Protein–RNA interactions for Protein: Q12514

NOT5, General negative regulator of transcription subunit 5, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOT5Q12514 NSR1YGR159C 1245 nt20.12■□□□□ 0.81
NOT5Q12514 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.99■□□□□ 0.79
NOT5Q12514 NOP1YDL014W 984 nt19.17■□□□□ 0.66
NOT5Q12514 MDJ1YFL016C 1536 nt18.38■□□□□ 0.53
NOT5Q12514 YKL036CYKL036C 393 nt17.33■□□□□ 0.36
NOT5Q12514 YJL027CYJL027C 417 nt16.88■□□□□ 0.29
NOT5Q12514 SRX1YKL086W 384 nt16.75■□□□□ 0.27
NOT5Q12514 Q0297Q0297 156 nt16.63■□□□□ 0.25
NOT5Q12514 DBP2YNL112W 1641 nt16.03■□□□□ 0.16
NOT5Q12514 YCR051WYCR051W 669 nt15.94■□□□□ 0.14
NOT5Q12514 YBR190WYBR190W 312 nt15.68■□□□□ 0.1
NOT5Q12514 SCS3YGL126W 1143 nt15.58■□□□□ 0.08
NOT5Q12514 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.41■□□□□ 0.06
NOT5Q12514 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.41■□□□□ 0.06
NOT5Q12514 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.41■□□□□ 0.06
NOT5Q12514 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.41■□□□□ 0.06
NOT5Q12514 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.41■□□□□ 0.06
NOT5Q12514 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.41■□□□□ 0.06
NOT5Q12514 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.41■□□□□ 0.06
NOT5Q12514 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.41■□□□□ 0.06
NOT5Q12514 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.41■□□□□ 0.06
NOT5Q12514 RTC3YHR087W 336 nt15.39■□□□□ 0.05
NOT5Q12514 CCC1YLR220W 969 nt15.33■□□□□ 0.04
NOT5Q12514 YOL085CYOL085C 342 nt15.04■□□□□ -0
NOT5Q12514 RVS167YDR388W 1449 nt14.95□□□□□ -0.02
NOT5Q12514 RPP1BYDL130W 321 nt14.95□□□□□ -0.02
NOT5Q12514 PKP1YIL042C 1185 nt14.94□□□□□ -0.02
NOT5Q12514 SCJ1YMR214W 1134 nt14.86□□□□□ -0.03
NOT5Q12514 SSA3YBL075C 1950 nt14.73□□□□□ -0.05
NOT5Q12514 PUT4YOR348C 1884 nt14.58□□□□□ -0.08
NOT5Q12514 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.46□□□□□ -0.09
NOT5Q12514 PET122YER153C 765 nt14.38□□□□□ -0.11
NOT5Q12514 SHR5YOL110W 714 nt14.34□□□□□ -0.11
NOT5Q12514 URN1YPR152C 1398 nt14.23□□□□□ -0.13
NOT5Q12514 ARE1YCR048W 1833 nt14.2□□□□□ -0.14
NOT5Q12514 DEP1YAL013W 1218 nt14.18□□□□□ -0.14
NOT5Q12514 SAH1YER043C 1350 nt14.15□□□□□ -0.14
NOT5Q12514 POA1YBR022W 534 nt14.15□□□□□ -0.14
NOT5Q12514 OPI9YLR338W 858 nt14.08□□□□□ -0.16
NOT5Q12514 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.07□□□□□ -0.16
NOT5Q12514 SCR1SCR1 522 nt14.06□□□□□ -0.16
NOT5Q12514 YDJ1YNL064C 1230 nt13.95□□□□□ -0.18
NOT5Q12514 RRN5YLR141W 1092 nt13.92□□□□□ -0.18
NOT5Q12514 BSC6YOL137W 1494 nt13.91□□□□□ -0.18
NOT5Q12514 RPN10YHR200W 807 nt13.88□□□□□ -0.19
NOT5Q12514 YNL208WYNL208W 600 nt13.81□□□□□ -0.2
NOT5Q12514 GAR1YHR089C 618 nt13.79□□□□□ -0.2
