RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W HRD3Q05787 833 aa9.56□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W TRE1Q08919 783 aa9.56□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W ECM3Q99252 613 aa9.56□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W TFB1P32776 642 aa9.55□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W SGE1P33335 543 aa9.55□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W PFD1P46988 109 aa9.55□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W VTC4P47075 721 aa9.55□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W COQ6P53318 479 aa9.55□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W SMA1Q02651 245 aa9.55□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa9.55□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W HSF1P10961 833 aa9.54□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W YMC2P38087 329 aa9.54□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W MND1P53102 219 aa9.54□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W FLC3P53121 802 aa9.54□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W HRQ1Q05549 1077 aa9.54□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W COG4Q06096 861 aa9.54□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W YOL075CQ08234 1294 aa9.54□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W LCB4Q12246 624 aa9.54□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W ENO2P00925 437 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W KEX1P09620 729 aa9.53□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W STE13P33894 931 aa9.53□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W YKT6P36015 200 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W SAP190P36123 1033 aa9.53□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W DUN1P39009 513 aa9.53□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W YPL062WQ02781 134 aa9.53□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W PIR3Q03180 325 aa9.53□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W SRX1P36077 127 aa9.52□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W BAT1P38891 393 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W HFM1P51979 1187 aa9.52□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W RSC1P53236 928 aa9.52□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W DRN1P53255 507 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W LSC2P53312 427 aa9.52□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W VPS54Q12071 889 aa9.52□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W SPO21Q12411 609 aa9.52□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W PSO2P30620 661 aa9.51□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W CCR4P31384 837 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W CDC11P32458 415 aa9.51□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W UTH1P36135 365 aa9.51□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W YBR053CP38235 358 aa9.51□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W BCD1P38772 366 aa9.51□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W PSY2P40164 858 aa9.51□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W YJR061WP40355 935 aa9.51□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W PYK2P52489 506 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W VEL1P53058 206 aa9.51□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W JIP3O13555 125 aa9.5□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W CSG2P35206 410 aa9.5□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data9.5□□□□□ -0.89not detected
CPD1YGR247W YLR297WQ05899 129 aa9.5□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W OPT2Q06593 877 aa9.5□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W PMT7Q06644 662 aa9.5□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W MDM38Q08179 573 aa9.5□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W SVS1Q12254 260 aa9.5□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W CCP1P00431 361 aa9.49□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W UBP7P40453 1071 aa9.49□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W PEX13P80667 386 aa9.49□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W YMR206WQ03695 313 aa9.49□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W ARO80Q04052 950 aa9.49□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W TAF9Q05027 157 aa9.49□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W RAD3P06839 778 aa9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W AEP2P22136 580 aa9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W DAL2P25335 343 aa9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W DYS1P38791 387 aa9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W RPT2P40327 437 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W ASG7P46993 209 aa9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W YPT11P48559 417 aa9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W YGR237CP50089 785 aa9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W YAT1P80235 687 aa9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W ARP7Q12406 477 aa9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W TRS33Q99394 268 aa9.48□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W YER152CP10356 443 aa9.47□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W ARF2P19146 181 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W APL1P27351 700 aa9.47□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W CAP1P28495 268 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W WSC4P38739 605 aa9.47□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W CRP1P38845 465 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W YJR079WP47126 109 aa9.47□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W COP1P53622 1201 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W AFT2Q08957 416 aa9.47□□□□□ -0.89
CPD1YGR247W RML2P32611 393 aa9.46□□□□□ -0.9
CPD1YGR247W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CPD1YGR247W STS1P38637 319 aa9.46□□□□□ -0.9
CPD1YGR247W OCA5P38738 679 aa9.46□□□□□ -0.9
CPD1YGR247W EXO1P39875 702 aa9.46□□□□□ -0.9
CPD1YGR247W PRK1P40494 810 aa9.46□□□□□ -0.9
CPD1YGR247W YAP5P40574 245 aa9.46□□□□□ -0.9
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