Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 NSR1YGR159C 1245 nt19.18■□□□□ 0.66
TAF3Q12297 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.74■□□□□ 0.59
TAF3Q12297 NOP1YDL014W 984 nt17.93■□□□□ 0.46
TAF3Q12297 MDJ1YFL016C 1536 nt17.7■□□□□ 0.42
TAF3Q12297 YJL027CYJL027C 417 nt16.28■□□□□ 0.2
TAF3Q12297 YKL036CYKL036C 393 nt15.89■□□□□ 0.13
TAF3Q12297 SRX1YKL086W 384 nt15.63■□□□□ 0.09
TAF3Q12297 Q0297Q0297 156 nt15.43■□□□□ 0.06
TAF3Q12297 DBP2YNL112W 1641 nt15.32■□□□□ 0.04
TAF3Q12297 YBR190WYBR190W 312 nt15.26■□□□□ 0.03
TAF3Q12297 SSA3YBL075C 1950 nt15.07■□□□□ 0
TAF3Q12297 RTC3YHR087W 336 nt14.94□□□□□ -0.02
TAF3Q12297 YCR051WYCR051W 669 nt14.83□□□□□ -0.04
TAF3Q12297 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.54□□□□□ -0.08
TAF3Q12297 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.54□□□□□ -0.08
TAF3Q12297 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.54□□□□□ -0.08
TAF3Q12297 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.54□□□□□ -0.08
TAF3Q12297 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.54□□□□□ -0.08
TAF3Q12297 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.54□□□□□ -0.08
TAF3Q12297 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.54□□□□□ -0.08
TAF3Q12297 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.54□□□□□ -0.08
TAF3Q12297 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.54□□□□□ -0.08
TAF3Q12297 CCC1YLR220W 969 nt14.44□□□□□ -0.1
TAF3Q12297 PUT4YOR348C 1884 nt14.35□□□□□ -0.11
TAF3Q12297 RVS167YDR388W 1449 nt14.33□□□□□ -0.11
TAF3Q12297 SCS3YGL126W 1143 nt14.09□□□□□ -0.15
TAF3Q12297 SCJ1YMR214W 1134 nt14.06□□□□□ -0.16
TAF3Q12297 ARE1YCR048W 1833 nt13.88□□□□□ -0.19
TAF3Q12297 POA1YBR022W 534 nt13.88□□□□□ -0.19
TAF3Q12297 RPP1BYDL130W 321 nt13.86□□□□□ -0.19
TAF3Q12297 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.76□□□□□ -0.21
TAF3Q12297 YOL085CYOL085C 342 nt13.76□□□□□ -0.21
TAF3Q12297 SAH1YER043C 1350 nt13.72□□□□□ -0.21
TAF3Q12297 BSC6YOL137W 1494 nt13.71□□□□□ -0.21
TAF3Q12297 URN1YPR152C 1398 nt13.7□□□□□ -0.22
TAF3Q12297 PKP1YIL042C 1185 nt13.68□□□□□ -0.22
TAF3Q12297 SHR5YOL110W 714 nt13.63□□□□□ -0.23
TAF3Q12297 OPI9YLR338W 858 nt13.62□□□□□ -0.23
TAF3Q12297 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.54□□□□□ -0.24
TAF3Q12297 DEP1YAL013W 1218 nt13.51□□□□□ -0.25
TAF3Q12297 SPT5YML010W 3192 nt13.46□□□□□ -0.25
TAF3Q12297 BUD23YCR047C 828 nt13.42□□□□□ -0.26
TAF3Q12297 SSA4YER103W 1929 nt13.41□□□□□ -0.26
TAF3Q12297 RPN10YHR200W 807 nt13.36□□□□□ -0.27
TAF3Q12297 PET122YER153C 765 nt13.33□□□□□ -0.28
TAF3Q12297 PUN1YLR414C 792 nt13.23□□□□□ -0.29
TAF3Q12297 YNL208WYNL208W 600 nt13.2□□□□□ -0.3