NOT5Q12514 ATS1YAL020C 1002 nt13.79□□□□□ -0.2
NOT5Q12514 BUD23YCR047C 828 nt13.74□□□□□ -0.21
NOT5Q12514 PUN1YLR414C 792 nt13.66□□□□□ -0.22
NOT5Q12514 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.63□□□□□ -0.23
NOT5Q12514 PTC2YER089C 1395 nt13.61□□□□□ -0.23
NOT5Q12514 YJR018WYJR018W 363 nt13.54□□□□□ -0.24
NOT5Q12514 RSB1YOR049C 1065 nt13.53□□□□□ -0.24
NOT5Q12514 SPT5YML010W 3192 nt13.44□□□□□ -0.26
NOT5Q12514 NAB2YGL122C 1578 nt13.44□□□□□ -0.26
NOT5Q12514 TIR1YER011W 765 nt13.31□□□□□ -0.28
NOT5Q12514 YJR120WYJR120W 351 nt13.27□□□□□ -0.29
NOT5Q12514 FIS1YIL065C 468 nt13.25□□□□□ -0.29
NOT5Q12514 SSA1YAL005C 1929 nt13.25□□□□□ -0.29
NOT5Q12514 FPR4YLR449W 1179 nt13.24□□□□□ -0.29
NOT5Q12514 SSA4YER103W 1929 nt13.23□□□□□ -0.29
NOT5Q12514 DAL1YIR027C 1383 nt13.2□□□□□ -0.3
NOT5Q12514 RPP2BYDR382W 333 nt13.13□□□□□ -0.31
NOT5Q12514 PHO4YFR034C 939 nt13.1□□□□□ -0.31
NOT5Q12514 INM2YDR287W 879 nt13.06□□□□□ -0.32
NOT5Q12514 MEP2YNL142W 1500 nt13.06□□□□□ -0.32
NOT5Q12514 SRB2YHR041C 633 nt13.01□□□□□ -0.33
NOT5Q12514 YPS1YLR120C 1710 nt12.96□□□□□ -0.34
NOT5Q12514 YBL100CYBL100C 315 nt12.92□□□□□ -0.34
NOT5Q12514 DCW1YKL046C 1350 nt12.91□□□□□ -0.34
NOT5Q12514 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.89□□□□□ -0.35
NOT5Q12514 PST2YDR032C 597 nt12.83□□□□□ -0.36
NOT5Q12514 YDR095CYDR095C 411 nt12.82□□□□□ -0.36
NOT5Q12514 BDH2YAL061W 1254 nt12.79□□□□□ -0.36
NOT5Q12514 FUN26YAL022C 1554 nt12.76□□□□□ -0.37
NOT5Q12514 BDF1YLR399C 2061 nt12.71□□□□□ -0.37
NOT5Q12514 EMI2YDR516C 1503 nt12.7□□□□□ -0.38
NOT5Q12514 WWM1YFL010C 636 nt12.68□□□□□ -0.38
NOT5Q12514 ALF1YNL148C 765 nt12.67□□□□□ -0.38
NOT5Q12514 TRM9YML014W 840 nt12.64□□□□□ -0.39
NOT5Q12514 CAC2YML102W 1407 nt12.6□□□□□ -0.39
NOT5Q12514 PTP1YDL230W 1008 nt12.59□□□□□ -0.39
NOT5Q12514 YMR090WYMR090W 684 nt12.59□□□□□ -0.39
NOT5Q12514 RPP2AYOL039W 321 nt12.59□□□□□ -0.39
NOT5Q12514 PAC11YDR488C 1602 nt12.57□□□□□ -0.4
NOT5Q12514 YBR220CYBR220C 1683 nt12.57□□□□□ -0.4
NOT5Q12514 YDL221WYDL221W 552 nt12.55□□□□□ -0.4
NOT5Q12514 TAT1YBR069C 1860 nt12.54□□□□□ -0.4
NOT5Q12514 LSM3YLR438C-A 270 nt12.52□□□□□ -0.41
NOT5Q12514 CCT6YDR188W 1641 nt12.5□□□□□ -0.41
NOT5Q12514 NVJ2YPR091C 2313 nt12.48□□□□□ -0.41
NOT5Q12514 SHU1YHL006C 453 nt12.46□□□□□ -0.41
NOT5Q12514 SDH1YKL148C 1923 nt12.46□□□□□ -0.42
NOT5Q12514 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.45□□□□□ -0.42
NOT5Q12514 SIS1YNL007C 1059 nt12.44□□□□□ -0.42
NOT5Q12514 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.43□□□□□ -0.42
NOT5Q12514 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.43□□□□□ -0.42
NOT5Q12514 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.42□□□□□ -0.42
NOT5Q12514 YGR021WYGR021W 873 nt12.4□□□□□ -0.42
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