 1134 nt15.45■□□□□ 0.06
POP4P38336 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.2■□□□□ 0.02
POP4P38336 PET122YER153C 765 nt15.16■□□□□ 0.02
POP4P38336 SHR5YOL110W 714 nt15□□□□□ -0.01
POP4P38336 SCR1SCR1 522 nt14.93□□□□□ -0.02
POP4P38336 PUT4YOR348C 1884 nt14.91□□□□□ -0.02
POP4P38336 ATS1YAL020C 1002 nt14.81□□□□□ -0.04
POP4P38336 URN1YPR152C 1398 nt14.73□□□□□ -0.05
POP4P38336 YDJ1YNL064C 1230 nt14.72□□□□□ -0.05
POP4P38336 RRN5YLR141W 1092 nt14.69□□□□□ -0.06
POP4P38336 DEP1YAL013W 1218 nt14.64□□□□□ -0.07
POP4P38336 OPI9YLR338W 858 nt14.58□□□□□ -0.08
POP4P38336 ARE1YCR048W 1833 nt14.56□□□□□ -0.08
POP4P38336 SAH1YER043C 1350 nt14.54□□□□□ -0.08
POP4P38336 SSA3YBL075C 1950 nt14.51□□□□□ -0.09
POP4P38336 RPN10YHR200W 807 nt14.47□□□□□ -0.09
POP4P38336 POA1YBR022W 534 nt14.42□□□□□ -0.1
POP4P38336 GAR1YHR089C 618 nt14.41□□□□□ -0.1
POP4P38336 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.4□□□□□ -0.1
POP4P38336 YNL208WYNL208W 600 nt14.4□□□□□ -0.1
POP4P38336 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.39□□□□□ -0.11
POP4P38336 RSB1YOR049C 1065 nt14.31□□□□□ -0.12
POP4P38336 BSC6YOL137W 1494 nt14.17□□□□□ -0.14
POP4P38336 PUN1YLR414C 792 nt14.16□□□□□ -0.14
POP4P38336 YJR018WYJR018W 363 nt14.04□□□□□ -0.16
POP4P38336 BUD23YCR047C 828 nt14.03□□□□□ -0.16
POP4P38336 PTC2YER089C 1395 nt14.02□□□□□ -0.17
POP4P38336 TIR1YER011W 765 nt13.95□□□□□ -0.18
POP4P38336 NAB2YGL122C 1578 nt13.88□□□□□ -0.19
POP4P38336 SSA1YAL005C 1929 nt13.83□□□□□ -0.2
POP4P38336 PST2YDR032C 597 nt13.76□□□□□ -0.21
POP4P38336 YJR120WYJR120W 351 nt13.76□□□□□ -0.21
POP4P38336 RPP2BYDR382W 333 nt13.7□□□□□ -0.22
POP4P38336 SPT5YML010W 3192 nt13.67□□□□□ -0.22
POP4P38336 FIS1YIL065C 468 nt13.65□□□□□ -0.22
POP4P38336 DAL1YIR027C 1383 nt13.65□□□□□ -0.22
POP4P38336 FPR4YLR449W 1179 nt13.61□□□□□ -0.23
POP4P38336 INM2YDR287W 879 nt13.58□□□□□ -0.24
POP4P38336 SRB2YHR041C 633 nt13.53□□□□□ -0.24
POP4P38336 PHO4YFR034C 939 nt13.52□□□□□ -0.25
POP4P38336 YBL100CYBL100C 315 nt13.41□□□□□ -0.26
POP4P38336 BDH2YAL061W 1254 nt13.37□□□□□ -0.27
POP4P38336 YPS1YLR120C 1710 nt13.34□□□□□ -0.27
POP4P38336 MEP2YNL142W 1500 nt13.33□□□□□ -0.28
POP4P38336 SSA4YER103W 1929 nt13.31□□□□□ -0.28
POP4P38336 WWM1YFL010C 636 nt13.28□□□□□ -0.28
POP4P38336 SHU1YHL006C 453 nt13.26□□□□□ -0.29
POP4P38336 FUN26YAL022C 1554 nt13.24□□□□□ -0.29
POP4P38336 YDR095CYDR095C 411 nt13.22□□□□□ -0.29
POP4P38336 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.22□□□□□ -0.29
POP4P38336 LSM3YLR438C-A 270 nt13.16□□□□□ -0.3
POP4P38336 TRM9YML014W 840 nt13.16□□□□□ -0.3
POP4P38336 YGR021WYGR021W 873 nt13.15□□□□□ -0.3
POP4P38336 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.13□□□□□ -0.31
POP4P38336 ALF1YNL148C 765 nt13.11□□□□□ -0.31
POP4P38336 DCW1YKL046C 1350 nt13.1□□□□□ -0.31
POP4P38336 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.09□□□□□ -0.31
POP4P38336 YKL097CYKL097C 411 nt13.08□□□□□ -0.32
POP4P38336 HOM6YJR139C 1080 nt13.07□□□□□ -0.32
POP4P38336 CCT6YDR188W 1641 nt13.05□□□□□ -0.32
POP4P38336 MNP1YGL068W 585 nt12.97□□□□□ -0.33
POP4P38336 RPP2AYOL039W 321 nt12.97□□□□□ -0.33
POP4P38336 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.96□□□□□ -0.33
POP4P38336 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.96□□□□□ -0.33
POP4P38336 EMI2YDR516C 1503 nt12.94□□□□□ -0.34
POP4P38336 PTP1YDL230W 1008 nt12.94□□□□□ -0.34
POP4P38336 SIS1YNL007C 1059 nt12.91□□□□□ -0.34
POP4P38336 YMR090WYMR090W 684 nt12.89□□□□□ -0.35
POP4P38336 RKM5YLR137W 1104 nt12.88□□□□□ -0.35
POP4P38336 CAC2YML102W 1407 nt12.87□□□□□ -0.35
POP4P38336 YDL221WYDL221W 552 nt12.84□□□□□ -0.35
POP4P38336 BDF1YLR399C 2061 nt12.8□□□□□ -0.36
POP4P38336 YBR220CYBR220C 1683 nt12.78□□□□□ -0.36
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