TAF3Q12297 PTC2YER089C 1395 nt13.2□□□□□ -0.3
TAF3Q12297 NAB2YGL122C 1578 nt13.11□□□□□ -0.31
TAF3Q12297 YDJ1YNL064C 1230 nt13.09□□□□□ -0.31
TAF3Q12297 YJR018WYJR018W 363 nt13.03□□□□□ -0.32
TAF3Q12297 SCR1SCR1 522 nt13.03□□□□□ -0.32
TAF3Q12297 GAR1YHR089C 618 nt12.94□□□□□ -0.34
TAF3Q12297 MEP2YNL142W 1500 nt12.93□□□□□ -0.34
TAF3Q12297 BDF1YLR399C 2061 nt12.92□□□□□ -0.34
TAF3Q12297 RRN5YLR141W 1092 nt12.87□□□□□ -0.35
TAF3Q12297 FIS1YIL065C 468 nt12.83□□□□□ -0.36
TAF3Q12297 FPR4YLR449W 1179 nt12.82□□□□□ -0.36
TAF3Q12297 DAL1YIR027C 1383 nt12.81□□□□□ -0.36
TAF3Q12297 TAT1YBR069C 1860 nt12.74□□□□□ -0.37
TAF3Q12297 DCW1YKL046C 1350 nt12.71□□□□□ -0.37
TAF3Q12297 PHO4YFR034C 939 nt12.69□□□□□ -0.38
TAF3Q12297 YPS1YLR120C 1710 nt12.67□□□□□ -0.38
TAF3Q12297 INM2YDR287W 879 nt12.64□□□□□ -0.39
TAF3Q12297 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.62□□□□□ -0.39
TAF3Q12297 YJR120WYJR120W 351 nt12.62□□□□□ -0.39
TAF3Q12297 RPP2BYDR382W 333 nt12.61□□□□□ -0.39
TAF3Q12297 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.6□□□□□ -0.39
TAF3Q12297 YMR090WYMR090W 684 nt12.55□□□□□ -0.4
TAF3Q12297 EMI2YDR516C 1503 nt12.54□□□□□ -0.4
TAF3Q12297 TIR1YER011W 765 nt12.53□□□□□ -0.4
TAF3Q12297 YBR220CYBR220C 1683 nt12.51□□□□□ -0.41
TAF3Q12297 SSA1YAL005C 1929 nt12.49□□□□□ -0.41
TAF3Q12297 PAC11YDR488C 1602 nt12.49□□□□□ -0.41
TAF3Q12297 YDR095CYDR095C 411 nt12.48□□□□□ -0.41
TAF3Q12297 YBL100CYBL100C 315 nt12.43□□□□□ -0.42
TAF3Q12297 RSB1YOR049C 1065 nt12.43□□□□□ -0.42
TAF3Q12297 ATS1YAL020C 1002 nt12.39□□□□□ -0.43
TAF3Q12297 YDL221WYDL221W 552 nt12.37□□□□□ -0.43
TAF3Q12297 NVJ2YPR091C 2313 nt12.36□□□□□ -0.43
TAF3Q12297 SDH1YKL148C 1923 nt12.35□□□□□ -0.43
TAF3Q12297 CAC2YML102W 1407 nt12.29□□□□□ -0.44
TAF3Q12297 FPS1YLL043W 2010 nt12.28□□□□□ -0.44
TAF3Q12297 RPP2AYOL039W 321 nt12.26□□□□□ -0.45
TAF3Q12297 ALF1YNL148C 765 nt12.25□□□□□ -0.45
TAF3Q12297 PTP1YDL230W 1008 nt12.24□□□□□ -0.45
TAF3Q12297 FUN26YAL022C 1554 nt12.24□□□□□ -0.45
TAF3Q12297 PCH2YBR186W 1695 nt12.22□□□□□ -0.45
TAF3Q12297 BDH2YAL061W 1254 nt12.2□□□□□ -0.46
TAF3Q12297 SEC11YIR022W 504 nt12.19□□□□□ -0.46
TAF3Q12297 SCC4YER147C 1875 nt12.19□□□□□ -0.46
TAF3Q12297 GUT2YIL155C 1950 nt12.16□□□□□ -0.46
TAF3Q12297 SRB2YHR041C 633 nt12.12□□□□□ -0.47
TAF3Q12297 TRM9YML014W 840 nt12.11□□□□□ -0.47
TAF3Q12297 IRC15YPL017C 1500 nt12.09□□□□□ -0.47
TAF3Q12297 GIS3YLR094C 1509 nt12.04□□□□□ -0.48
TAF3Q12297 SIS1YNL007C 1059 nt12.01□□□□□ -0.49
TAF3Q12297 YSC84YHR016C 1407 nt11.99□□□□□ -0.49
TAF3Q12297 CCT6YDR188W 1641 nt11.98□□□□□ -0.49
TAF3Q12297 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.97□□□□□ -0.49
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