RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W ASM4Q05166 528 aa3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YLH47Q06493 454 aa3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W ARR2Q06597 130 aa3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YDL073WQ07454 984 aa3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YOL057WQ08225 711 aa3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W TGL5Q12043 749 aa3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YOR022CQ12204 715 aa3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W TAF3Q12297 353 aa3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YPR071WQ12346 211 aa3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YBL111CQ3E7Y5 667 aa3.69□□□□□ -1.82
VFA1YER128W CDC37P06101 506 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W HNM1P19807 563 aa3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W TSR4P25040 408 aa3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W CCL1P37366 393 aa3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W HSM3P38348 480 aa3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W PEX18P38855 283 aa3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W RRP8P38961 392 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W SSB2P40150 613 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W SRB7P47822 140 aa3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W UBC11P52492 156 aa3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W DCP2P53550 970 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W NOG2P53742 486 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YMR102CQ03177 834 aa3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W INP2Q03824 705 aa3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W RNH1Q04740 348 aa3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W NSE3Q05541 303 aa3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W BUD4P47136 1447 aa3.68□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YPK9Q12697 1472 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W RPN13O13563 156 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W PRC1P00729 532 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W PCT1P13259 424 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W MRPS28P21771 286 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W PTR2P32901 601 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W MIC60P36112 540 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YBR284WP38150 797 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W SLX1P38324 304 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W CAJ1P39101 391 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YEL020CP39994 560 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W CCT7P42943 550 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W TIM54P47045 478 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W NNF1P47149 201 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W NIT3P49954 291 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YAP1802P53309 568 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W RPN4Q03465 531 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W KRE28Q04431 385 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W RSC3Q06639 885 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W ENV7Q12003 364 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W ENT1Q12518 454 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W ATG11Q12527 1178 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W RTP1Q12751 981 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W NUP145P49687 1317 aa3.67□□□□□ -1.82
VFA1YER128W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W TPM1P17536 199 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W MEF1P25039 761 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W SWC3P31376 625 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W EMP70P32802 667 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W SSO1P32867 290 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W BMH2P34730 273 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W UIP5P36137 443 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W REV7P38927 245 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W RIC1P40395 1056 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W PHB1P40961 287 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W ALG2P43636 503 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W RNH70P53331 553 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W ADA2Q02336 434 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YML108WQ03759 105 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W YMR018WQ04364 514 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W SML1Q04964 104 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W GRC3Q07845 632 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W CIR2Q08822 631 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W SFI1Q12369 946 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W MMS22Q06164 1454 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W TY1B-DR4Q07793 1604 aa3.66□□□□□ -1.82
VFA1YER128W TUF1P02992 437 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TEF1P02994 458 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TOM70P07213 617 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W HEM1P09950 548 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W DAL7P21826 554 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MCM3P24279 971 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W HIR1P32479 840 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W KAR9P32526 644 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W CSE1P33307 960 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PTH2P34222 208 aa3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W APL2P36000 726 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MIA40P36046 403 aa3.65□□□□□ -1.83
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